布魯氏菌Omp10蛋白抗原表位的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2020-12-21 19:24
目的用生物信息學(xué)技術(shù)預(yù)測(cè)布魯氏菌Omp10蛋白的抗原表位,尋找布魯氏菌Omp10的優(yōu)勢(shì)表位。方法利用IEDB在線軟件、DNAStar軟件、Pro Pred MHC Class-ⅡBinding Peptide Prediction Server軟件和SYFPEITHI軟件,通過(guò)分子結(jié)構(gòu)、親水性、柔韌性、表面可及性以及抗原指數(shù)等在線分析Omp10蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)、B細(xì)胞抗原表位及T細(xì)胞抗原表位。結(jié)果布魯氏菌Omp10蛋白B細(xì)胞抗原表位有4個(gè),為26-34、65-75、97-102和115-120氨基酸殘基。Omp10蛋白T細(xì)胞抗原表位有6個(gè),為64-79、72-87、104-119、6-21、9-24和78-93氨基酸殘基。結(jié)論通過(guò)綜合分析布魯氏菌Omp10蛋白有4個(gè)B細(xì)胞抗原表位和6個(gè)T細(xì)胞抗原表位,為進(jìn)一步篩選具有一定抗原保護(hù)性和免疫原性的優(yōu)勢(shì)表位和多價(jià)疫苗構(gòu)建奠定了基礎(chǔ)。
【文章來(lái)源】:新疆醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2016年10期
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
線性表位預(yù)測(cè)
β轉(zhuǎn)角預(yù)測(cè)
表面可及性預(yù)測(cè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]用DNAStar軟件預(yù)測(cè)Rv1410c結(jié)核分枝桿菌蛋白抗原表位[J]. 李江英,白雪娟,梁艷,張俊仙,陽(yáng)幼榮,趙衛(wèi)國(guó),吳雪瓊. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2015(04)
[2]細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)AgB1抗原表位的生物信息學(xué)預(yù)測(cè)[J]. 馬秀敏,胡曉安,阿爾孜古麗·吐?tīng)栠d,李艷華,劉學(xué)磊,朱明,丁劍冰. 科技導(dǎo)報(bào). 2013(27)
[3]布魯氏菌的致病機(jī)制與細(xì)胞免疫機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 董炳梅,王金良,唐娜,苗立中,沈志強(qiáng). 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2012(06)
本文編號(hào):2930362
【文章來(lái)源】:新疆醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2016年10期
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
線性表位預(yù)測(cè)
β轉(zhuǎn)角預(yù)測(cè)
表面可及性預(yù)測(cè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]用DNAStar軟件預(yù)測(cè)Rv1410c結(jié)核分枝桿菌蛋白抗原表位[J]. 李江英,白雪娟,梁艷,張俊仙,陽(yáng)幼榮,趙衛(wèi)國(guó),吳雪瓊. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2015(04)
[2]細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)AgB1抗原表位的生物信息學(xué)預(yù)測(cè)[J]. 馬秀敏,胡曉安,阿爾孜古麗·吐?tīng)栠d,李艷華,劉學(xué)磊,朱明,丁劍冰. 科技導(dǎo)報(bào). 2013(27)
[3]布魯氏菌的致病機(jī)制與細(xì)胞免疫機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 董炳梅,王金良,唐娜,苗立中,沈志強(qiáng). 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2012(06)
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