人乳頭瘤病毒編碼蛋白的進(jìn)化分析
本文關(guān)鍵詞:人乳頭瘤病毒編碼蛋白的進(jìn)化分析
更多相關(guān)文章: 人乳頭瘤病毒 系統(tǒng)進(jìn)化樹 親緣關(guān)系 結(jié)構(gòu)蛋白
【摘要】:目的構(gòu)建20種常見高低危型HPV編碼蛋白進(jìn)化樹,分析其進(jìn)化關(guān)系。方法從NCBI數(shù)據(jù)庫中獲取常見20種高低危型HPV的8種編碼蛋白完整氨基酸序列,通過MEGA6.0軟件中鄰位連接法(neighbor-joining,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)親緣進(jìn)化樹,進(jìn)行進(jìn)化分析。結(jié)果低危型HPV6、11和42亞型單獨處于一分支上,并與高危型HPV分開。在高危型中,HPV18、39、45、59和68亞型,HPV16、31和35亞型以及HPV33、52和58亞型的HPV基因組8種編碼蛋白均分別聚集在同一支上,而高危型HPV73的8種編碼蛋白在進(jìn)化樹上的位置均不固定。在構(gòu)建的E2和E6蛋白進(jìn)化樹中分歧支較多,結(jié)果較不可信。結(jié)論在蛋白進(jìn)化樹中常見低危型HPV均單獨處于一支,且與高危型HPV分開,12個高危型HPV分布于3個不同分支或位置不固定。
【作者單位】: 濟(jì)南大學(xué)山東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院;山東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院山東省醫(yī)藥生物技術(shù)研究中心;
【關(guān)鍵詞】: 人乳頭瘤病毒 系統(tǒng)進(jìn)化樹 親緣關(guān)系 結(jié)構(gòu)蛋白
【分類號】:R373
【正文快照】: *?宮頸癌是女性最常見癌癥之一,在我國已取代乳腺癌成為女性死亡的首位惡性腫瘤[1-2]。研究表明,99%的宮頸癌與人類乳頭瘤病毒(HPV)感染有關(guān)[3]。HPV是一種無包膜的雙鏈環(huán)狀DNA病毒,目前已發(fā)現(xiàn)的HPV亞型有200多種[4],根據(jù)HPV致病力的大小分為高危型與低危型[5-6]。高危型包括H
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中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 閻高峰;偽狂犬病病毒主要編碼蛋白研究進(jìn)展[J];青海畜牧獸醫(yī)雜志;1999年01期
2 鄢明華,劉長軍,王英珍,李秀麗;雞傳染性貧血病毒分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J];天津農(nóng)業(yè)科學(xué);2002年03期
3 許娜娜;趙福廣;;單純皰疹病毒UL42基因及其編碼蛋白的研究進(jìn)展[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2011年07期
4 何琴;汪銘書;程安春;;皰疹病毒UL16基因及其編碼蛋白的研究進(jìn)展[J];中國獸醫(yī)科學(xué);2011年08期
5 宋立華;端青;;呼腸病毒基因組片段S1編碼蛋白的研究進(jìn)展[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2006年03期
6 楊曉圓;程安春;汪銘書;;皰疹病毒US4基因及其編碼蛋白的研究進(jìn)展[J];中國獸醫(yī)科學(xué);2010年03期
7 羅丹丹;程安春;汪銘書;;皰疹病毒UL47基因及其編碼蛋白研究進(jìn)展[J];中國人獸共患病學(xué)報;2009年11期
8 史小紅;徐志文;郭萬柱;朱玲;漆信橋;王燕群;趙玲;;豬細(xì)胞巨化病毒四川株MCP基因克隆及其編碼蛋白的生物信息學(xué)分析[J];中國獸醫(yī)學(xué)報;2011年11期
9 華麗;朱玲;史小紅;梅淼;陳曉秋;;豬圓環(huán)病毒Ⅱ型SC株ORF3基因克隆及其編碼蛋白的生物信息學(xué)分析[J];基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué);2010年05期
10 彭光勇,姚X,許琳,徐江英,謝芳藝;愛潑斯坦-巴爾病毒潛伏期膜蛋白2AcDNA的克隆及序列分析[J];南京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報;2002年01期
中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 孫現(xiàn)超;李勇;青玲;楊水英;;大麥條紋花葉病毒中國株編碼蛋白之間相互作用分析[A];糧食安全與植保科技創(chuàng)新[C];2009年
2 藺文成;王永強(qiáng);李曉齊;曹紅;甘孟侯;鄭世軍;;雞傳染性法氏囊病毒分子致病機(jī)理的研究進(jìn)展[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會家畜傳染病學(xué)分會第八屆全國會員代表大會暨第十五次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2013年
3 劉寧;繆時英;張建超;宗書東;王琳芳;;人睪丸特異表達(dá)基因HSD-3.8及其編碼蛋白的功能研究[A];第九次全國生殖生物學(xué)學(xué)術(shù)研討會論文摘要集[C];2003年
4 張瑤;程安春;汪銘書;;皰疹病毒UL26.5基因及其編碼蛋白研究進(jìn)展[A];第四屆第九次全國學(xué)術(shù)研討會暨飼料和動物源食品安全戰(zhàn)略論壇論文集(下冊)[C];2008年
5 謝偉;程安春;汪銘書;;皰疹病毒UL31基因及其編碼蛋白研究進(jìn)展[A];第四屆第九次全國學(xué)術(shù)研討會暨飼料和動物源食品安全戰(zhàn)略論壇論文集(下冊)[C];2008年
6 曾志鋒;朱峰;楊丹;張欣;李月琴;鄒奕;李弘劍;周天鴻;;人巨細(xì)胞病毒UL49 ORF編碼蛋白的鑒定[A];中國遺傳學(xué)會第八次代表大會暨學(xué)術(shù)討論會論文摘要匯編(2004-2008)[C];2008年
7 于漣;黃耀偉;李建榮;宋坤華;葉偉成;;三株傳染性法氏囊病病毒A節(jié)段全長基因組結(jié)構(gòu)及其編碼蛋白的序列分析[A];新世紀(jì) 新機(jī)遇 新挑戰(zhàn)——知識創(chuàng)新和高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展(上冊)[C];2001年
8 石恬;蔣清蓉;朱玲;吳嬋;易悅;;豬細(xì)小病毒VP2基因及其編碼蛋白的研究進(jìn)展[A];第四屆中國畜牧科技論壇論文集[C];2009年
9 蒲陽;程安春;汪銘書;;皰疹病毒UL33基因及其編碼蛋白的研究進(jìn)展[A];第四屆第九次全國學(xué)術(shù)研討會暨飼料和動物源食品安全戰(zhàn)略論壇論文集(下冊)[C];2008年
10 于漣;黃耀偉;李建榮;;三株傳染性法氏囊病病毒A節(jié)段全長基因組結(jié)構(gòu)和編碼蛋白的序列分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會禽病學(xué)分會第十一次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2002年
中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 孫現(xiàn)超;大麥條紋花葉病毒中國株基因組克隆分析和編碼蛋白相互作用研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2006年
中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條
1 任瑞文;旋毛蟲新生幼蟲期特異性基因的篩選與表達(dá)[D];中國人民解放軍軍需大學(xué);2001年
2 譚老喜;BBTV DNA5編碼蛋白與寄主互作因子的篩選及初步鑒定[D];海南大學(xué);2013年
,本文編號:1118968
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