腦膜炎奈瑟球菌是一種時(shí)常附著在人類鼻咽部的共生菌,同時(shí)也是引起腦膜炎的主要原因。全球性腦膜炎的爆發(fā)非常危險(xiǎn),在一些國(guó)家中,死亡率有時(shí)會(huì)達(dá)到10%。由于腦膜炎病情發(fā)展迅速,提前的預(yù)防治療變得非常重要,這使得研究者將大量精力放在腦膜炎疫苗的開發(fā)上。腦膜炎奈瑟球菌的外膜蛋白常與細(xì)菌毒性相關(guān),由于其時(shí)常暴露于細(xì)胞外膜上,也使之成為腦膜炎疫苗研發(fā)的潛在依據(jù)。為此,一大批腦膜炎球菌的外膜蛋白被發(fā)現(xiàn)和研究,其中就包括了NMB0315蛋白。NMB0315是一種B群腦膜炎球菌的外膜蛋白,盡管關(guān)于其功能的研究較少,但是通過序列的相似性比較,發(fā)現(xiàn)它是一種lysostaphin類肽酶,屬于M23金屬肽酶超家族。這個(gè)家族的蛋白成員被認(rèn)為是鋅離子依賴的肽酶,具有水解富含甘氨酸的多肽的功能。它們常存在于各種革蘭氏陽性及陰性細(xì)菌中,依靠其肽酶的活性,參與到細(xì)胞生長(zhǎng)、分裂以及一些細(xì)菌毒性相關(guān)的生理活動(dòng)中。到目前為止,通過晶體學(xué)的手段,研究者們已經(jīng)獲得了一些lysostaphin類蛋白的三維結(jié)構(gòu)。盡管它們?cè)阡\離子結(jié)合的活性位點(diǎn)上相對(duì)保守,但是其整體結(jié)構(gòu)上的差異,還是讓人們對(duì)于它們?cè)诓煌?xì)菌中的功能意義產(chǎn)生疑問。同時(shí),一些... 

【文章來源】：南開大學(xué)天津市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：138 頁

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

腦膜炎球菌外膜結(jié)構(gòu)及外膜蛋白

的loop區(qū)域恰好嵌合入目標(biāo)分子的底物結(jié)合“溝”；而這個(gè)嵌入的部分包含了三個(gè)連續(xù)的甘氨酸，與催化核心的鋅離子臨近（如圖1.9)。這個(gè)“巧合”也許正是模擬了底物進(jìn)入酶活中心的方式，為研究lysostaphin類肽酶與底物相互作用提供了一定結(jié)構(gòu)上的幫助。圖1.9兩種晶型中的甘氨酸loop嵌入底物結(jié)合“溝”LytM并不是唯一在晶體結(jié)構(gòu)中被觀察到的處于非活性狀態(tài)的lysostaphin肽酶，另外一個(gè)例子是霍亂弧菌CVibfio cho丨era)中的lysostaphin蛋白（P01) [73]。P01在晶體結(jié)構(gòu)中包含有三個(gè)獨(dú)立的結(jié)構(gòu)域，其中第三個(gè)結(jié)構(gòu)域?yàn)榇呋Y(jié)構(gòu)域，在結(jié)構(gòu)上非常保守，對(duì)應(yīng)于其它lysostaphin的活性結(jié)構(gòu)域(如處于激活態(tài)的LytM片段)，如圖1.10。含有鋅離子的催化核心與LytM高度一致，但是對(duì)應(yīng)于全長(zhǎng)LytM中N117的位置被一個(gè)水分子所取代?

出具有相同相位、頻率和波長(zhǎng)的次生電磁波，即發(fā)生衍射。由于晶體中的原具有高度的有序性，當(dāng)衍射角、X射線波長(zhǎng)與原子間距離滿足布拉格定律時(shí)，原子的衍射光會(huì)發(fā)生干涉而加強(qiáng)，從而形成特殊的衍射圖樣。通過收集衍射樣中各衍射點(diǎn)的位置和強(qiáng)度，能夠最終分析得出晶體中蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)（如 2.4)。


本文編號(hào)：3042575