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土壤抗生素脅迫下蚯蚓腸道細(xì)菌生態(tài)功能多樣性研究

發(fā)布時(shí)間:2023-05-19 02:07
  土壤中新型大分子生物污染物ARGs已對(duì)生態(tài)環(huán)境安全和人體健康帶來(lái)顯著危害,準(zhǔn)確表征土壤環(huán)境中殘存抗生素的生態(tài)毒理學(xué)風(fēng)險(xiǎn)和機(jī)制對(duì)于管制土壤中ARGs的風(fēng)險(xiǎn)具有非常重要的意義。蚯蚓是表征土壤中外源污染物污染程度的經(jīng)典模式生物,其腸道對(duì)土壤中各種污染的轉(zhuǎn)化和降解起著重要的作用,同時(shí)對(duì)抗生素、抗生素抗性細(xì)菌和抗生素抗性基因的攝取使腸道成為潛在的有利于抗生素抗性基因在土壤中傳播的微環(huán)境。然而從蚯蚓腸道菌群活性的角度分析土壤抗生素潛在負(fù)面影響的研究較少。因而本研究從抗生素對(duì)蚯蚓的毒理效應(yīng)、蚯蚓腸道細(xì)菌多樣性、蚯蚓腸道菌群對(duì)不同濃度四環(huán)素的響應(yīng)以及蚯蚓腸道與土壤菌群的四環(huán)素抗性特征四個(gè)方面進(jìn)行闡釋,具體結(jié)果如下:(1)在抗生素脅迫下,共篩選出腸道可培養(yǎng)抗生素抗性細(xì)菌87株,涉及1個(gè)門(mén)(厚壁菌門(mén))和7個(gè)屬(芽孢桿菌屬、土壤芽孢桿菌屬、Bhargavaea、類芽孢桿菌屬、芽孢八疊球菌屬、賴氨酸芽胞桿菌屬和葡萄球菌屬),其中芽孢桿菌屬為優(yōu)勢(shì)種;不同處理?xiàng)l件下蚯蚓腸道內(nèi)可培養(yǎng)抗生素抗性細(xì)菌的多樣性從多到少依次為四環(huán)素-磺胺嘧啶>磺胺嘧啶>四環(huán)素。高通量測(cè)序技術(shù)比傳統(tǒng)的平板培養(yǎng)方法在蚯蚓腸道中檢測(cè)...

【文章頁(yè)數(shù)】:100 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語(yǔ)
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 蚯蚓腸道細(xì)菌群落組成
        1.1.1 蚯蚓腸道細(xì)菌群落組成特點(diǎn)
        1.1.2 蚯蚓腸道和土壤細(xì)菌群落組成
        1.1.3 蚯蚓腸道和蚓糞菌群組成差異
    1.2 抗生素對(duì)蚯蚓的急性毒性
    1.3 蚯蚓腸道細(xì)菌對(duì)土壤中抗生素的解毒作用
    1.4 蚯蚓腸道細(xì)菌群落的功能基因多樣性
    1.5 研究的目的、意義和技術(shù)路線
        1.5.1 研究目的和意義
        1.5.2 技術(shù)路線
第二章 蚯蚓腸道細(xì)菌群落的抗生素抗性特征研究
    2.1 材料與方法
        2.1.1 蚯蚓的獲取及前處理
        2.1.2 蚯蚓腸道可培養(yǎng)內(nèi)生細(xì)菌的分離篩選
        2.1.3 蚯蚓腸道微生物群落結(jié)構(gòu)分析
        2.1.4 數(shù)據(jù)分析
    2.2 結(jié)果與討論
        2.2.1 蚯蚓腸道總細(xì)菌群落
        2.2.2 蚯蚓腸道中抗生素抗性細(xì)菌
        2.2.3 蚯蚓腸道可培養(yǎng)抗性細(xì)菌的抗性基因
    2.3 本章小結(jié)
第三章 蚯蚓對(duì)土壤中四環(huán)素脅迫的急性毒性研究
    3.1 材料與方法
        3.1.1 蚯蚓獲取
        3.1.2 濾紙接觸實(shí)驗(yàn)
        3.1.3 蚯蚓土培實(shí)驗(yàn)
        3.1.4 樣品獲取
        3.1.5 四環(huán)素檢測(cè)
        3.1.6 酶活性測(cè)定
        3.1.7 流式細(xì)胞儀分析
        3.1.8 數(shù)據(jù)分析
    3.2 結(jié)果與討論
        3.2.1 蚯蚓腸道四環(huán)素的富集
        3.2.2 蚯蚓抗氧化酶活性的分析
        3.2.3 四環(huán)素對(duì)蚯蚓體腔細(xì)胞的損害
    3.3 本章小結(jié)
第四章 蚯蚓腸道菌群對(duì)土壤中不同濃度四環(huán)素脅迫的響應(yīng)
    4.1 材料與方法
        4.1.1 蚯蚓采集
        4.1.2 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
        4.1.3 腸道內(nèi)容物獲取
        4.1.4 蚯蚓腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)分析
        4.1.5 蚯蚓腸道細(xì)菌ARGs和DNGs的相對(duì)表達(dá)量
        4.1.6 數(shù)據(jù)分析
    4.2 結(jié)果與討論
        4.2.1 四環(huán)素對(duì)蚯蚓腸道菌群結(jié)構(gòu)和功能的影響
        4.2.2 四環(huán)素脅迫下蚯蚓腸道ARGs和DNGs的表達(dá)規(guī)律
        4.2.3 蚯蚓腸道菌群及基因與四環(huán)素的相關(guān)性
        4.2.4 蚯蚓腸道菌群與抗氧化酶活性的耦合分析
    4.3 本章小結(jié)
第五章 蚯蚓腸道與土壤微生物四環(huán)素抗性特征研究
    5.1 材料與方法
        5.1.1 樣品采集
        5.1.2 實(shí)驗(yàn)設(shè)置
        5.1.3 樣品獲取
        5.1.4 宏基因組測(cè)序
        5.1.5 基因預(yù)測(cè)與生物信息學(xué)分析
        5.1.6 數(shù)據(jù)分析
    5.2 結(jié)果與討論
        5.2.1 蚯蚓腸道菌群與土壤抗性微生物及ARGs的關(guān)聯(lián)性
        5.2.2 蚯蚓腸道菌群對(duì)土壤多功能物種的影響
        5.2.3 蚯蚓腸道菌群及土壤微生物的耐藥機(jī)制
    5.3 本章小結(jié)
第六章 全文結(jié)論及研究展望
    6.1 全文結(jié)論
    6.2 主要?jiǎng)?chuàng)新點(diǎn)
    6.3 不足之處及研究展望
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文



本文編號(hào):3819447

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