2013~2014年我國輸入性B3基因型麻疹病毒的基因特征分析
本文選題:麻疹病毒 切入點(diǎn):病毒學(xué)監(jiān)測(cè) 出處:《病毒學(xué)報(bào)》2017年04期 論文類型:期刊論文
【摘要】:研究2013~2014年中國大陸分離到的輸入性B3基因型麻疹野毒株的N蛋白羧基端核苷酸和氨基酸特征。應(yīng)用MEGA6.0軟件對(duì)2013~2014年輸入我國的B3基因型麻疹病毒、GenBank下載的WHO參考株、2013~2014年全球流行的B3基因型麻疹病毒代表株和中國疫苗株瀘191(S191)構(gòu)建基于N蛋白COOH端450個(gè)核苷酸片段序列的親緣性關(guān)系樹、分析其核苷酸和氨基酸差異。13株B3基因型中國分離株間的核苷酸序列和氨基酸序列同源性分別為99.7%~100%和100%;與B3基因型WHO參考株的核苷酸和氨基酸同源性分別為96.6%~96.8%和95.3%~97.3%;與2013~2014年流行的B3基因型的麻疹野病毒代表株的核苷酸和氨基酸同源性分別在90.0%~100%和87.9%~100%;與S191的核苷酸和氨基酸同源性分別為93.3%~93.5%和87.2%。本研究對(duì)積累我國麻疹病毒分子流行病學(xué)基線數(shù)據(jù)具有很重要的意義,隨著我國進(jìn)入麻疹消除加速階段,將會(huì)監(jiān)測(cè)到更多的非本土基因型的輸入,需要進(jìn)一步加強(qiáng)病毒學(xué)監(jiān)測(cè),防止輸入性麻疹野病毒在我國擴(kuò)散和傳播。
[Abstract]:The characteristics of N-protein carboxyl terminal nucleotides and amino acids of imported wild type B 3 measles virus isolated from mainland China from 2013 to 2014 were studied. The WHO reference strain downloaded from GenBank of genotype B 3 virus imported into China from 2003 to 2014 was analyzed by MEGA6.0 software. A genetic relationship tree based on 450 nucleotide fragment sequences of N protein COOH terminal was constructed from the representative strain of measles virus of genotype B3 and the Chinese vaccine strain Lu191S191 from 2003 to 2014. The homology of nucleotide sequence and amino acid sequence among Chinese isolates were 99.777% and 100%, respectively, and the homology of nucleotide and amino acid with B3 genotype WHO reference strain were 96.66% and 96.8%, respectively. The nucleotide and amino acid homology of the wild measles virus representative strain of B3 genotype from 2013 to 2014 were 90.010% and 87.9%, respectively, and the nucleotide and amino acid homology with S191 were 93.33% and 87.2%, respectively. Epidemiological baseline data are of great significance, As China enters the accelerated stage of measles elimination more non-native genotypes will be detected and virological surveillance should be further strengthened to prevent the spread and transmission of imported wild measles viruses in China.
【作者單位】: 中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所衛(wèi)生部醫(yī)學(xué)病毒學(xué)和病毒病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室世界衛(wèi)生組織西太平洋區(qū)麻疹參比實(shí)驗(yàn)室;煙臺(tái)市疾病預(yù)防控制中心;安徽理工大學(xué)醫(yī)學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金課題(項(xiàng)目號(hào):81371791),題目:麻疹病毒血凝素蛋白分子進(jìn)化抗原變異及疫苗保護(hù)效果的影響~~
【分類號(hào)】:R373.11
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,本文編號(hào):1575375
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