青海地區(qū)喜馬拉雅旱獺疫源地鼠疫菌基因組時(shí)空演變及其生態(tài)適應(yīng)分析
發(fā)布時(shí)間:2020-12-28 05:37
目的探索青海地區(qū)喜馬拉雅旱獺疫源地鼠疫菌基因組時(shí)空演變及其影響因素。方法采用判斷抽樣選取青海地區(qū)喜馬拉雅旱獺疫源地自然分離到的鼠疫菌556株,對(duì)其基因組型DFR數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,采用鼠疫菌基因組分型和空間流行病學(xué)方法,繪制鼠疫菌基因組DFR時(shí)空演變專題地圖,綜合分析鼠疫菌基因組時(shí)空演變特征及其趨勢(shì),探索鼠疫菌基因組時(shí)空演變影響因素。結(jié)果青海地區(qū)喜馬拉雅旱獺鼠疫疫源地鼠疫菌DFR分型存在著明顯的時(shí)空差異。在空間尺度上,5型和8型分布廣泛,其中5型主要分布在玉樹和唐古拉地區(qū),8型主要分布在海南、海西和海北等地;32型僅存在唐古拉地區(qū),44型則分布在海北的祁連、門源2個(gè)地區(qū)。在時(shí)間尺度上,各地分離到的鼠疫菌基因組DFR型別均有不同程度的種群替代,這一特點(diǎn)在玉樹地區(qū)表象尤為明顯。結(jié)論鼠疫菌基因組型時(shí)空分布及其演變受鼠疫疫源地所在的生態(tài)環(huán)境的綜合影響,而氣候因素是其中的一個(gè)重要環(huán)節(jié),這將為基于生態(tài)流行病學(xué)和基因組流行病學(xué)的現(xiàn)代鼠疫防治和學(xué)科建設(shè)提供參考依據(jù)。
【文章來源】:中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2019年12期 北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
青海地區(qū)喜馬拉雅旱獺疫源地鼠疫菌基因組型(DFR)構(gòu)成比例
青海地區(qū)喜馬拉雅旱獺疫源地鼠疫菌主要基因組型空間分布(5、8、32、44型)
青海地區(qū)喜馬拉雅旱獺疫源地鼠疫菌基因組5型和8型空間分布
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]西藏尼木縣一起動(dòng)物間鼠疫的實(shí)驗(yàn)室判定[J]. 占堆,索朗德吉,格桑曲珍,普次仁. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2018(10)
[2]1978-2014年青海省果洛州鼠疫流行病學(xué)分析[J]. 李存香,靳娟,吳海蓮,楊曉艷,金泳,趙海紅,吳海生,李君,魏柏青,祁芝珍. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2017(07)
[3]青海省格爾木市鼠疫病原學(xué)及流行病學(xué)特征分析[J]. 何建,魏柏青,祁美英,辛有全,熊浩明,楊曉艷,靳娟,金泳,李翔,代瑞霞. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2016(01)
[4]基于地理信息系統(tǒng)的青海省鼠疫菌毒力研究[J]. 熊浩明,魏柏青,祁美英,李存香,楊曉艷,辛有全,魏榮杰,靳娟,代瑞霞. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2014(01)
[5]應(yīng)用抑制削減雜交技術(shù)進(jìn)行鼠疫耶爾森菌的比較基因組研究[J]. 戴二黑,童宗中,王效義,周冬生,張建國(guó),李蓓,楊俊興,陳澤良,宋亞軍,郭兆彪,王津,楊瑞馥. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2005(03)
[6]鼠疫耶爾森菌生物型變異遺傳基礎(chǔ)的研究和新生物型——田鼠型的提出[J]. 周冬生,童宗中,宋亞軍,張玲,裴德翠,龐昕,韓延平,李敏,崔百忠,王津,郭兆彪,祁芝珍,金麗霞,翟俊輝,杜宗敏,王效義,汪建,黃培堂,楊瑞馥. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2004(03)
[7]鼠疫耶爾森菌基因組進(jìn)化與生態(tài)位適應(yīng)研究[J]. 周冬生,韓延平,宋亞軍,童宗中,裴德翠,戴二黑,張玲,包靜月,李敏,崔百忠,張秀清,王津,郭兆彪,祁芝珍,金麗霞,翟俊輝,杜宗敏,王效義,汪建,黃培堂,楊瑞馥. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2004(03)
[8]新疆山地鼠疫自然疫源地鼠疫耶爾森菌基因組分化和演變[J]. 張渝疆,戴翔,王信惠,戴二黑,布仁明德,楊瑞馥. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2007 (02)
博士論文
[1]鼠疫耶爾森氏菌基因組多態(tài)性研究及快速鑒定溯源系統(tǒng)的建立[D]. 李艷君.中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2009
[2]鼠疫耶爾森氏菌基因分型與適應(yīng)性微進(jìn)化研究[D]. 戴二黑.中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2005
本文編號(hào):2943217
【文章來源】:中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2019年12期 北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
青海地區(qū)喜馬拉雅旱獺疫源地鼠疫菌基因組型(DFR)構(gòu)成比例
青海地區(qū)喜馬拉雅旱獺疫源地鼠疫菌主要基因組型空間分布(5、8、32、44型)
青海地區(qū)喜馬拉雅旱獺疫源地鼠疫菌基因組5型和8型空間分布
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]西藏尼木縣一起動(dòng)物間鼠疫的實(shí)驗(yàn)室判定[J]. 占堆,索朗德吉,格桑曲珍,普次仁. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2018(10)
[2]1978-2014年青海省果洛州鼠疫流行病學(xué)分析[J]. 李存香,靳娟,吳海蓮,楊曉艷,金泳,趙海紅,吳海生,李君,魏柏青,祁芝珍. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2017(07)
[3]青海省格爾木市鼠疫病原學(xué)及流行病學(xué)特征分析[J]. 何建,魏柏青,祁美英,辛有全,熊浩明,楊曉艷,靳娟,金泳,李翔,代瑞霞. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2016(01)
[4]基于地理信息系統(tǒng)的青海省鼠疫菌毒力研究[J]. 熊浩明,魏柏青,祁美英,李存香,楊曉艷,辛有全,魏榮杰,靳娟,代瑞霞. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2014(01)
[5]應(yīng)用抑制削減雜交技術(shù)進(jìn)行鼠疫耶爾森菌的比較基因組研究[J]. 戴二黑,童宗中,王效義,周冬生,張建國(guó),李蓓,楊俊興,陳澤良,宋亞軍,郭兆彪,王津,楊瑞馥. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2005(03)
[6]鼠疫耶爾森菌生物型變異遺傳基礎(chǔ)的研究和新生物型——田鼠型的提出[J]. 周冬生,童宗中,宋亞軍,張玲,裴德翠,龐昕,韓延平,李敏,崔百忠,王津,郭兆彪,祁芝珍,金麗霞,翟俊輝,杜宗敏,王效義,汪建,黃培堂,楊瑞馥. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2004(03)
[7]鼠疫耶爾森菌基因組進(jìn)化與生態(tài)位適應(yīng)研究[J]. 周冬生,韓延平,宋亞軍,童宗中,裴德翠,戴二黑,張玲,包靜月,李敏,崔百忠,張秀清,王津,郭兆彪,祁芝珍,金麗霞,翟俊輝,杜宗敏,王效義,汪建,黃培堂,楊瑞馥. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2004(03)
[8]新疆山地鼠疫自然疫源地鼠疫耶爾森菌基因組分化和演變[J]. 張渝疆,戴翔,王信惠,戴二黑,布仁明德,楊瑞馥. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2007 (02)
博士論文
[1]鼠疫耶爾森氏菌基因組多態(tài)性研究及快速鑒定溯源系統(tǒng)的建立[D]. 李艷君.中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2009
[2]鼠疫耶爾森氏菌基因分型與適應(yīng)性微進(jìn)化研究[D]. 戴二黑.中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2005
本文編號(hào):2943217
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