本文關(guān)鍵詞：吸蟲CD59樣蛋白質(zhì)的生物信息學分析　出處：《中國病原生物學雜志》2017年05期 　論文類型：期刊論文

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【摘要】：目的對在寄生蟲中新發(fā)現(xiàn)的CD59樣蛋白序列進行生物信息學分析,為研究其功能奠定基礎(chǔ)。方法應用生物信息學方法,從不同的數(shù)據(jù)庫中查找6種吸蟲(肝片吸蟲、大片吸蟲、日本血吸蟲、曼氏血吸蟲、華支睪吸蟲、麝貓后睪吸蟲)的CD59樣蛋白序列,應用生物信息學軟件對獲得的序列進行信號肽和GPI錨定蛋白的預測和分析,應用Clustlw與人CD59序列進行比對分析,并應用Mrbayes構(gòu)建進化樹。結(jié)果 6種吸蟲分別存在5-11種不同的CD59樣蛋白,大小98~137aa,富含半胱氨酸,均有LY6/CD59蛋白質(zhì)家族的保守膜體"CCXXXXCN"。與人CD59比對,在10個半胱氨酸中有8個相互匹配。根據(jù)6種吸蟲中獲得的46條CD59樣蛋白的氨基酸序列構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,可將吸蟲分為6個不同的大群,其中有3個群均包含裂體科、片形科和后睪科吸蟲序列,另外3個為裂體科、片形科和后睪科吸蟲各自獨立成群。結(jié)論吸蟲中存在一類CD59樣蛋白家族,這類蛋白質(zhì)與人CD59有類似的結(jié)構(gòu),進化分析提示該類蛋白質(zhì)功能具有多樣性。
[Abstract]:Objective to study the function of CD59 like protein in parasites by bioinformatics analysis. Methods Bioinformatics method was used. The CD59 like protein sequences of 6 kinds of trematodes (clonorchiasis, clonorchiasis, Schistosoma japonicum, Schistosoma mansoni, clonorchiasis sinensis, musk deer cat clonorchiasis) were found from different databases. The signal peptides and GPI anchoring proteins were predicted and analyzed by bioinformatics software, and Clustlw was compared with human CD59 sequences. Mrbayes was used to construct an evolutionary tree. Results there were 5-11 different CD59 like proteins in the 6 species of trematodes, 98137aa in size, rich in cysteine. The conserved membrane "CCXXXXCN" of LY6/CD59 protein family was compared with human CD59. The phylogenetic tree was constructed according to the amino acid sequences of 46 CD59 like proteins obtained from 6 trematodes. The trematodes can be divided into 6 different groups. Three of them contained the sequences of clonorchidae, laminae and clonorchidae, and the other three were cleft families, laminae and posterior clonorchidae. Conclusion there is a family of CD59 like proteins in trematodes. This kind of protein has similar structure to human CD59, and evolution analysis indicates that this kind of protein has a variety of functions.
【作者單位】： 廣西壯族自治區(qū)疾病預防控制中心寄生蟲病防制所;
【基金】：廣西壯族自治區(qū)疾病預防控制中心青年基金(201501)
【分類號】：Q811.4;R383.2
【正文快照】： ***CD59為約20ku的小蛋白,主要分布于人和哺乳動物的器官和組織中。其主要功能是調(diào)節(jié)補體的活化,通過非特異性的與C8和C9耦合,抑制膜攻擊復合物(membrane attack complex,MAC)的形成,從而保護機體不受MAC的攻擊[1]。研究發(fā)現(xiàn)CD59在免疫調(diào)控和抗癌過程中起重要作用并參與調(diào)控T

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