本文選題：結(jié)核分枝桿菌 + clpP　； 參考：《四川大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)》2017年02期

【摘要】：目的預(yù)測(cè)結(jié)核分枝桿菌酪蛋白酶蛋白水解亞基單位2(clpP2)的抗原表位,為結(jié)核病疫苗、藥物研制等提供新的靶點(diǎn)。方法以clpP2蛋白的氨基酸序列為基礎(chǔ),采用生物信息軟件DNA Star預(yù)測(cè)二級(jí)結(jié)構(gòu);運(yùn)用SWISS-MODEL在線軟件進(jìn)行同源建模;運(yùn)用VaxiPred軟件綜合預(yù)測(cè)T細(xì)胞抗原表位,用ABCpred、COBEPro和BepiPredPred軟件綜合預(yù)測(cè)其B細(xì)胞抗原表位;采用DNA Star Protean、SignalP、TMHMM在線軟件和NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)分析其免疫學(xué)相關(guān)信息。結(jié)果 clpP2蛋白結(jié)構(gòu)豐富,含有較多潛在細(xì)胞毒性T細(xì)胞和輔助T細(xì)胞表位;也含有較多的B細(xì)胞線性和構(gòu)象優(yōu)勢(shì)表位,這些區(qū)域親水性、表面可能性和柔韌性指數(shù)都較高。結(jié)論 clpP2蛋白具有誘導(dǎo)免疫應(yīng)答的潛能,可以作為結(jié)核監(jiān)測(cè)、治療、預(yù)防的新靶點(diǎn)。
[Abstract]:Objective to predict the epitopes of casein proteolytic subunit 2clpP2of Mycobacterium tuberculosis, and to provide a new target for tuberculosis vaccine and drug development. Methods based on the amino acid sequence of clpP2 protein, the secondary structure was predicted by the bioinformatics software DNA Star, the homology model was established by SWISS-MODEL online software, and the T cell epitope was comprehensively predicted by VaxiPred software. The B cell epitopes were comprehensively predicted by ABCpred software, and the immunological information of B cell epitopes was analyzed by DNA Star protein SignalPherm online software and NCBI database. Results clpP2 protein was rich in structure, containing more potential cytotoxic T cells and auxiliary T cell epitopes, and also containing more B cell linear and conformational dominant epitopes, which had high hydrophilicity, surface possibility and flexibility index. Conclusion clpP2 protein has the potential to induce immune response and can be used as a new target for tuberculosis surveillance, treatment and prevention.
【作者單位】： 四川大學(xué)華西公共衛(wèi)生學(xué)院衛(wèi)生檢驗(yàn)與檢疫系;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(No.31570924) 四川省科技廳國(guó)際合作項(xiàng)目(No.2017HH0080)資助
【分類號(hào)】：R378.911

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本文編號(hào)：1790839