本文選題：分子動力學 + 抗體�。� 參考：《四川大學學報(自然科學版)》2017年02期

【摘要】：研究抗原與抗體的相互作用機制在治療與抗體相關疾病藥物的研發(fā)中起到重要作用.采用分子動力學模擬和MM-PBSA(molecular mechanics-Poisson Boltzmann surface area)以及溶解相互作用能SIE(solvated interaction energy)方法研究了抗原Alizarin red(AZN)與抗體SPE7的結合模式.研究結果證明范德華作用主導了抗原AZN與抗體SPE7的相互作用.基于殘基能量分解的計算表明抗原AZN能與殘基H-W35、H-Y105、L-Y34和L-W93產生較強的相互作用,此結果表明AZN與SPE7分離殘基間的π-π相互作用驅動了AZN與SPE7的結合.期望這個研究能為治療與抗體相關疾病藥物的研發(fā)提供重要的理論指導.
[Abstract]:Studying the mechanism of antigen-antibody interaction plays an important role in the research and development of antibody-related diseases. Molecular dynamics simulation, MM-PBSA(molecular mechanics-Poisson Boltzmann surface area) and dissolution interaction energy SIE(solvated interaction energy were used to study the binding model of antigenic Alizarin redder AZN with antibody SPE7. The results show that van der Waals interaction dominates the interaction between antigen AZN and antibody SPE7. The calculation based on the energy decomposition of the residue indicates that the antigenic AZN can interact strongly with the residues H-W35H-Y105 L-Y34 and L-W93. The results show that the 蟺-蟺 interaction between AZN and the separated residues of SPE7 drives the binding of AZN and SPE7. It is expected that this study will provide important theoretical guidance for the development of antibody-related disease drugs.
【作者單位】： 山東交通學院理學院;山東師范大學物理與電子科學學院;
【基金】：國家自然科學基金(11504206,11274206) 山東省高等學�？萍加媱濏椖�(J14LJ07)
【分類號】：R392

【參考文獻】

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