目的:探討人端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶基因啟動(dòng)子區(qū)的序列特征、轉(zhuǎn)錄因子及其結(jié)合位點(diǎn)。方法:從NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取人TERT基因組序列及其啟動(dòng)子序列:利用EMBOSS 6. 6. 0、Cp G finder 1. 0和MethPrimer 1. 0軟件預(yù)測(cè)啟動(dòng)子區(qū)Cp G島的位置;利用Patch 1. 0和PROMO 3. 0. 2軟件預(yù)測(cè)可與TERT基因結(jié)合的潛在轉(zhuǎn)錄因子及結(jié)合位點(diǎn)。結(jié)果:TERT基因定位于5p15. 33,基因序列全長(zhǎng)共41 881 bp,其啟動(dòng)子位于TERT基因5’端上游2 500 bp處,全長(zhǎng)2 043bp。TERT基因啟動(dòng)子區(qū)可能存在2個(gè)Cp G島和118個(gè)轉(zhuǎn)錄因子。結(jié)論:通過(guò)生物信息學(xué)軟件對(duì)h TERT基因啟動(dòng)子進(jìn)行預(yù)測(cè)分析,可提高對(duì)h TERT基因啟動(dòng)子的研究效率,以便更加深入了解h TERT基因的調(diào)控機(jī)制及其生物學(xué)功能。 

【文章來(lái)源】：腫瘤預(yù)防與治療. 2020,33(03)

【文章頁(yè)數(shù)】：9 頁(yè)

【部分圖文】：

EMBOSS 6.6.0軟件預(yù)測(cè)的甲基化Cp G島圖譜

Cp G finder 1.0軟件預(yù)測(cè)的甲基化Cp G島圖譜

利用Patch 1.0程序搜索TRANSFAC數(shù)據(jù)庫(kù)，共獲得1 769個(gè)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)(包括小鼠和人類(lèi))，經(jīng)篩選后共得到911個(gè)人類(lèi)的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)，手工匯總?cè)ブ睾蠊驳玫?5個(gè)轉(zhuǎn)錄因子，主要包括AP-1、AP-2、CTCF、FOR1、GATA-1、P58、PXR-1、RAR-alpha1、Sp1、TCF-1A、TCF-4等(表1)。2.3.2 PROMO預(yù)測(cè)結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]喉鱗狀細(xì)胞癌及癌前病變R0切除術(shù)后復(fù)發(fā)危險(xiǎn)因素研究[J]. 魯海珍,尹英愛(ài),呂寧.  腫瘤預(yù)防與治療. 2019(07)



本文編號(hào)：3002789