本文關(guān)鍵詞：結(jié)核分枝桿菌Rv0867c基因的生物信息學(xué)分析

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【摘要】：目的應(yīng)用生物信息學(xué)軟件分析結(jié)核分枝桿菌Rv0867c及其編碼的復(fù)蘇促進(jìn)因子A(resuscitation-promoting factor A,Rpf A)的結(jié)構(gòu)功能及抗原表位。方法從NCBI數(shù)據(jù)庫獲取Rv0867c的基因信息;應(yīng)用ProParam預(yù)測Rpf A蛋白的理化性質(zhì);采用SignalP 4.0及TMHMM分析其信號肽及跨膜區(qū);利用在線分析Expasy工具分析蛋白二級結(jié)構(gòu),建立蛋白的三級結(jié)構(gòu)模型;利用ABCpred、BepiPred 1.0Server以及SYFPEITHI、NetMHCIIpan 3.1Server分析蛋白的B細(xì)胞及T細(xì)胞抗原表位。結(jié)果 Rpf A蛋白具有407個(gè)氨基酸殘基,該蛋白N端存在信號肽序列,具有跨膜結(jié)構(gòu)。二級結(jié)構(gòu)中無規(guī)卷曲約占63.14%,結(jié)構(gòu)疏松。三級結(jié)構(gòu)同源建模與Rpf B具有高度相似的序列。Rv0867c具有潛在的B細(xì)胞抗原表位46-57、61-74、108-123、307-320及85-98等,T細(xì)胞抗原表位82-90、337-345、167-175、207-215及263-271等。結(jié)論生物信息學(xué)預(yù)測Rpf A具有良好的抗原表位,是診斷及治療結(jié)核的潛在候選因子。
【作者單位】： 濰坊醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)學(xué)系;濰坊醫(yī)學(xué)院病原生物學(xué)教研室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81170080,81470001) 濰坊醫(yī)學(xué)院2011年科技創(chuàng)新前沿探索重點(diǎn)研究項(xiàng)目(No.K11TS1004)
【分類號】：R378.911
【正文快照】： *?**?結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tu-berculosis,MTB)引起的慢性傳染性疾病。全球結(jié)核報(bào)告中指出結(jié)核病在2014年奪去150萬人的生命,其中包括40萬HIV陽性結(jié)核病患者。全球有近1/3的人群感染MTB,其中約10%發(fā)展為活動(dòng)性結(jié)核病,而大多數(shù)人為潛伏感染狀態(tài),此時(shí)MTB多以休

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