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浙江省嚙齒動物攜帶心病毒的遺傳特征研究

發(fā)布時間:2018-08-14 16:46
【摘要】:目的了解我國浙江省的嚙齒動物攜帶心病毒情況,并分析其遺傳特征。方法用反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應選嚙齒動物糞便標本中的心病毒,擴增其全基因組;利用Lasergene軟件分別對多聚蛋白、P1蛋白、2C+3CD蛋白序列與Gen Bank下載的序列進行同源性分析;分析其基因組與多聚蛋白的特征;利用Phy ML軟件構建系統(tǒng)發(fā)生樹。結果浙江省嚙齒動物攜帶心病毒。毒株Ruian-Rn93-1、Longquan-Aa3-1、Ruian-Rn93-3的多聚蛋白、P1以及2C+3CD蛋白與心病毒B的同源性分別為71.9%~85.4%、65.2%~89.8%與78.3%~95.4%,屬于心病毒B;毒株Wencheng-Rn416的多聚蛋白、P1以及2C+3CD蛋白與Boone心病毒的同源性分別為92.5%、85.3%與96.9%,屬于心病毒C。系統(tǒng)發(fā)生分析也表明毒株Ruian-Rn93-1、Longquan-Aa3-1、Ruian-Rn93-3與心病毒B的親緣關系最近,Wencheng-Rn416與Boone心病毒的親緣關系最近。系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn)嚙齒動物在心病毒的起源與進化過程中起著重要的作用,并且可能發(fā)生跨種間傳播而感染人。結論我國浙江省嚙齒動物攜帶心病毒,并可能跨種間傳播到人。
[Abstract]:Objective to investigate the prevalence of heart virus in rodents in Zhejiang Province and to analyze its genetic characteristics. Methods the whole genome of cardiac virus was amplified by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) from fecal samples of rodents, and the sequence of P1-2C 3CD was analyzed by Lasergene software. The characteristics of genomes and polyproteins were analyzed, and the phylogenetic tree was constructed by Phy ML software. Results rodents in Zhejiang Province carried heart virus. The homology between Ruian-Rn93-1 and Ruian-Rn93-3 polyprotein P1 and 2C 3CD protein were 71.9% and 85.42%, respectively, and 78.3%, respectively. The homology of P1 protein and 2C 3CD protein of Wencheng-Rn416 was 92.5% and 996.63%, respectively. Phylogenetic analysis also showed that the relationship between Ruian-Rn93-1 (Ruian-Rn93-3) Ruian-Rn93-3 and heart virus B was the closest between Wencheng-Rn416 and Boone. Phylogenetic analysis revealed that rodents play an important role in the origin and evolution of cardiac viruses and may infect humans through interspecific transmission. Conclusion rodents in Zhejiang Province carry cardioviruses and may be transmitted to humans across species.
【作者單位】: 中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所人獸共患病室傳染病預防控制國家重點實驗室;溫州市疾病預防控制中心;龍泉市疾病預防控制中心;文成縣疾病預防控制中心;瑞安市疾病預防控制中心;
【基金】:國家自然科學基金(No.81273014,81290343)~~
【分類號】:R373

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