本文關(guān)鍵詞：銅綠假單胞菌毒力相關(guān)小RNA的篩選與鑒定

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【摘要】：小RNA在細(xì)菌的基因調(diào)控過(guò)程中具有重要的作用,然而目前在銅綠假單胞菌中僅發(fā)現(xiàn)了幾種有功能的小RNA.銅綠假單胞菌中存在著許多短片段RNA(100-250 bp),然而這些短片段RNA的功能尚不清楚.為了篩選與銅綠假單胞菌毒力相關(guān)的小RNA,結(jié)合生物信息學(xué)手段和實(shí)驗(yàn)檢測(cè)技術(shù)對(duì)這些短片段RNA進(jìn)行了靶點(diǎn)基因預(yù)測(cè)及相關(guān)表型研究.結(jié)果顯示:利用小RNA靶點(diǎn)預(yù)測(cè)軟件,篩選到23個(gè)毒力相關(guān)小RNA;通過(guò)構(gòu)建小RNA過(guò)表達(dá)質(zhì)粒,對(duì)這些小RNA進(jìn)行了高表達(dá)及相關(guān)的表型檢測(cè),發(fā)現(xiàn)Pant116對(duì)銅綠假單胞菌的3型分泌系統(tǒng)具有負(fù)調(diào)控作用.
【作者單位】： 南開(kāi)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 銅綠假單胞菌 小RNA 靶點(diǎn)預(yù)測(cè)軟件 型分泌系統(tǒng)
【基金】：天津市應(yīng)用基礎(chǔ)與前沿技術(shù)研究計(jì)劃(13JCQNJC09500) 南開(kāi)大學(xué)基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)青年及海外項(xiàng)目
【分類(lèi)號(hào)】：R378
【正文快照】： 0引言銅綠假單胞菌,為革蘭氏陰性菌,是一種重要的人類(lèi)條件致病菌,能夠引起嚴(yán)重的醫(yī)院獲得性感染,在免疫力低下人群及囊性肺纖維化病人中容易引起急性和慢性感染,其感染具有難治性與反復(fù)性特點(diǎn).在醫(yī)院獲得性呼吸系統(tǒng)感染以及泌尿系統(tǒng)感染中,銅綠假單胞菌的檢出率名列前茅[1].銅

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1007783