【摘要】：目的對人乳頭瘤病毒58型(HPV58)主要結(jié)構(gòu)蛋白(L1)的B細(xì)胞表位進(jìn)行預(yù)測和分析。方法利用生物信息學(xué)軟件EXPASY在線分析HPV58型L1蛋白的二級結(jié)構(gòu)及生物學(xué)特性,包括跨膜趨勢、表面可及性、抗原性、親水性,溶性等,從而對其B細(xì)胞表位進(jìn)行綜合分析和預(yù)測。結(jié)果通過親水性參數(shù),Zimmcrman極性,柔韌性參數(shù),表面可及性及抗原性進(jìn)行綜合分析,預(yù)測人乳頭瘤病毒58型L1蛋白的B細(xì)胞表位可能位于其N端的29-37,43,46-58,64-67,74,79-88,93,100-101,103-125,133-139,149,151-180,187-213,220-213,235,238-247,252-271,277-282,286-309,320-323,327-338,341-348,351,353-368,373-396,408,427,419-425,433-444,453-468,470,475-486,488-490,493-494,497-524肽段區(qū)域;進(jìn)一步用Protien Plast在線同源匹配分析,79-88、190-216、373-396、453-468、497-524肽段區(qū)段為可能的B細(xì)胞表位。結(jié)論用多參數(shù)預(yù)測分析HPV58型L1蛋白可能的B細(xì)胞表位,為進(jìn)一步研究高危型58型L1蛋白的生物學(xué)特性提供了理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:Objective to predict and analyze B cell epitopes of the main structural protein (L1) of human papillomavirus 58 (HPV58). Methods the secondary structure and biological characteristics of HPV58 L1 protein were analyzed online by bioinformatics software EXPASY, including the transmembrane trend, surface accessibility, antigenicity, hydrophilicity, solubility and so on. The B cell epitopes were comprehensively analyzed and predicted. Results the hydrophilic parameters, Zimmcrman polarity, flexibility parameters, surface accessibility and antigenicity were comprehensively analyzed. It is predicted that the B cell epitope of human papillomavirus 58 L1 protein may be located in its N-terminal of 29-37-43-36-58-43-67-77-79-8A1-93100-101103-125133-139149151-180187-213220-213235238-247252-271277-282286-302286-323327-338341-348351351-368373-39640842719-425433-444453 -468470475-486488-490493-494497-524 peptide region; Further more, 79-88190-216373-396453-468497-524 peptide region was identified as a possible B cell epitope by Protien Plast online homologous matching analysis. Conclusion the multiparameter prediction and analysis of the possible B cell epitopes of HPV58 L1 protein may provide a theoretical basis for the further study of the biological characteristics of high risk type 58 L1 protein.
【作者單位】： 溫州醫(yī)科大學(xué)微生物學(xué)與免疫學(xué)教研室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81176423)
【分類號】：R373

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號：2332159