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結(jié)核分枝桿菌higA基因的擴(kuò)增及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-03-07 01:29

  本文選題:分枝桿菌 切入點(diǎn):結(jié)核 出處:《重慶醫(yī)學(xué)》2017年14期  論文類型:期刊論文


【摘要】:目的對(duì)結(jié)核分枝桿菌的higA基因進(jìn)行擴(kuò)增,同時(shí)利用生物信息學(xué)方法分析其編碼蛋白的結(jié)構(gòu)和功能。方法從結(jié)核分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株H37Rv基因組DNA中擴(kuò)增higA基因,對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序。利用生物信息學(xué)網(wǎng)站和軟件分析higA蛋白的理化性質(zhì)、信號(hào)肽、空間結(jié)構(gòu)、抗原表位等。結(jié)果 higA基因擴(kuò)增產(chǎn)物與預(yù)期一致,大小為450bp。higA蛋白共149個(gè)氨基酸,理論等電點(diǎn)7.93,脂溶性系數(shù)94.30,不穩(wěn)定系數(shù)36.57,預(yù)測(cè)該蛋白為穩(wěn)定蛋白。higA蛋白無(wú)信號(hào)肽,含10個(gè)磷酸化位點(diǎn)和多個(gè)潛在的抗原表位。結(jié)論成功擴(kuò)增出結(jié)核分枝桿菌higA基因。
[Abstract]:Objective to amplify the higA gene of Mycobacterium tuberculosis and analyze the structure and function of its encoded protein by bioinformatics. Methods the higA gene was amplified from the genomic DNA of Mycobacterium tuberculosis standard strain H37Rv. The amplified products were sequenced. The physicochemical properties, signal peptide, spatial structure and antigen epitope of higA protein were analyzed by bioinformatics website and software. Results the amplified product of higA gene was in accordance with the expectation, with the size of 450 bp.higA protein of 149 amino acids. The theoretical isoelectric point was 7.93, the fat solubility coefficient was 94.30, and the instability coefficient was 36.57. It was predicted that the protein was a stable protein. HigA protein contained 10 phosphorylation sites and several potential antigen epitopes. Conclusion the higA gene of Mycobacterium tuberculosis was successfully amplified.
【作者單位】: 濰坊醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)學(xué)系;濰坊醫(yī)學(xué)院臨床學(xué)院病原生物學(xué)教研室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81470001,81170080)
【分類號(hào)】:Q811.4;R378.911

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本文編號(hào):1577378

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