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基于基因分型測(cè)序(GBS)的檫木景觀遺傳學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2024-04-02 00:03
  檫木(Sassafras tzumu.Hemsl),隸屬于樟科(Lauraceae)檫木屬(Sassafras)。主要分布在我國(guó)大陸地區(qū)和北美,材料用途廣泛。目前對(duì)于檫木的研究集中在探究其生理生化特性方面。作為在長(zhǎng)江以南地區(qū)廣泛分布的物種,將檫木作為代表,利用檫木的分布信息研究該地區(qū)物種的分布及預(yù)測(cè)其應(yīng)對(duì)氣候變化的響應(yīng)對(duì)于物種的保護(hù)等方面具有重要的參考意義。此外,結(jié)合基因分型測(cè)序技術(shù)(GBS)和景觀遺傳學(xué)的研究,能夠揭示其代表性類群的遺傳結(jié)構(gòu)和譜系地理分布之間的關(guān)系,解析不同進(jìn)化力量對(duì)物種的影響,并利用此關(guān)聯(lián)預(yù)測(cè)未來(lái)氣候變化對(duì)該物種的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性的影響。本研究通過(guò)13個(gè)群體共計(jì)106個(gè)個(gè)體的基因分型測(cè)序的結(jié)果,探究檫木的遺傳多樣性和景觀遺傳學(xué)特性。使用Biomod2組合模型對(duì)檫木的分布進(jìn)行模擬,組合模型模擬結(jié)果的AUC平均值大于0.89,表明預(yù)測(cè)結(jié)果良好。影響其分布的生物氣候因子按照影響大小依次為:晝夜溫差月均值(Bio02)、年平均溫度(Bio01)、溫度季節(jié)變化(Bio04)和最干月降水量(Bio14)。模型結(jié)果顯示,在基準(zhǔn)氣候條件下,檫木的分布主要集中在長(zhǎng)江以南大部分地區(qū)...

【文章頁(yè)數(shù)】:69 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖2.1檫木分布點(diǎn)示意圖

圖2.1檫木分布點(diǎn)示意圖

233個(gè)分布點(diǎn),以下載自國(guó)家基礎(chǔ)地理信息系統(tǒng)網(wǎng)站(http://ngcc.sbsm.gov.cn)的中國(guó)行政區(qū)劃圖和下載自寒區(qū)旱區(qū)科學(xué)數(shù)據(jù)中心(http://westdc.westgis.ac.cn/)的數(shù)字高程模型作為底圖,將233個(gè)分布點(diǎn)可視化表達(dá),檫木分布點(diǎn)見(jiàn)圖2.1。圖2....


圖2.3物種分布模型概述

圖2.3物種分布模型概述

通過(guò)R語(yǔ)言軟件包Biomod2(https://cran.r-project.org/web/packages/biomod2/)來(lái)對(duì)檫木不同時(shí)期的適宜生境進(jìn)行預(yù)測(cè)(圖2.3),Biomod2(BiodiversityModelling2)是由歐盟FP5....


圖3.3基準(zhǔn)氣候條件下檫木適宜生境Fig.3.3SuitablehabitatforS.tzumuunderbaselineclimatecondition

圖3.3基準(zhǔn)氣候條件下檫木適宜生境Fig.3.3SuitablehabitatforS.tzumuunderbaselineclimatecondition

此外,包括海拔和土壤酸堿度在內(nèi)的其他環(huán)境因子對(duì)模型圖3.2各個(gè)環(huán)境變量對(duì)檫木分布的重要性.2ImportanceofeachenvironmentalvariableforthedistributionofS.tzum適宜生境0.000.100.200.....


圖3.6不同氣候情景下檫木分布質(zhì)心變化圖

圖3.6不同氣候情景下檫木分布質(zhì)心變化圖

28圖3.6不同氣候情景下檫木分布質(zhì)心變化圖Fig.3.6ChangesincentroiddistributionofS.tzumuunderdifferentclimaticscenarios3.2景觀遺傳學(xué)研究結(jié)果3.2.1遺傳結(jié)構(gòu)與遺傳多樣....



本文編號(hào):3945508

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