本文關(guān)鍵詞：吸蟲CD59樣蛋白質(zhì)的生物信息學(xué)分析　出處：《中國(guó)病原生物學(xué)雜志》2017年05期 　論文類型：期刊論文

  更多相關(guān)文章： 吸蟲 CD樣蛋白 序列比對(duì) 進(jìn)化分析

【摘要】：目的對(duì)在寄生蟲中新發(fā)現(xiàn)的CD59樣蛋白序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析,為研究其功能奠定基礎(chǔ)。方法應(yīng)用生物信息學(xué)方法,從不同的數(shù)據(jù)庫(kù)中查找6種吸蟲(肝片吸蟲、大片吸蟲、日本血吸蟲、曼氏血吸蟲、華支睪吸蟲、麝貓后睪吸蟲)的CD59樣蛋白序列,應(yīng)用生物信息學(xué)軟件對(duì)獲得的序列進(jìn)行信號(hào)肽和GPI錨定蛋白的預(yù)測(cè)和分析,應(yīng)用Clustlw與人CD59序列進(jìn)行比對(duì)分析,并應(yīng)用Mrbayes構(gòu)建進(jìn)化樹。結(jié)果 6種吸蟲分別存在5-11種不同的CD59樣蛋白,大小98~137aa,富含半胱氨酸,均有LY6/CD59蛋白質(zhì)家族的保守膜體"CCXXXXCN"。與人CD59比對(duì),在10個(gè)半胱氨酸中有8個(gè)相互匹配。根據(jù)6種吸蟲中獲得的46條CD59樣蛋白的氨基酸序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,可將吸蟲分為6個(gè)不同的大群,其中有3個(gè)群均包含裂體科、片形科和后睪科吸蟲序列,另外3個(gè)為裂體科、片形科和后睪科吸蟲各自獨(dú)立成群。結(jié)論吸蟲中存在一類CD59樣蛋白家族,這類蛋白質(zhì)與人CD59有類似的結(jié)構(gòu),進(jìn)化分析提示該類蛋白質(zhì)功能具有多樣性。
[Abstract]:Objective to study the function of CD59 like protein in parasites by bioinformatics analysis. Methods Bioinformatics method was used. The CD59 like protein sequences of 6 kinds of trematodes (clonorchiasis, clonorchiasis, Schistosoma japonicum, Schistosoma mansoni, clonorchiasis sinensis, musk deer cat clonorchiasis) were found from different databases. The signal peptides and GPI anchoring proteins were predicted and analyzed by bioinformatics software, and Clustlw was compared with human CD59 sequences. Mrbayes was used to construct an evolutionary tree. Results there were 5-11 different CD59 like proteins in the 6 species of trematodes, 98137aa in size, rich in cysteine. The conserved membrane "CCXXXXCN" of LY6/CD59 protein family was compared with human CD59. The phylogenetic tree was constructed according to the amino acid sequences of 46 CD59 like proteins obtained from 6 trematodes. The trematodes can be divided into 6 different groups. Three of them contained the sequences of clonorchidae, laminae and clonorchidae, and the other three were cleft families, laminae and posterior clonorchidae. Conclusion there is a family of CD59 like proteins in trematodes. This kind of protein has similar structure to human CD59, and evolution analysis indicates that this kind of protein has a variety of functions.
【作者單位】： 廣西壯族自治區(qū)疾病預(yù)防控制中心寄生蟲病防制所;
【基金】：廣西壯族自治區(qū)疾病預(yù)防控制中心青年基金(201501)
【分類號(hào)】：Q811.4;R383.2
【正文快照】： ***CD59為約20ku的小蛋白,主要分布于人和哺乳動(dòng)物的器官和組織中。其主要功能是調(diào)節(jié)補(bǔ)體的活化,通過非特異性的與C8和C9耦合,抑制膜攻擊復(fù)合物(membrane attack complex,MAC)的形成,從而保護(hù)機(jī)體不受MAC的攻擊[1]。研究發(fā)現(xiàn)CD59在免疫調(diào)控和抗癌過程中起重要作用并參與調(diào)控T

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本文編號(hào)：1430220