紫莖澤蘭(Ageratina adenophora)是危害嚴(yán)重的惡性雜草,自從上世紀(jì)由滇緬邊境傳入云南省,現(xiàn)己入侵多個(gè)省份,東至重慶,西至石棉,北至瀘定,西南地區(qū)入侵較為嚴(yán)重。研究表明,紫莖澤蘭易沿道路和河流進(jìn)行快速傳播和擴(kuò)散。本文選取昆明海口林場的紫莖澤蘭為研究對象,通過野外調(diào)查,并結(jié)合SSR、AFLP、RAD-seq測序3種分子標(biāo)記技術(shù),探究不同路域景觀紫莖澤蘭種群的遺傳多樣性和群基因組結(jié)構(gòu)特征,解析道路密度、景觀指數(shù)、景觀阻力與紫莖澤蘭種群遺傳多樣性的關(guān)系,并分析不同森林景觀格局對紫莖澤蘭分布、擴(kuò)散、基因流的影響,為紫莖澤蘭的控制和防除提供科學(xué)依據(jù)和參考。主要結(jié)果如下:1.紫莖澤蘭入侵受森林群落喬木層的影響較為顯著,喬木層的蓋度、物種豐富度越大,紫莖澤蘭入侵的程度越輕;森林類型對紫莖澤蘭的分布無顯著影響。距道路的距離是影響天然林下紫莖澤蘭分布最重要的因子,但對人工林無顯著影響;2.采用8對SSR多態(tài)性引物和4對AFLP引物對25個(gè)種群600個(gè)個(gè)體進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果全為單態(tài)性。挑選不同森林景觀類型下的l10個(gè)紫莖澤蘭種群共50個(gè)個(gè)體進(jìn)行RAD-seq測序,SNPs多態(tài)性百分比(PPB)=63.854%-68.585%,期望雜合度(He)=0.25672-0.26227,主要等位基因的平均頻率(P)=0.782-0.785,觀察雜合度(Ho)=0.565-0.571,核苷酸多樣性(Pi)=0.2908-0.3034,種群間遺傳分化最大的是槲櫟林和沿路種群(POP24),種群間遺傳分化最小的是沿路種群(POP3)和干香柏林(POP5)。3.采用ADMIXTURE軟件,對10個(gè)種群的SNPs多態(tài)進(jìn)行模型聚類,10個(gè)種群分為2個(gè)景觀類型,一類為常綠闊葉林和落葉櫟林原生性較強(qiáng)的森林類型種群,另一類為針葉林、人工林、沿路種群干擾性較強(qiáng)的類型。4.不同道路密度等級下,紫莖澤蘭種群的多態(tài)位點(diǎn)百分比、核苷酸多樣性、主要等位基因的平均頻率、期望雜合度均無顯著性差異,紫莖澤蘭種群的觀察雜合度有顯著性差異。景觀格局指數(shù)與種群遺傳多樣性指數(shù)無顯著性相關(guān)。不同景觀阻力對紫莖澤蘭種群的多態(tài)位點(diǎn)百分比、主要等位基因的平均頻率、核苷酸多樣性、期望雜合度、觀察雜合度均無顯著影響。局域尺度上,景觀格局對紫莖澤蘭的種群遺傳多樣性無顯著影響。
【學(xué)位單位】：云南大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位年份】：2019
【中圖分類】：S451
【部分圖文】：

采樣示滋圈

八堿基酶在基因組中出現(xiàn)的頻最低，其是六堿基酶，出現(xiàn)頻率最??高的為四堿基酶。選擇限制性內(nèi)切酶需要對目標(biāo)物種的參考基因組進(jìn)行全面分析，根據(jù)??基因組的ＧＣ含量、重復(fù)序列等信息選擇合適的酶（王洋坤，２０１３）。??對基因組ＤＮＡ樣品進(jìn)行限制性酶切這一步是整個(gè)實(shí)驗(yàn)最為重要的一步，酶切效果??對ＲＡＤ簡化基因組測序的好壞起到關(guān)鍵性作用，并決定了后續(xù)實(shí)驗(yàn)的進(jìn)行，因此，在??進(jìn)行實(shí)驗(yàn)時(shí)，實(shí)驗(yàn)操作一定要規(guī)范，在加酶切體系時(shí)，酶不能放在外面，要一直將酶放??在冰盒里，防止酶失活，并且最后將酶加入酶切體系。??２．３．２測序文庫的構(gòu)建??首先，酶切檢驗(yàn)合格的ＤＮＡ樣品，把Ｐ１接頭加在酶切后的基因組片段兩端；然后，??將加好Ｐ１接頭的序列用Ｃｏｖａｒｉｓ破碎機(jī)隨機(jī)打斷。通過瓊脂糖凝膠電泳檢測，選擇符合??大小的目的條帶，一般選擇目標(biāo)條帶在３００？７００?ｂｐ。再在ＤＮＡ片段連接上Ｐ２接頭。??對這樣的混合ＤＮＡ進(jìn)行ＰＣＲ擴(kuò)增。然后使用Ｑ－ＰＣＲ方法對有效濃度進(jìn)行精準(zhǔn)定量，??以保證文庫質(zhì)量。??

圖２－３研究區(qū)域及樣地位置示意圖??Ｆｉｇ．?２－３?Ｔｈｅ?ｓｔｕｄｙ?ａｒｅａ?ａｎｄ?ｓａｍｐｌｅ?ｓｋｅｔｃｈ?ｍａｐ??２２??
【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：2867957