本文關(guān)鍵詞：廈門市臨床分離的466株結(jié)核分枝桿菌基因分型研究

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【摘要】：目的了解廈門市結(jié)核分枝桿菌基因類型分布及主要流行基因群情況,并建立分型數(shù)據(jù)庫。方法采用實(shí)時(shí)熒光PCR法對廈門市2013-2015年分離到的466株結(jié)核分枝桿菌臨床分離株進(jìn)行菌株確認(rèn),然后采用間隔區(qū)寡核苷酸分型方法(spoligotyping)對其進(jìn)行基因分型。分型結(jié)果與Spol DB4數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,并使用Bionumeric6.6.4軟件進(jìn)行基因聚類分析。結(jié)果 466株菌均為結(jié)核分枝桿菌,基因分型分成96種基因型別,62種數(shù)據(jù)庫中有相應(yīng)的SIT編號(hào),34種為新的型別。97.64%(455/466)的菌構(gòu)成了15個(gè)基因簇。466株菌屬于7個(gè)基因家族及未定義家族,排在前三的分別為:Beijing(北京)家族60.09%(280/466)、T家族21.03%(98/466)、H家族5.58%(26/466)。結(jié)論廈門市結(jié)核分枝桿菌基因型別呈現(xiàn)多樣性,北京家族為主要的流行基因群。
【作者單位】： 廈門市疾病預(yù)防控制中心;廈門大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;廈門大學(xué)附屬中山醫(yī)院;
【基金】：國家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863計(jì)劃)“結(jié)核分枝桿菌的高通量溯源關(guān)鍵技術(shù)和產(chǎn)品的研究2014AA021401” 廈門市醫(yī)學(xué)中心/重點(diǎn)�？祈�(xiàng)目
【分類號(hào)】：R378.911
【正文快照】： 結(jié)核病是一種古老的疾病,對其病原菌的認(rèn)識(shí)是從分離培養(yǎng)等表型研究開始,到現(xiàn)在已經(jīng)從基因水平上對其進(jìn)行分類分型研究。結(jié)核分枝桿菌的分型研究發(fā)現(xiàn),染色體DNA多態(tài)性與其流行病學(xué)研究密切相關(guān),比如結(jié)核病暴發(fā)調(diào)查,追蹤和尋覓傳染源,社區(qū)傳播,耐多藥克隆株的播散,而其多態(tài)性與D

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1295278