腸道病毒71型基因分析、病毒拯救、毒力及免疫原性的比較研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-24 12:29
近年來,手足口。╤and, foot and mouth disease, HFMD)在我國呈高發(fā)態(tài)勢,腸道病毒71型(enterovirus71, EV71)是其主要病原體之一,尤其重癥HFMD患者大多由EV71感染所致[1]。深入研究EV71的毒力和致病機(jī)理,對于HFMD的防治有著極其重要意義[2,3]。我們從HFMD重癥患者咽拭子標(biāo)本中分離EV71毒株,通過基因序列分析、病毒拯救等研究,分析比較分離病毒的毒力和免疫原性,為今后EV71動(dòng)物模型的構(gòu)建、EV71致病機(jī)理和疫苗的研究打下了基礎(chǔ)。本研究從2名臨床確診HFMD并出現(xiàn)嚴(yán)重神經(jīng)系統(tǒng)癥狀患兒的咽拭子標(biāo)本中分離到2株病毒,經(jīng)核酸分析和美國ATCC腸道病毒標(biāo)準(zhǔn)血清中和實(shí)驗(yàn),確定為EV71。通過空斑實(shí)驗(yàn),克隆得到兩株EV71病毒,分別命名為EV71-961和EV71-102。經(jīng)腸道病毒VP1區(qū)通用引物擴(kuò)增后,序列分析初步確定兩株分離病毒均為EV71C4亞型。病毒全基因序列分析顯示:兩株病毒基因組全長(不含polyA尾)均為7407nt;EV71-961全基因序列與Chongqing3-09-China(Genbank Number:...
【文章來源】:中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
EV71病毒基因組示意圖
、實(shí)驗(yàn)材料、 細(xì)胞和 EV71 標(biāo)本.1 細(xì)胞:Vero 細(xì)胞由本室保存。.2 EV71 標(biāo)本:2008 年湖南一名 3 歲和 2009 年湖南一名 1 歲均出現(xiàn)嚴(yán)重的手足口病患兒咽拭子標(biāo)本。、 載體、引物及感受態(tài)菌.1 載體.1.1 平端克隆載體:克隆載體質(zhì)粒pEASYTM-Blunt Zero Vector(圖1.2),載體,專為連接PCR高保真Taq酶(pfu酶)擴(kuò)增的產(chǎn)物片段而設(shè)計(jì)。該載殺基因表達(dá)與否篩選陽性重組子。當(dāng)載體與目的片段連接成功,載體自帶無法正確表達(dá),包含重組子的細(xì)胞可以正常生長;當(dāng)載體與目的片段連殺基因可以正確表達(dá),包含載體的細(xì)胞則無法生長,即“Zero”背景。該長片段克隆,且含氨芐青霉素、卡那霉素兩種篩選標(biāo)記。
圖1.3 克隆載體 pEASY-T3 圖譜2.2 引物合成:參照分離株VP1測序結(jié)果,經(jīng)Genbank序列比對確定為EV71 C4亞型,依據(jù)Genbank中C4序列保守區(qū),使用Lasergene軟件設(shè)計(jì)4條全基因擴(kuò)增引物、4條EV71特異性鑒定引物、2條EV71 VP1區(qū)通用引物、1條逆轉(zhuǎn)錄引物(表1.1)。引物由Invitrogen公司合成。引物1F 5’端引入限制性酶切位點(diǎn)和T7RNA聚合酶啟動(dòng)子序列,1R的5’端引入限制性酶切位點(diǎn),2R 5’端引入限制性酶切位點(diǎn)和26個(gè)堿基T(表1.1)。表1.1 病毒分離株全基因擴(kuò)增引物擴(kuò)增片段名稱及位置 名稱 序列 酶切位點(diǎn)A段1-3778 1F5’-AGGCGGATCGAT TAATACGACTCACTATAGTAAAACACCCTGTGGGTTGCACC-3’ClaⅠ1R 5’-GCGGCCGCACCACAAGAGGTCCCTGACGTCT-3’ NotⅠB段 3342-7424 2F 5’-AGTCTGGGGCCATTTATGTGGGCAACTTTA-3’2R5’-GCGGCCGC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTGCTATTCTGGTTATAAC-3’NotⅠ逆轉(zhuǎn)錄引物 oligdT26 5’-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-3’鑒定引物732-1474 JD1F 5’-CAGCTAAACATGGGTTCG-3’JD1R 5’-ATACCAGCATCAAGCACG-3’鑒定引物5008-5735 JD2F 5’-GGGAATACAGCAATAGGTCCG-3’JD2R 5’-TGATGGCATGTGCTCTGTG-3’通用引物2367-2386 VP1-F3 5’-GCAGCCCAAAAGAATTTCAC-3’通用引物3346-3365 VP1-R3 5’-CACATAAATRGCCCCAGACT-3’注:序列下劃線為 T7RNA 聚合酶啟動(dòng)子序列,斜體為酶切位點(diǎn)序?
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腸道病毒71型基因重組的研究進(jìn)展[J]. 姚昕,梁爭論. 中國生物制品學(xué)雜志. 2013(03)
[2]陽離子脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染效率影響因素的研究進(jìn)展[J]. 黃柯鑫,趙斌. 醫(yī)學(xué)理論與實(shí)踐. 2012(14)
[3]北京市2010年手足口病死亡危險(xiǎn)因素分析[J]. 李錫太,劉白薇,賈蕾,黎新宇,曲梅,李潔,李爽,吳曉娜,高志勇,黃芳,王全意. 中華疾病控制雜志. 2012(05)
[4]不同EV71毒株的免疫保護(hù)差異性研究[J]. 汪穎,葉祥忠,李娟,賈繼宗,韓金樂,李艷,李益民,游松. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2010 (10)
[5]2008年中國手足口病流行特征分析[J]. 王琦,王子軍. 疾病監(jiān)測. 2010(03)
[6]腸道病毒71型的研究進(jìn)展[J]. 周世力,楊帆,金奇. 病毒學(xué)報(bào). 2003(03)
[7]手足口病流行特點(diǎn)及其防治[J]. 何家鑫,沈曉娜. 海峽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2001(03)
[8]三種不同轉(zhuǎn)染方法拯救病毒的比較研究[J]. 侯俊,羅生棟,胡燕,沈宏輝,白冰珂,柴燕濤,王志杰,貌盼勇. 中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志. 2013 (06)
本文編號(hào):3097725
【文章來源】:中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
EV71病毒基因組示意圖
、實(shí)驗(yàn)材料、 細(xì)胞和 EV71 標(biāo)本.1 細(xì)胞:Vero 細(xì)胞由本室保存。.2 EV71 標(biāo)本:2008 年湖南一名 3 歲和 2009 年湖南一名 1 歲均出現(xiàn)嚴(yán)重的手足口病患兒咽拭子標(biāo)本。、 載體、引物及感受態(tài)菌.1 載體.1.1 平端克隆載體:克隆載體質(zhì)粒pEASYTM-Blunt Zero Vector(圖1.2),載體,專為連接PCR高保真Taq酶(pfu酶)擴(kuò)增的產(chǎn)物片段而設(shè)計(jì)。該載殺基因表達(dá)與否篩選陽性重組子。當(dāng)載體與目的片段連接成功,載體自帶無法正確表達(dá),包含重組子的細(xì)胞可以正常生長;當(dāng)載體與目的片段連殺基因可以正確表達(dá),包含載體的細(xì)胞則無法生長,即“Zero”背景。該長片段克隆,且含氨芐青霉素、卡那霉素兩種篩選標(biāo)記。
圖1.3 克隆載體 pEASY-T3 圖譜2.2 引物合成:參照分離株VP1測序結(jié)果,經(jīng)Genbank序列比對確定為EV71 C4亞型,依據(jù)Genbank中C4序列保守區(qū),使用Lasergene軟件設(shè)計(jì)4條全基因擴(kuò)增引物、4條EV71特異性鑒定引物、2條EV71 VP1區(qū)通用引物、1條逆轉(zhuǎn)錄引物(表1.1)。引物由Invitrogen公司合成。引物1F 5’端引入限制性酶切位點(diǎn)和T7RNA聚合酶啟動(dòng)子序列,1R的5’端引入限制性酶切位點(diǎn),2R 5’端引入限制性酶切位點(diǎn)和26個(gè)堿基T(表1.1)。表1.1 病毒分離株全基因擴(kuò)增引物擴(kuò)增片段名稱及位置 名稱 序列 酶切位點(diǎn)A段1-3778 1F5’-AGGCGGATCGAT TAATACGACTCACTATAGTAAAACACCCTGTGGGTTGCACC-3’ClaⅠ1R 5’-GCGGCCGCACCACAAGAGGTCCCTGACGTCT-3’ NotⅠB段 3342-7424 2F 5’-AGTCTGGGGCCATTTATGTGGGCAACTTTA-3’2R5’-GCGGCCGC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTGCTATTCTGGTTATAAC-3’NotⅠ逆轉(zhuǎn)錄引物 oligdT26 5’-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-3’鑒定引物732-1474 JD1F 5’-CAGCTAAACATGGGTTCG-3’JD1R 5’-ATACCAGCATCAAGCACG-3’鑒定引物5008-5735 JD2F 5’-GGGAATACAGCAATAGGTCCG-3’JD2R 5’-TGATGGCATGTGCTCTGTG-3’通用引物2367-2386 VP1-F3 5’-GCAGCCCAAAAGAATTTCAC-3’通用引物3346-3365 VP1-R3 5’-CACATAAATRGCCCCAGACT-3’注:序列下劃線為 T7RNA 聚合酶啟動(dòng)子序列,斜體為酶切位點(diǎn)序?
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腸道病毒71型基因重組的研究進(jìn)展[J]. 姚昕,梁爭論. 中國生物制品學(xué)雜志. 2013(03)
[2]陽離子脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染效率影響因素的研究進(jìn)展[J]. 黃柯鑫,趙斌. 醫(yī)學(xué)理論與實(shí)踐. 2012(14)
[3]北京市2010年手足口病死亡危險(xiǎn)因素分析[J]. 李錫太,劉白薇,賈蕾,黎新宇,曲梅,李潔,李爽,吳曉娜,高志勇,黃芳,王全意. 中華疾病控制雜志. 2012(05)
[4]不同EV71毒株的免疫保護(hù)差異性研究[J]. 汪穎,葉祥忠,李娟,賈繼宗,韓金樂,李艷,李益民,游松. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2010 (10)
[5]2008年中國手足口病流行特征分析[J]. 王琦,王子軍. 疾病監(jiān)測. 2010(03)
[6]腸道病毒71型的研究進(jìn)展[J]. 周世力,楊帆,金奇. 病毒學(xué)報(bào). 2003(03)
[7]手足口病流行特點(diǎn)及其防治[J]. 何家鑫,沈曉娜. 海峽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2001(03)
[8]三種不同轉(zhuǎn)染方法拯救病毒的比較研究[J]. 侯俊,羅生棟,胡燕,沈宏輝,白冰珂,柴燕濤,王志杰,貌盼勇. 中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志. 2013 (06)
本文編號(hào):3097725
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