本文關(guān)鍵詞：人乳頭瘤病毒編碼蛋白的進(jìn)化分析

  更多相關(guān)文章： 人乳頭瘤病毒 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù) 親緣關(guān)系 結(jié)構(gòu)蛋白

【摘要】：目的構(gòu)建20種常見(jiàn)高低危型HPV編碼蛋白進(jìn)化樹(shù),分析其進(jìn)化關(guān)系。方法從NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取常見(jiàn)20種高低危型HPV的8種編碼蛋白完整氨基酸序列,通過(guò)MEGA6.0軟件中鄰位連接法(neighbor-joining,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)親緣進(jìn)化樹(shù),進(jìn)行進(jìn)化分析。結(jié)果低危型HPV6、11和42亞型單獨(dú)處于一分支上,并與高危型HPV分開(kāi)。在高危型中,HPV18、39、45、59和68亞型,HPV16、31和35亞型以及HPV33、52和58亞型的HPV基因組8種編碼蛋白均分別聚集在同一支上,而高危型HPV73的8種編碼蛋白在進(jìn)化樹(shù)上的位置均不固定。在構(gòu)建的E2和E6蛋白進(jìn)化樹(shù)中分歧支較多,結(jié)果較不可信。結(jié)論在蛋白進(jìn)化樹(shù)中常見(jiàn)低危型HPV均單獨(dú)處于一支,且與高危型HPV分開(kāi),12個(gè)高危型HPV分布于3個(gè)不同分支或位置不固定。
【作者單位】： 濟(jì)南大學(xué)山東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院;山東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院山東省醫(yī)藥生物技術(shù)研究中心;
【關(guān)鍵詞】： 人乳頭瘤病毒 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù) 親緣關(guān)系 結(jié)構(gòu)蛋白
【分類(lèi)號(hào)】：R373
【正文快照】： *?宮頸癌是女性最常見(jiàn)癌癥之一,在我國(guó)已取代乳腺癌成為女性死亡的首位惡性腫瘤[1-2]。研究表明,99%的宮頸癌與人類(lèi)乳頭瘤病毒(HPV)感染有關(guān)[3]。HPV是一種無(wú)包膜的雙鏈環(huán)狀DNA病毒,目前已發(fā)現(xiàn)的HPV亞型有200多種[4],根據(jù)HPV致病力的大小分為高危型與低危型[5-6]。高危型包括H

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