2013—2014年南京市流感病毒H3N2亞型血凝素分子遺傳特性分析
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【摘要】:2013—2014年南京市流感病原監(jiān)測(cè)系統(tǒng)分離到31株流感病毒H3N2亞型毒株,通過提取病毒RNA,反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(reverse transcriptase-polymerase chain reaction,RT-PCR)擴(kuò)增血凝素(hemagglutinin,HA)基因片段,進(jìn)行PCR產(chǎn)物純化、測(cè)序并分析其遺傳進(jìn)化特征。結(jié)果顯示,31株分離株與疫苗株A/Texas/50/2012之間的核苷酸和氨基酸進(jìn)化距離分別為0.010 2和0.012 1,核苷酸和氨基酸的同源性分別為97.9%~99.6%和97.2%~99.3%。遺傳進(jìn)化分析表明,分離株的HA基因分屬不同的進(jìn)化分支,3株2013年分離株屬3B基因型,3株2014年分離株屬3C.1基因型,2株2014年分離株屬3C.2b基因型,其余23株屬3C.3a基因型。與疫苗株相比,分離株的分子特征表現(xiàn)為發(fā)生N128A/T和P198S/A(去信號(hào)肽排列)氨基酸位點(diǎn)變異,均位于抗原決定簇B;分離株抗原決定簇上發(fā)生變異的位點(diǎn)共計(jì)24個(gè);7株分離株出現(xiàn)126NWT糖基化位點(diǎn),3株分離株糖基化位點(diǎn)45NSS和144NNS消失。結(jié)果提示,2013—2014年南京市流感病毒H3N2亞型的HA基因較疫苗株發(fā)生了較大變異,疫苗對(duì)病毒的預(yù)防效果需重新評(píng)估。
【作者單位】: 南京市疾病預(yù)防控制中心;江蘇省疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】: 流感病毒HN亞型 血凝素 分子特征
【基金】:國家自然科學(xué)基金(81501785) 江蘇省自然科學(xué)基金(BK20131450) 南京市醫(yī)學(xué)科技發(fā)展專項(xiàng)資金(YKK10129)
【分類號(hào)】:R373.13
【正文快照】: 自1968年以來,甲型H3N2亞型流感病毒一直是人類季節(jié)性流感的重要病原。在人群免疫壓力下,抗原漂移成為H3N2亞型變異的主要方式,也是持續(xù)引起流行的主要?jiǎng)右騕1]。甲型流感病毒抗原變異中,以血凝素(hemagglutinin,HA)基因最重要,分析HA基因序列可在分子水平了解甲型流感病毒的變
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,本文編號(hào):1060329
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