本文選題：寨卡病毒 + 全基因組�。� 參考：《現(xiàn)代預防醫(yī)學》2017年12期

【摘要】：目的通過構建寨卡病毒基因進化樹以及比較氨基酸序列差異,了解寨卡病毒進化及基因變異情況。方法從GenBank獲取1947年后各來源、各地區(qū)的寨卡病毒全基因組序列以及氨基酸序列,構建進化樹并對氨基酸序列進行比較與分析。結果寨卡病毒非洲型與亞洲型毒株可各自聚類,2007年之后分離的毒株均為亞洲型;2016年分離自中國的14株寨卡病毒均為亞洲型,同源性高達99.1%~100.0%,氨基酸變異位點11個。結論寨卡病毒的分子進化與地理分布有密切的關系;2015-2016年分離的毒株同源性較高,序列較為保守;中國的14株毒株序列相近,其中1118、1875、2445以及2634 4個氨基酸位點可能對各自蛋白的結構和功能有較大的影響。
[Abstract]:Objective to study the evolution and genetic variation of Zika virus by constructing an evolutionary tree of Zika virus gene and comparing amino acid sequence differences. Methods the whole genome and amino acid sequences of Zika virus from different sources and regions were obtained from GenBank after 1947. The phylogenetic tree was constructed and the amino acid sequences were compared and analyzed. Results both African and Asian strains of Zika virus could be clustered separately, and all the strains isolated after 2007 were of Asian type, and 14 strains of Zika virus isolated from China in 2016 were all of Asian type, with the homology of 99.1 and 100.0, and 11 amino acid mutation sites. Conclusion there is a close relationship between molecular evolution and geographical distribution of Zika virus. The isolates isolated from 2015-2016 have high homology and conservative sequence, and 14 strains of Zika virus have similar sequences in China. Among them, 1118, 1875, 2445 and 2634 amino acid sites may have a great effect on the structure and function of their proteins.
【作者單位】： 南方醫(yī)科大學公共衛(wèi)生學院三級生物安全實驗室;
【基金】：廣東省科技計劃項目(20170212) 廣州市新發(fā)病毒防治藥物研究重點實驗室項目(201605030010)
【分類號】：R373

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