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感染后白細(xì)胞降低患者的關(guān)鍵甲基化基因的篩選

發(fā)布時(shí)間:2020-04-14 16:14
【摘要】:目的:探討感染伴白細(xì)胞降低的相關(guān)病理生理學(xué)機(jī)制,為基因診斷及治療提供新思路。方法:選取2017年1月至2017年12月我院確診為感染伴白細(xì)胞降低的患者為病例組,感染后白細(xì)胞升高的患者為陰性對(duì)照組,同期我院健康體檢者30例為正常對(duì)照組,首先對(duì)患者的臨床資料進(jìn)行分析,再進(jìn)行全基因組甲基化檢測(cè),從中選出關(guān)鍵甲基化位點(diǎn)后進(jìn)行后續(xù)的驗(yàn)證試驗(yàn)。結(jié)果:血清補(bǔ)體C3、C5在白細(xì)胞降低組較白細(xì)胞升高組和正常對(duì)照組均降低,進(jìn)行了全基因組甲基化檢測(cè),我們分析得出差異甲基化位點(diǎn)的數(shù)目、差異甲基化基因數(shù)目、差異甲基化位點(diǎn)的位置,再通過富集分析,得出統(tǒng)計(jì)上顯著富集的通路、疾病功能等,最終我們得出基因NOX5、WWP2、AKT2、CBARA1可能與感染伴白細(xì)胞降低發(fā)病有關(guān),驗(yàn)證試驗(yàn)后得出WWP2基因、AKT2基因、CBARA1基因甲基化與感染致白細(xì)胞降低有關(guān),其中尤其是WWP2基因與感染致白細(xì)胞降低有密切相關(guān)性。結(jié)論:趨化因子分泌異常、細(xì)胞遷移障礙、泛素化修飾障礙、氧化應(yīng)激降低可能是白細(xì)胞降低伴感染的發(fā)病機(jī)制。
【圖文】:

白細(xì)胞降低,聚類分析,位點(diǎn),甲基化


2.1.1 對(duì)差異甲基化位點(diǎn)數(shù)目進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析2.1.1.1 白細(xì)胞降低組vs白細(xì)胞升高組 共檢測(cè)到24230個(gè)差異甲基化位點(diǎn),對(duì)其進(jìn)行聚類分析,如圖1;其中甲基化水平增高與同一位點(diǎn)上既有升高又有降低的位點(diǎn)共

甲基化,位點(diǎn),甲基化水平,基因


UP、Down、Disaccord 分別代表基因的甲基化水平升高、降低、同一基因上既有升高又有降低的CpG位點(diǎn);HyperMethylation=UP+DisaccordHypoMethylation=Down+Disaccord,具體見圖2。以上位點(diǎn)對(duì)應(yīng)10186個(gè)基因(表略),,其中甲基化水平增高與同一基因上既有升高又有降低的基因共有7334個(gè),甲基化水平降低與同一基因上既有升高又有降低的基因共有5013個(gè)。見圖3。圖 1 白細(xì)胞降低組 vs 白細(xì)胞升高組聚類分析Fig.1 Cluster analysis of leukocyte-lowering group and leukocyte-raising group圖 2 細(xì)胞降低組 vs 白細(xì)胞升高差異甲基化位點(diǎn)Fig.2 WBC decrease group vs. WBC elevation differential methylation site
【學(xué)位授予單位】:新疆醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R392

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本文編號(hào):2627475

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