本文選題：分子動(dòng)力學(xué) + 抗體　； 參考：《四川大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)》2017年02期

【摘要】：研究抗原與抗體的相互作用機(jī)制在治療與抗體相關(guān)疾病藥物的研發(fā)中起到重要作用.采用分子動(dòng)力學(xué)模擬和MM-PBSA(molecular mechanics-Poisson Boltzmann surface area)以及溶解相互作用能SIE(solvated interaction energy)方法研究了抗原Alizarin red(AZN)與抗體SPE7的結(jié)合模式.研究結(jié)果證明范德華作用主導(dǎo)了抗原AZN與抗體SPE7的相互作用.基于殘基能量分解的計(jì)算表明抗原AZN能與殘基H-W35、H-Y105、L-Y34和L-W93產(chǎn)生較強(qiáng)的相互作用,此結(jié)果表明AZN與SPE7分離殘基間的π-π相互作用驅(qū)動(dòng)了AZN與SPE7的結(jié)合.期望這個(gè)研究能為治療與抗體相關(guān)疾病藥物的研發(fā)提供重要的理論指導(dǎo).
[Abstract]:Studying the mechanism of antigen-antibody interaction plays an important role in the research and development of antibody-related diseases. Molecular dynamics simulation, MM-PBSA(molecular mechanics-Poisson Boltzmann surface area) and dissolution interaction energy SIE(solvated interaction energy were used to study the binding model of antigenic Alizarin redder AZN with antibody SPE7. The results show that van der Waals interaction dominates the interaction between antigen AZN and antibody SPE7. The calculation based on the energy decomposition of the residue indicates that the antigenic AZN can interact strongly with the residues H-W35H-Y105 L-Y34 and L-W93. The results show that the 蟺-蟺 interaction between AZN and the separated residues of SPE7 drives the binding of AZN and SPE7. It is expected that this study will provide important theoretical guidance for the development of antibody-related disease drugs.
【作者單位】： 山東交通學(xué)院理學(xué)院;山東師范大學(xué)物理與電子科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(11504206,11274206) 山東省高等學(xué)�？萍加�(jì)劃項(xiàng)目(J14LJ07)
【分類號(hào)】：R392

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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7 陸中s，

本文編號(hào)：1794626