分子動力學模擬:神經(jīng)元鈣傳感蛋白生理機制研究的新方向
本文選題:分子動力學模擬 切入點:多巴胺 出處:《中國組織工程研究》2017年20期 論文類型:期刊論文
【摘要】:背景:神經(jīng)元鈣傳感蛋白的生理功能及其發(fā)揮、結構折疊與解折疊的研究多采用實驗方法進行研究,并提出蛋白可能的作用機制模型及維持結構穩(wěn)定的可能因素,但實驗手段受到時間和空間分辨的局限以及蛋白結構的復雜性,研究受到一定的限制,導致實驗中提出的很多理論模型無法得以檢驗。分子動力學能夠從原子水平上觀察并解釋實驗現(xiàn)象,對理論假設和(或)模型進行驗證,為實驗提供參考和啟示;也可以預測新的結構和現(xiàn)象,為建立理論模型和作用機制提供依據(jù)。目的:分別對采用實驗方法和分子動力學模擬的方法對神經(jīng)元鈣傳感蛋白生理功能及其機制研究的進展進行梳理,并對今后的研究做一展望。方法:以"Neuronal Calcium Sensor-1 or Neuronal Calcium Sensor1 or Neuronal Calcium Sensor 1 or NCS-1"為主題詞,檢索Pub Med數(shù)據(jù)庫中有關神經(jīng)元鈣傳感蛋白研究的相關文獻,下載全文進行閱讀,排除與蛋白生理機制無關的文章,最終對72篇文獻進行歸納總結。結果與結論:(1)實驗中主要對神經(jīng)元鈣傳感蛋白在不同條件、不同位置中調控分泌、調控多巴胺D2受體、在肝細胞內調控腺苷A2A受體以及調控不同刺激下心肌細胞質和細胞核Ca~(2+)等方面提出相關理論模型;(2)分子動力學模擬從結構的視角,對維持蛋白結構穩(wěn)定的關鍵因素進行了分析和總結;(3)建議將兩種方法結合起來,不斷加深對蛋白生理機制的理解,共同推動研究的深入發(fā)展。
[Abstract]:Background: the physiological function of neuronal calcium sensing protein and its exertion, structural folding and unfolding are studied by experimental methods, and the possible mechanism model of protein and the possible factors to maintain structural stability are proposed. However, due to the limitation of time and space resolution and the complexity of protein structure, the research is limited to a certain extent. As a result, many of the theoretical models proposed in the experiment can not be tested. Molecular dynamics can observe and explain the experimental phenomena from the atomic level, verify the theoretical hypothesis and / or model, and provide reference and inspiration for the experiment. New structures and phenomena can also be predicted, Objective: to study the physiological function and mechanism of calcium sensing protein in neurons by means of experimental and molecular dynamics simulation. Methods: using "Neuronal Calcium Sensor-1 or Neuronal Calcium Sensor1 or Neuronal Calcium Sensor1 or NCS-1" as the subject word, we searched the related literature on neuronal calcium sensing protein in Pub Med database and downloaded the full text for reading. Results and conclusion in the experiment, calcium sensing protein of neurons regulated secretion, dopamine D2 receptor and dopamine D2 receptor in different conditions and different positions. In the aspects of regulation of adenosine A2A receptor in hepatocytes and regulation of myocardial cytoplasm and nuclear Ca~(2 under different stimuli, a new molecular dynamics model was proposed, I. e., molecular dynamics simulation from a structural perspective. The key factors to maintain the stability of protein structure were analyzed and summarized. It was suggested that the two methods should be combined to deepen the understanding of the physiological mechanism of protein and to promote the further development of the research.
【作者單位】: 上海師范大學體育學院;上海體育學院;
【基金】:上海體育學院研究生教育創(chuàng)新科研項目資助(yjscx2015003)~~
【分類號】:R338
【參考文獻】
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【共引文獻】
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,本文編號:1583824
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