廣東省南澳島廣州管圓線蟲遺傳多樣性調(diào)查
本文關(guān)鍵詞:廣東省南澳島廣州管圓線蟲遺傳多樣性調(diào)查 出處:《中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志》2017年02期 論文類型:期刊論文
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【摘要】:目的研究廣東省南澳島廣州管圓線蟲(Angiostronglus cantonensis)遺傳多樣性,分析其與中國不同地區(qū)分離株間的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系。方法 2015-2016年采用分層隨機抽樣法在南澳島抽取3個行政村(宮前村、金山村和六都村),選取55個采樣點。用鼠籠捕鼠,解剖鼠類收集廣州管圓線蟲成蟲,F(xiàn)場采集福壽螺(Pomacea canaliculata)和瑪瑙螺(Achatina fulica),從螺類收集Ⅲ期幼蟲,實驗室感染SD大鼠后收集成蟲。提取成蟲基因組DNA,PCR擴增核糖體DNA內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)2(internal transcribed spacer 2,ITS2)和線粒體DNA細(xì)胞色素氧化酶Ⅰ亞基(cytochrome c oxidase subunitⅠ,COⅠ)并測序,運用Clustal X1.83比對序列,Dna SP5.10分析其序列組成及遺傳多樣性。從Gen Bank上獲取浙江溫州(登錄號HQ540551.1)、廣東深圳(登錄號HQ540546.1)、臺灣花蓮(登錄號KF591125.1)等中國不同地區(qū)分離株的ITS2序列,運用Mega6.06基于Kumara雙參數(shù)模型計算遺傳距離,用鄰接法(NJ)和最大簡約法(MP)構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,分析各地區(qū)分離株的親緣關(guān)系。結(jié)果從南澳島共捕獲鼠類110只,廣州管圓線蟲感染陽性率為29.1%(32/110);分別檢測福壽螺和瑪瑙螺1 190只和24只,廣州管圓線蟲感染陽性率分別為6.1%(72/1 190)和83.3%(20/24)。PCR結(jié)果顯示,廣州管圓線蟲ITS2和COⅠ片段長度分別為693和1 174 bp,位點變異率分別為4.7%和1.0%。南澳島廣州管圓線蟲ITS2基因單倍型多樣性指數(shù)為0.927,核苷酸多樣性指數(shù)為0.007,平均核苷酸差異指數(shù)為4.549。COⅠ基因單倍型多樣性指數(shù)為0.440,核苷酸多樣性指數(shù)為0.004,平均核苷酸差異指數(shù)為3.743;贗TS2的分析結(jié)果顯示,南澳島與國內(nèi)其他地區(qū)分離株遺傳距離為0.181~0.775,NJ法MP法構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹基本一致,南澳島大部分蟲體序列與廣東深圳、福建福清、云南普洱、廣西南寧的分離株同屬一大分支,小部分則單獨聚成一支。結(jié)論南澳島廣州管圓線蟲種群內(nèi)存在一定程度的遺傳分化和遺傳多樣性,其蟲體可能存在多種類型和來源,但尚需進一步研究。
[Abstract]:Objective To study the genetic diversity of Angiostronglus helensis in southern Australia and to analyze its relationship with isolated strains in different regions of China . Conclusion There is a certain degree of genetic differentiation and genetic diversity in the population of Angiostrongylus taiwanensis in Nanao Island .
【作者單位】: 中國疾病預(yù)防控制中心寄生蟲病預(yù)防控制所 世界衛(wèi)生組織熱帶病合作中心 科技部國家級熱帶病國際聯(lián)合研究中心 衛(wèi)生部寄生蟲病原與媒介生物學(xué)重點實驗室;
【基金】:國家重點研發(fā)計劃項目(No.2016YFC1202000,2016YFC1202001) 國家科技重大專項(No.2012ZX10004-220,2008ZX10004-011)~~
【分類號】:R383.1
【正文快照】: areas in the country,such as Wenzhou in Zhejiang(Accession number HQ540551.1),Shenzhen in Guangdong(Accession number HQ540546.1),Hualian in the Region of Taiwan(Accession number KF591125.1),were obtainedfrom Gen Bank or published reports.The genetic dist
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,本文編號:1414865
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