山東煙臺(tái)地區(qū)HCV基因分型研究
【圖文】:
有3例標(biāo)本擴(kuò)增的是NSSB基因,由于例數(shù)較少,僅通過(guò)序列的同源性比對(duì)確定基因分型。根據(jù)測(cè)序結(jié)果繪制本地區(qū)其余39例標(biāo)本5’UTR區(qū)的遺傳進(jìn)化樹(shù),見(jiàn)圖1。從該圖可以看出,,遺傳進(jìn)化樹(shù)所得基因型結(jié)果與同源性分析結(jié)果較一致。 HCV3a型 4312號(hào)樣木與瑞典的HCVS’ UTR3a株(GenBank號(hào)為AJ621215)分型結(jié)果一致;HCV6a型4361號(hào)樣本與越南北部的HCVS’ UTR6a株(GenBank號(hào)為D88469)分型結(jié)果一致。本地區(qū)大部分1b型HCV分離毒株進(jìn)化較保守,與lb型HCV中國(guó)株(GenBank號(hào)為D10934)和lb型HCV日本株(GenBank號(hào)為AB442220)分型一致。而本地區(qū)2a型HCv分離株的變異則稍顯活躍,個(gè)別樣本與2a型HCV日本株的遺傳進(jìn)化距離增加,提示可能為2型的其它亞型。8
【學(xué)位授予單位】:青島大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2011
【分類號(hào)】:R373
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2538480
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