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湖南漢族人群16個Y-STR基因座遺傳多態(tài)性研究

發(fā)布時間:2018-03-13 11:12

  本文選題:法醫(yī)物證學(xué) 切入點:Y染色體短串聯(lián)重復(fù)序列(Y-STR) 出處:《中南大學(xué)》2012年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文


【摘要】:目的: 通過對湖南漢族人群16個Y-STR基因座進(jìn)行檢測,分析16個Y-STR基因座在湖南漢族人群中的基因頻率分布和相關(guān)遺傳學(xué)參數(shù),以及16個Y-STR組成的單倍型進(jìn)行調(diào)查分析,為本地區(qū)人群親緣關(guān)系鑒定和個體識別提供數(shù)據(jù)積累,促進(jìn)湖南地區(qū)漢族人群Y-STR數(shù)據(jù)庫的建立;豐富中國漢族群體遺傳學(xué)數(shù)據(jù)資料,為其他地區(qū)的法醫(yī)學(xué)鑒定提供參考數(shù)據(jù);為人類遺傳學(xué)研究和其它相關(guān)研究提供數(shù)據(jù)參考。 方法: 1.研究樣本的選擇:2008年至2009年10月間親緣關(guān)系鑒定案例中,出生于湖南省的漢族健康男性174人,經(jīng)詢問追溯其三代以內(nèi)均居住于湖南地區(qū),在征得其同意后,采集指血于濾紙上風(fēng)干保存?zhèn)溆谩?2.基因組DNA的提取:Chelex-100加蛋白酶K方法提取基因組DNA; 3.PCR擴(kuò)增:GeneAmp PCR System9700(Applied Biosystems) PCR儀、ABI AmpF Y-filerTM試劑盒擴(kuò)增Y染色體16個Y-STR基因座(DYS456、DYS389Ⅰ、DYS389Ⅱ、DYS390、DYS458、DYS19、DYS385、 DYS393、DYS391、DYS439、DYS635、DYS392、Y-GATA-H4、DYS437、 DYS438、DYS448); 4.電泳分離及基因分型:ABI-3130型DNA遺傳分析儀電泳分離和激光掃描分析;GeneMapper(?) ID Software v3.2軟件進(jìn)行基因分型。等位基因分型以試劑盒內(nèi)等位基因分型標(biāo)準(zhǔn)物為標(biāo)準(zhǔn)。 5.數(shù)據(jù)統(tǒng)計及分析:Excel軟件進(jìn)行Y-STR單倍型數(shù)據(jù)統(tǒng)計;基因多樣性(gene diversity, GD)采用公式GD=n(1-∑Pi2)/(n-1)(Pi為等位基因或單倍型頻率,n為樣本數(shù))計算;用ARLEQUIN3.1軟件進(jìn)行人群間比較;用MEGA4軟件構(gòu)建遺傳進(jìn)化樹。 結(jié)果: 1.16個基因座基因頻率分布在0.0143-0.7143之間,GD值在0.4476(DYS438)-0.8365(DYS385)之間,累積GD值為0.9992,多態(tài)性高。 2. ARIQUIN3.1軟件分析進(jìn)行人群間比較結(jié)果,與臺灣漢族、浙江漢族人群無顯著差異(P0.05),與山東漢族、寧夏回族、日本、韓國、青海藏族、拉薩市藏族,中國藏族、中國薩拉族、西伯利亞人群均有顯著差異(P0.05);湖南漢族人群Y-STR數(shù)據(jù)有其獨特性。對于湖南漢族人群法醫(yī)學(xué)鑒定有極高的應(yīng)用有價值。 3.用MEGA4.0分析軟件中UPGMA方法構(gòu)建的遺傳進(jìn)化樹顯示,湖南漢族、臺灣、浙江漢族、山東漢族聚為一群,寧夏回族、青海薩拉族人群聚為一簇,日本和韓國人群聚為一簇,不同地區(qū)的四個藏族人群聚為一簇,與其地理分布一致。提示Y染色體STR對于人類進(jìn)化和遷移歷史的研究有重要意義。 結(jié)論: 湖南漢族人群16個Y-STR基因座多態(tài)性高,適合應(yīng)用于湖南漢族人群親緣關(guān)系鑒定和個體識別,對促進(jìn)湖南地區(qū)漢族人群Y-STR數(shù)據(jù)庫的建立具有重大意義。為其他地區(qū)的法醫(yī)學(xué)鑒定及人群數(shù)據(jù)庫的建立提供數(shù)據(jù)參考。
[Abstract]:Objective:. By detecting 16 Y-STR loci in Hunan Han population, the frequency distribution and genetic parameters of 16 Y-STR loci in Hunan Han population were analyzed, and the haplotypes of 16 Y-STR loci were investigated. To provide data accumulation for genetic identification and individual identification, to promote the establishment of Y-STR database of Han population in Hunan, to enrich genetic data of Han population in China, and to provide reference data for forensic identification in other regions. To provide data reference for human genetics and other related research. Methods:. 1. Selection of the study sample: 174 healthy Han males born in Hunan Province were selected from 2008 to October 2009, who lived in Hunan Province within three generations, and obtained their consent. Collect blood and dry it on filter paper. 2.Genomic DNA extraction by Chelex-100 plus protease K method; 3.GeneAmp PCR System9700(Applied Biosystemes) ABI AmpF Y-filerTM kit was used to amplify 16 Y-STR loci of Y chromosome DYS456DYS389 鈪,

本文編號:1606128

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