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浙江省野生動物鼬獾和家犬狂犬病病毒L基因序列測定分析

發(fā)布時間:2020-11-18 02:46
   目的測定浙江省野生動物鼬獾和家犬狂犬病病毒L基因序列,在分子水平分析轉錄酶大蛋白(LP)的變異特點和遺傳進化特征。方法對實驗室檢測陽性的狂犬病病毒標本進行L基因編碼區(qū)核酸序列測定,通過生物分析軟件比較L基因核苷酸序列和氨基酸序列,并與GenBank的36個參考序列編碼區(qū)進行比對分析。結果測序獲得野生動物鼬獾(F02、F04)和家犬(D01、D02)二種宿主來源的狂犬病病毒街毒株L基因核苷酸全長序列并遞交GenBank,開放讀碼框(ORF)均為6 387 bp,編碼區(qū)均以2個連續(xù)的起始密碼子ATG起始,編碼2 128個氨基酸。在LP保守結構域上的特異功能短序列幾乎完全保守,各結構域之間的序列保守性略差,對存在的變異位點絕大多數(shù)極性并沒有變化,系統(tǒng)進化分析顯示浙江省鼬獾、犬街毒株均歸屬于傳統(tǒng)的狂犬病病毒Asian譜系,與我國廣泛傳播的狂犬病病毒同屬一種系。結論浙江省狂犬病病毒L基因的構成與傳統(tǒng)狂犬病病毒一致,所構建進化樹的分析作用與N基因相同,鼬獾病毒依然具有本土狂犬病病毒的基因特點,家犬病毒可能與我國多種宿主動物病毒來源相同或者具有新近的相互傳播,不同宿主動物狂犬病病毒具有種群多樣性的進化特點和地域性流行特征。

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