第一部分：Ubig/Coq3家族蛋白膜結(jié)合特性的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究泛醌,又稱為輔酶Q。它是一種具備氧化還原性的磷脂,普遍存在于原核生物的細(xì)胞質(zhì)膜和真核生物的線粒體內(nèi)膜。無論是在原核生物還是在真核生物中,泛醌最主要的作用都是在呼吸鏈中作為電子的載體。另外,泛醌與人類的各種疾病都是息息相關(guān)的,例如癌癥,神經(jīng)退行性疾病和帕金森綜合癥等。Ubig/Coq3家族是一類SAM依賴的O-甲基轉(zhuǎn)移酶,負(fù)責(zé)催化泛醌合成過程中的二步甲基轉(zhuǎn)移反應(yīng)。在泛醌合成過程中,首先,UbiA/Coq2催化異戊二烯基焦磷酸脂與芳香族羥基苯基酸進(jìn)行縮合反應(yīng),然后苯醌環(huán)再進(jìn)行各種修飾,包括C-甲基化,脫羧化,O-甲基化和羥基化。正如我們了解的,UbiA/Coq2是一類含有多跨膜區(qū)的膜蛋白,負(fù)責(zé)在磷脂上催化異戊烯的轉(zhuǎn)移反應(yīng)。那么,Ubig/Coq3家族蛋白是如何錨定到生物膜上并催化甲基轉(zhuǎn)移反應(yīng)卻是并不清楚的。在本論文中,我們首次揭示Ubig/Coq3家族蛋白具備膜結(jié)合能力,能夠直接性的結(jié)合原核生物的細(xì)胞質(zhì)膜和真核生物的線粒體膜。與一型的S-腺甘基甲硫氨酸依賴的甲基轉(zhuǎn)移酶相比,Ubig擁有一段獨(dú)特的插入序列。這段富含堿性和疏水氨基酸... 

【文章來源】：中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)安徽省 211工程院校 985工程院校

【文章頁數(shù)】：128 頁

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一篇 Ubig/Coq3家族蛋白的膜結(jié)合特性及結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究
    第1章 綜述：泛醌合成途徑中氧甲基轉(zhuǎn)移酶Ubig/Coq3家族蛋白的研究進(jìn)展
        1.1.1 泛醌概述
        1.1.2 泛醌在生物體內(nèi)的功能
        1.1.3 泛醌在原核生物內(nèi)的合成途徑
        1.1.4 泛醌在真核生物內(nèi)的合成途徑
        1.1.5 SAM-依賴的甲基轉(zhuǎn)移酶簡(jiǎn)介
        1.1.6 Ubig/Coq3一種Ⅰ型的SAM-依賴的甲基轉(zhuǎn)移酶
    第2章 實(shí)驗(yàn)材料和方法
        1.2.1 基因克隆和質(zhì)粒構(gòu)建
        1.2.2 Ubig/Coq3家族蛋白及其突變體的表達(dá)、純化
        1.2.3 結(jié)晶、數(shù)據(jù)收集
        1.2.4 脂質(zhì)體制備和磷脂結(jié)合實(shí)驗(yàn)
        1.2.5 等溫滴量熱反應(yīng)實(shí)驗(yàn)（ITC）
        1.2.6 大腸桿菌ubig敲除株的構(gòu)建,半定量生長(zhǎng)表型和生長(zhǎng)曲線的測(cè)定
    第3章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果和討論
        1.3.1 Ubig蛋白的結(jié)構(gòu)解析
        1.3.2 Ubig的模型質(zhì)量分析
        1.3.3 Ubig的整體結(jié)構(gòu)
        1.3.4 Ubig/Coq3的膜結(jié)合能力
        1.3.5 Ubig/Coq3的膜結(jié)合特異性
        1.3.6 Ubig的膜結(jié)合區(qū)域
        1.3.7 人源Coq3膜結(jié)合區(qū)的鑒定
        1.3.8 大腸桿菌Ubig膜結(jié)合特性在體內(nèi)的研究
        1.3.9 大腸桿菌Ubig蛋白的甲基供體SAM的進(jìn)出孔道
        1.3.10 大腸桿菌Ubig甲基供體附近的保守區(qū)α螺旋6
        1.3.11 討論
    本篇小結(jié)
    本篇參考文獻(xiàn)
第二篇 抗體6C2中和蓖麻毒素Ricin的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究
    第1章 綜述：蓖麻毒素Ricin的致毒機(jī)理和免疫治療
        2.1.1 蓖麻毒素Ricin的毒性及其三維結(jié)構(gòu)
        2.1.2 蓖麻毒素Ricin的胞內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)過程
        2.1.3 核糖體蛋白影響蓖麻毒素Ricin的毒性
        2.1.4 蓖麻毒素Ricin的抗體研究進(jìn)展
        2.1.5 蓖麻毒素Ricin的抗體中和機(jī)制
        2.1.6 單克隆抗體6C2是一種針對(duì)RTA的新型抗體
    第2章 實(shí)驗(yàn)材料和方法
        2.2.1 抗體6C2 Fab與RTA蛋白及其突變體的制備
        2.2.2 RTA-6C2復(fù)合物的制備
        2.2.3 RTA-6C2復(fù)合物的結(jié)晶、數(shù)據(jù)收集
        2.2.4 酶聯(lián)免疫吸附實(shí)驗(yàn)
        2.2.5 蛋白質(zhì)翻譯抑制實(shí)驗(yàn)
        2.2.6 表面等離子共振實(shí)驗(yàn)
        2.2.7 Pull-Down實(shí)驗(yàn)
    第3章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果和討論
        2.3.1 RTA-6C2 Fab復(fù)合物的結(jié)構(gòu)解析
        2.3.2 RTA-6C2復(fù)合物結(jié)構(gòu)的模型質(zhì)量分析
        2.3.3 RTA-6C2復(fù)合物的結(jié)構(gòu)
        2.3.4 分子RTA與6C2 Fab的相互作用界面
        2.3.5 破壞RTA與6C2 Fab作用界面影響6C2抗體的保護(hù)作用
        2.3.6 RTA在結(jié)合單克隆抗體6C2前后的結(jié)構(gòu)比對(duì)
        2.3.7 6C2阻礙RTA和核糖體的相互作用
        2.3.8 討論
    本篇小結(jié)
    本篇參考文獻(xiàn)
附錄：金黃色葡萄球菌中毒性調(diào)控因子Rot的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究
    第1章 綜述:轉(zhuǎn)錄因子Rot的背景介紹
    第2章 實(shí)驗(yàn)材料和方法
        A2.1 克隆,純化和表達(dá)
        A2.2 結(jié)晶,數(shù)據(jù)收集和結(jié)構(gòu)解析
    第3章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果和討論
        A3.1 金黃色葡萄球菌Rot的結(jié)構(gòu)
        A3.2 金黃色葡萄球菌Rot奇特的二體作用界面
        A3.3 展望與小結(jié)
附錄 涉及的參考文獻(xiàn)
致謝
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與取得的研究成果



本文編號(hào)：3033762