【摘要】：基因間SNP-SNP的交互作用較單一SNP對于疾病的預警作用可能會達到更優(yōu)的檢測效能。本研究探討了核苷酸切除修復(NER)系統(tǒng)基因中SNP交互作用對移植排斥反應發(fā)病風險的預警作用。通過Sequenom Mass ARRAY平臺進行基因分型,對8個NER基因中的38個多態(tài)進行了檢測,包括XPA、XPC、DDB2、XPB(ERCC3)、XPD(ERCC2)、ERCC1、XPF(ERCC4)和XPG(ERCC5)基因。單體型分析結果顯示,XPA rs3176629-rs2808668 C-T單體型以及ERCC5 G-C-C-T和G-C-T-C單體型可以增加移植排斥反應的發(fā)病風險(分別為OR=1.81,OR=7.72和OR=3.46),而ERCC5 rs2094258-rs751402-rs2296147-rs1047768 A-C-T-T單體型降低了該風險(OR=0.35)。多因素Logistic回歸與多因子降維(MDR)分析均表明,ERCC2 rs50871、ERCC5rs1047768和XPC rs2228001多態(tài)對于發(fā)生移植排斥反應存在基因間SNP-SNP的交互作用。因此,XPC rs2228001、ERCC2 rs50871、ERCC5 rs1047768三者的交互作用與移植排斥反應的發(fā)病風險相關。
[Abstract]:The intergenic interaction of SNP-SNP may be more effective in detecting disease than that of single SNP. The purpose of this study was to investigate the role of SNP interaction in nucleotide excision repair (NER) system in predicting the risk of graft rejection. 38 polymorphisms of 8 NER genes, including XPA-XPC-DDB2XPB (ERCC3) XPD (ERCC2) ERCC1 XPF (ERCC4) and XPG (ERCC5) gene, were genotyped by Sequenom Mass ARRAY platform. The results of haplotype analysis showed that XPA rs3176629-rs2808668 C-T haplotype and ERCC5 G-C-C-T and G-C-T-C haplotypes increased the risk of graft rejection (OR1.81 OR7.72 and OR=3.46, respectively), while ERCC5 rs2094258-rs751402-rs2296147-rs1047768 A-C-T-T haplotype reduced the risk (OR=0.35). Multivariate Logistic regression and multivariate (MDR) analysis showed that ERCC2 rs50871ERCC5rs1047768 and XPC rs2228001 polymorphisms had intergenic SNP-SNP interaction in the occurrence of graft rejection. Therefore, the interaction of ERCC2 rs50871 and ERCC5 rs1047768 in XPC rs2228001 was associated with the risk of graft rejection.
【作者單位】： 普通外科研究所暨器官移植科中國醫(yī)科大學附屬一院;普通外科研究所暨腫瘤研究所腫瘤病因與篩查研究室中國醫(yī)科大學附屬一院遼寧省高校腫瘤病因與預防重點實驗室;
【基金】：國家自然科學基金項目(編號:31200968)資助~~
【分類號】：R392

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本文編號：2179593