蜱源LCMV的鑒定和全基因組序列分析
發(fā)布時(shí)間:2021-01-10 05:13
蜱是非常重要的媒介節(jié)肢動(dòng)物,其種類豐富、分布廣泛,可傳播多種人畜共患疾病,危害極大。我國(guó)東北地區(qū)常見(jiàn)蜱傳病包括萊姆病、巴貝斯蟲(chóng)病、立克次體斑點(diǎn)熱、森林腦炎、發(fā)熱伴血小板綜合征等。大多數(shù)蜱媒傳染病臨床癥狀不典型,在臨床上易被誤診和漏診。蜱傳病現(xiàn)已成為傳染病科研熱點(diǎn)之一。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的不斷進(jìn)步和統(tǒng)計(jì)方法的不斷完善,蜱傳病原的鑒別與臨床診斷水平獲得了長(zhǎng)足的提升。淋巴細(xì)胞脈絡(luò)叢腦膜炎病毒(lymphocytic choriomeningitis virus,LCMV),屬于單股負(fù)鏈RNA病毒目,沙粒病毒科,沙粒病毒屬病毒,也是沙粒病毒科最早被發(fā)現(xiàn)的病毒。其自然宿主為嚙齒類動(dòng)物,疾病感染途徑包括與嚙齒類動(dòng)物接觸,被嚙齒類動(dòng)物叮咬和被攜帶病毒的節(jié)肢類動(dòng)物叮咬。LCMV感染人后可引發(fā)無(wú)癥狀的持續(xù)性感染,嚴(yán)重的會(huì)引發(fā)腦膜炎致死,免疫力缺陷病人感染該病毒后致死率更高。20世紀(jì)70年代,曾有報(bào)道65名病人感染慢性淋巴細(xì)胞腦膜炎,原因疑似為蜱叮咬傳播。近50年來(lái)無(wú)蜱攜帶LCMV報(bào)道。本研究于2015年4月在吉林省敦化市和琿春市敬信鎮(zhèn)采集蜱樣品,將采集蜱樣品依據(jù)蜱種和地區(qū)分組,進(jìn)行宏病毒基因組測(cè)序,發(fā)現(xiàn)...
【文章來(lái)源】:吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)吉林省
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
四種蜱A:草原革蜱背部,a:草原革蜱腹部;B:全溝硬蜱,b:全溝硬蜱;C:森林革蜱,c:森林革蜱;D:長(zhǎng)角血蜱背
蜱 2:草原革蜱 3:森林革蜱 4:嗜群血蜱 5:草原革蜱 6:DNA 分子質(zhì)量標(biāo)7:陰性對(duì)照es persulcatus 2: Dermacentor nuttalli 3: Dermacentor silvarum 4: Haelongicornis 5: Dermacentor nuttalli 6:Marker2000 7: Negative co敦化市和琿春市敬信鎮(zhèn)共采集蜱樣本 534 只,敦化市采集 147 只,草原革蜱 230 只(43%),森林革蜱 205 只(38.3%),長(zhǎng)角血蜱 61 只((7.1%),草原革蜱和森林革蜱為兩地優(yōu)勢(shì)蜱種,而全溝硬蜱在兩分布見(jiàn)表 1.4。表 1.4.吉林省敦化市和敬信鎮(zhèn)蜱種分布1.4 Species and location information of Jilin Province tick samplTick speciescNo. of ticksDunHua JingXinNo.of ticksNo. of ticks
圖 1.3.不同蜱樣本中檢測(cè) LCMV5 泳道為陰性對(duì)照,1-12 泳道為不同蜱種蜱樣本,M:Maeker2000 DNA 分子質(zhì)量檢測(cè)標(biāo)尺。Fig.1.3 Different samples test Lymphocytic choriomeningitis virus5:Negative control;1 -12 test samples;M:DNA Marker 2000; 組為 4 號(hào)樣本(敬信草原革蜱),3 組為 14 號(hào)樣本(敬信森林革蜱),9 組為 31 號(hào)敬信長(zhǎng)角血蜱),12 組為 46 號(hào)樣本(敦化全溝硬蜱),共有四種蜱攜帶 LCMV。CMV 序列分析用軟件 DNAStar 對(duì)序列進(jìn)行對(duì)比。對(duì)四中蜱攜帶的 LCMV 一致性較高為 98%。在 中進(jìn)行 Nucleotide Blast 同源性比對(duì)結(jié)果顯示:與數(shù)據(jù)庫(kù)中 LCMV 序列同源性為 88%~與 DQ868484.1 同源性最高,為 88%。發(fā)現(xiàn)吉林省敦化市和琿春市敬信鎮(zhèn)四個(gè)蜱種之間CMV 差異不大,而與已發(fā)現(xiàn)的 LCMV 毒株有較大差異。吉林省蜱 LCMV 陽(yáng)性率統(tǒng)計(jì)
本文編號(hào):2968128
【文章來(lái)源】:吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)吉林省
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
四種蜱A:草原革蜱背部,a:草原革蜱腹部;B:全溝硬蜱,b:全溝硬蜱;C:森林革蜱,c:森林革蜱;D:長(zhǎng)角血蜱背
蜱 2:草原革蜱 3:森林革蜱 4:嗜群血蜱 5:草原革蜱 6:DNA 分子質(zhì)量標(biāo)7:陰性對(duì)照es persulcatus 2: Dermacentor nuttalli 3: Dermacentor silvarum 4: Haelongicornis 5: Dermacentor nuttalli 6:Marker2000 7: Negative co敦化市和琿春市敬信鎮(zhèn)共采集蜱樣本 534 只,敦化市采集 147 只,草原革蜱 230 只(43%),森林革蜱 205 只(38.3%),長(zhǎng)角血蜱 61 只((7.1%),草原革蜱和森林革蜱為兩地優(yōu)勢(shì)蜱種,而全溝硬蜱在兩分布見(jiàn)表 1.4。表 1.4.吉林省敦化市和敬信鎮(zhèn)蜱種分布1.4 Species and location information of Jilin Province tick samplTick speciescNo. of ticksDunHua JingXinNo.of ticksNo. of ticks
圖 1.3.不同蜱樣本中檢測(cè) LCMV5 泳道為陰性對(duì)照,1-12 泳道為不同蜱種蜱樣本,M:Maeker2000 DNA 分子質(zhì)量檢測(cè)標(biāo)尺。Fig.1.3 Different samples test Lymphocytic choriomeningitis virus5:Negative control;1 -12 test samples;M:DNA Marker 2000; 組為 4 號(hào)樣本(敬信草原革蜱),3 組為 14 號(hào)樣本(敬信森林革蜱),9 組為 31 號(hào)敬信長(zhǎng)角血蜱),12 組為 46 號(hào)樣本(敦化全溝硬蜱),共有四種蜱攜帶 LCMV。CMV 序列分析用軟件 DNAStar 對(duì)序列進(jìn)行對(duì)比。對(duì)四中蜱攜帶的 LCMV 一致性較高為 98%。在 中進(jìn)行 Nucleotide Blast 同源性比對(duì)結(jié)果顯示:與數(shù)據(jù)庫(kù)中 LCMV 序列同源性為 88%~與 DQ868484.1 同源性最高,為 88%。發(fā)現(xiàn)吉林省敦化市和琿春市敬信鎮(zhèn)四個(gè)蜱種之間CMV 差異不大,而與已發(fā)現(xiàn)的 LCMV 毒株有較大差異。吉林省蜱 LCMV 陽(yáng)性率統(tǒng)計(jì)
本文編號(hào):2968128
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