本文關鍵詞：結核分枝桿菌Rv0867c基因的生物信息學分析

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【摘要】：目的應用生物信息學軟件分析結核分枝桿菌Rv0867c及其編碼的復蘇促進因子A(resuscitation-promoting factor A,Rpf A)的結構功能及抗原表位。方法從NCBI數(shù)據(jù)庫獲取Rv0867c的基因信息;應用ProParam預測Rpf A蛋白的理化性質;采用SignalP 4.0及TMHMM分析其信號肽及跨膜區(qū);利用在線分析Expasy工具分析蛋白二級結構,建立蛋白的三級結構模型;利用ABCpred、BepiPred 1.0Server以及SYFPEITHI、NetMHCIIpan 3.1Server分析蛋白的B細胞及T細胞抗原表位。結果 Rpf A蛋白具有407個氨基酸殘基,該蛋白N端存在信號肽序列,具有跨膜結構。二級結構中無規(guī)卷曲約占63.14%,結構疏松。三級結構同源建模與Rpf B具有高度相似的序列。Rv0867c具有潛在的B細胞抗原表位46-57、61-74、108-123、307-320及85-98等,T細胞抗原表位82-90、337-345、167-175、207-215及263-271等。結論生物信息學預測Rpf A具有良好的抗原表位,是診斷及治療結核的潛在候選因子。
【作者單位】： 濰坊醫(yī)學院醫(yī)學檢驗學系;濰坊醫(yī)學院病原生物學教研室;
【基金】：國家自然科學基金項目(No.81170080,81470001) 濰坊醫(yī)學院2011年科技創(chuàng)新前沿探索重點研究項目(No.K11TS1004)
【分類號】：R378.911
【正文快照】： *?**?結核病是由結核分枝桿菌(Mycobacterium tu-berculosis,MTB)引起的慢性傳染性疾病。全球結核報告中指出結核病在2014年奪去150萬人的生命,其中包括40萬HIV陽性結核病患者。全球有近1/3的人群感染MTB,其中約10%發(fā)展為活動性結核病,而大多數(shù)人為潛伏感染狀態(tài),此時MTB多以休

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1 梁丕;;人血管內皮生長因子的生物信息學分析[J];吉林醫(yī)學;2013年36期

2 李建強;李薇;張予超;高晶晶;趙祖波;楊俊杰;;中國EV71病毒VP1蛋白生物信息學分析[J];微生物學免疫學進展;2010年04期

3 聶佳瑩;楊致邦;唐磊;黃進;蔣英;;幽門螺桿菌感應蛋白CrdS的原核表達及生物信息學分析[J];中國生物制品學雜志;2013年09期

4 郭松;劉曉光;;普城沙雷氏菌rpoS基因的生物信息學分析[J];江蘇大學學報(醫(yī)學版);2013年06期

5 陳陽,李健峰,姬秋彥,閆玲梅,龍海亭,徐維明;幽門螺桿菌oipA基因的克隆及其生物信息學分析[J];世界華人消化雜志;2005年07期

6 白向陽;嚴玲玲;朱濤;盧運萍;周劍鋒;馬丁;;淋巴組織中新基因C14ORF44的生物信息學分析[J];基礎醫(yī)學與臨床;2007年10期

7 李良仁,王繼德,白楊,王群英;幽門螺桿菌OMP25基因的克隆、測序及生物信息學分析[J];廣東醫(yī)學;2005年06期

8 胡平;羅軍;張文炳;龍北國;;幽門螺桿菌基因hp0231和hp0410的克隆表達及生物信息學分析[J];熱帶醫(yī)學雜志;2007年04期

9 沈旭,薛建華,余長纓,羅海彬,秦磊,俞曉晶,陳靜,陳莉莉,熊斌,岳莉多,蔡建華,沈建華,羅小民,陳凱先,石鐵流,李亦學,胡庚熙,蔣華良;SARS病毒小信封蛋白E:克隆、表達、純化、CD測定和生物信息學分析(英文)[J];Acta Pharmacologica Sinica;2003年06期

10 ;[J];;年期

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1 陳鶴;基于生物信息學分析的弓形蟲致密顆粒蛋白GRA3的疫苗設計與體內驗證[D];安徽醫(yī)科大學;2014年

2 孫萃萍;多房棘球絳蟲HSP20蛋白的生物信息學分析、重組表達及泡球蚴的體外培養(yǎng)[D];蘭州大學;2015年

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本文編號：1277211