【摘要】：目的比較昆明市住院與門診病例來源的10株EV71病毒分離株3D蛋白酶基因核苷酸及編碼氨基酸序列的差異性與病毒毒力之間的關(guān)系。方法對分離自昆明市的10株EV71病毒3D蛋白酶基因核苷酸測序,利用Bioedit及Mega 6軟件對測序結(jié)果進(jìn)行序列比對及遺傳特性分析。選取6株(住院病例分離株、門診病例分離株各3株)繪制病毒增殖動力學(xué)曲線,取其中2株(住院及門診病例來源各1株)病毒接種至Vero細(xì)胞進(jìn)行空斑形成試驗,比較不同病毒株形成的空斑形態(tài)大小。結(jié)果對10株EV71分離病毒株的3D蛋白酶基因進(jìn)行核苷酸測序并構(gòu)建進(jìn)化樹,5株住院病例分離株間遺傳距離較近,在進(jìn)化樹上單獨成為一簇;住院病例病毒分離株與門診病例病毒分離株的氨基酸序列在140、197、299位點存在差異;住院病例病毒株在較短時間達(dá)到增殖高峰,空斑試驗中形成的蝕斑直徑大于門診病例分離株。結(jié)論不同來源的EV71病毒分離株3D蛋白酶基因核苷酸序列及編碼氨基酸序列存在差異,該差異與EV71病毒的增殖特性及毒力具有一定相關(guān)性。
[Abstract]:Objective to compare the relationship between nucleotide sequence and coding amino acid sequence of 3D protease gene and virulence of 10 EV71 virus isolates in Kunming. Methods the nucleotide sequence of 3D protease gene of 10 strains of EV71 virus isolated from Kunming was sequenced, and the sequence alignment and genetic characteristics were analyzed by Bioedit and Mega6 software. Six strains (3 strains in hospital and 3 strains in outpatient department) were selected to draw the dynamic curve of virus proliferation, and 2 strains (1 strain from inpatient and 1 strain from outpatient) were inoculated into Vero cells for plaque formation test. The plaque size of different virus strains was compared. Results the 3D protease genes of 10 EV71 isolates were sequenced and 5 inpatient isolates were constructed. The amino acid sequence of inpatient virus isolate and outpatient virus isolate were different at the 140197299 locus, the inpatient virus strain reached the peak of proliferation in a short time, and the plaque diameter in plaque test was larger than that in outpatient case isolate. Conclusion the nucleotide sequence and coding amino acid sequence of 3D protease gene of EV71 virus isolates from different sources are different, which is related to the proliferation and virulence of EV71 virus.
【作者單位】： 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;
【基金】：中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)-“高等級生物安全P4實驗室培訓(xùn)體系的建立”(No.2016ZX330058) 云南省創(chuàng)新團(tuán)隊-“中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所手足口病病原學(xué)與疫苗研究省創(chuàng)新團(tuán)隊”(No.2016HC009)
【分類號】：R373

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