發(fā)布時間：2018-03-30 09:44

  本文選題：蓋塔病毒　切入點：分子進化　出處：《中國人獸共患病學報》2017年04期

【摘要】：目的了解世界各地分離蓋塔病毒分子進化特征及其時空遷徙。方法用Clustal X1.83、MegaAlign和Gene DOC軟件對測定的核苷酸和推測的氨基酸序列進行比較分析,用MEGA 6.0軟件繪制系統(tǒng)發(fā)生樹,采用BEAST v 1.8.1軟件包里的Bayesian Stochastic Search Variable Selection(BSSVS)程序進行蓋塔病毒的空間動力學分析。結(jié)果蓋塔病毒E2基因全長均為1 266nt,編碼422aa,其核苷酸和氨基酸同源性分別為94.5%~100%和96.4%~100%。病毒分子進化分析發(fā)現(xiàn),蓋塔病毒不存在蚊蟲,馬匹和豬等宿主動物和媒介的種屬和地域分布差異。生物信息學分析結(jié)果顯示,蓋塔病毒起源于馬來西亞,此后依次傳播至日本、中國、韓國以及蒙古國和俄羅斯等地。結(jié)論自1955年首次分離蓋塔病毒至2014年間分離的蓋塔病毒E2基因序列較為穩(wěn)定,未發(fā)現(xiàn)病毒基因組之間存在種屬及地域分布差異,并且該病毒已經(jīng)從熱帶地區(qū)傳播到歐亞大陸多個國家和地區(qū),因此加強蓋塔病毒及人畜動物感染的檢測和監(jiān)測至關(guān)重要。
[Abstract]:Objective to understand the molecular evolution characteristics and spatiotemporal migration of Gelta virus isolated from different parts of the world. Methods the nucleotides and deduced amino acid sequences were compared and analyzed with Clustal X1.83 MegaAlign and Gene DOC software, and the phylogenetic tree was plotted by MEGA 6.0 software. The spatial kinetic analysis of Gaeta virus was carried out by using the Bayesian Stochastic Search Variable selection (BSSVSs) program of BEAST v1.8.1. The results showed that the E2 gene of Gaeta virus was 1 266nt in length, encoding 422aa. The nucleotide and amino acid homology were 94.555% and 96.44%, respectively. Subevolution analysis found that, There are no differences in species and geographical distribution among host animals and vectors, such as mosquitoes, horses and pigs. Bioinformatics analysis shows that Gaeta virus originated in Malaysia and then spread to Japan, China, etc. Conclusion the E2 gene sequence of Gaeta virus isolated from 1955 to 2014 is relatively stable, and there are no species and regional distribution differences among the genomes of the virus. And the virus has been spread from the tropics to many countries and regions in Eurasia, so it is very important to strengthen the detection and surveillance of Gaeta virus and animal infection.
【作者單位】： 山西醫(yī)科大學;中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所/傳染病預防控制國家重點實驗室;山東理工大學;
【基金】：國家自然科學基金重大項目(No.81290342)資助~~
【分類號】：R373

【參考文獻】

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【共引文獻】

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本文編號：1685383