海南百歲老人中線粒體基因突變與女性長壽關聯(lián)性研究
本文關鍵詞:海南百歲老人中線粒體基因突變與女性長壽關聯(lián)性研究
【摘要】:背景和目的:研究指出在長壽老人中普遍保持能量代謝功能,提示線粒體是細胞/組織產(chǎn)生能量的重要器官,并且在人類長壽中有重要作用。有研究指出線粒體基因突變通過降低電子傳遞鏈的功能,減少自由基的生成,產(chǎn)生有益于長壽表型的作用。本研究以線粒體基因組為主要研究對象,使用第二代高通量測序技術(NGS)對17個來自海南萬寧縣的百歲老人的線粒體基因組進行測序,分析mtDNA突變與個體壽命之間的關系,為進一步探討長壽基因與信號傳導通路變化提供依據(jù)。方法:本研究中,我們通過評估長壽組和年輕組的線粒體DNA測序結果,對比兩組總SNP頻率,個體SNP頻率,SNPs產(chǎn)生效應,在特定mtDNA區(qū)域SNP累積。將變異結果用Burrows-Wheeler Aligner (BWA)比對到線粒體基因組上;用GATK軟件對SNP和InDel進行變異檢測,用ANNOVAR軟件同時關聯(lián)多個數(shù)據(jù)庫(如dbSNP, 1000g, ESP6500等)對變異結果進行注釋。結果:1:選取海南地區(qū),年齡在100歲以上(100±2歲)的女性老人17人。17例百歲老人中文盲17例(100.0%),農林牧漁勞動者13例(76.5%),婚姻狀況喪偶15例(88.2%),吸煙17例(100.0%,其中1例已戒煙),飲酒0例,飲茶5例(29.4%),大便1次/1-2d17例(100.0%);有親屬年齡85歲2例(11.7%),親屬年齡無85歲11例(64.7%),無法考證4例(23.5%);無重要疾病(心肺腦(老年癡呆))17例(100%);老年性耳聾0例(0%)2:所有mtDNA測序數(shù)據(jù)和rCRS對比。線粒體總長16596bp,在794個位點上總共發(fā)生355個不同的單堿基突變SNV.檢測到的突變類型大多數(shù)是轉換(93.1%的實驗組和81.7%的對照組),而顛換、插入和缺失相對較少。3:調查SNP分布顯示不同。4:在實驗組內發(fā)現(xiàn)11個突變位點,所有的實驗樣本在這些位點上都發(fā)生突變;5:在實驗組內發(fā)現(xiàn)9個突變基因,所有的實驗樣本在這些基因上都發(fā)生突變;6:D-loop突變型在實驗組內的頻率顯著高于對照組(P=0.021);移碼突變在對照組內的頻率顯著高于實驗組(P=0.0000);7:線粒體完整性未發(fā)現(xiàn)異常;8:發(fā)現(xiàn)了3個mtSNPs(m.310TC或TTC,m.3105ACA,m.4048GA)與長壽關聯(lián),其中非同義突變m.4048GA(Asp248Asn)在功能上可能起重要的保護作用。9:發(fā)現(xiàn)4個基因或區(qū)域(RNR1, RNR2, "RNR1,TRNF", "TRNP;CYTB,TRNT")在實驗組和對照組之間存在顯著差異。結論:1.MT-RNR1基因突變可能與百歲老人聽力良好相關,MT-RNR2基因突變可能與百歲老人認知能力較強相關;2.ND1在4048位點突變可能減少活性氧簇的產(chǎn)生,與百歲老人長壽相關;3.線粒體基因組突變和線粒體氧化磷酸化功能,能量狀態(tài)良好,與長壽和衰老相關。
【關鍵詞】:長壽 線粒體基因 突變 線粒體氧化磷酸化
【學位授予單位】:中國人民解放軍醫(yī)學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R339.36
【目錄】:
- 英文縮寫詞表5-7
- 中文摘要7-9
- 英文摘要9-11
- 前言11-14
- 對象和方法14-18
- 結果18-27
- 討論27-30
- 結論30-31
- 參考文獻31-37
- 文獻綜述37-57
- 參考文獻49-57
- 碩士期間發(fā)表文章57-58
- 致謝58
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