大學(xué)從事博士后研究工作。1988年回國，同年晉升為教授。1993年聘為博士生導(dǎo)師。龔曉南教授在復(fù)合地基和地基處理理論及工程實踐，以及地基處理技術(shù)的普及推廣、基坑圍護設(shè)計、基礎(chǔ)工程施工環(huán)境效應(yīng)及對策、土木工程教育和人才培養(yǎng)等方面作出了突出的貢獻，2002年獲茅以升土力學(xué)及基礎(chǔ)工程大獎。 1992年出版了國內(nèi)外第一部復(fù)合地基專著《復(fù)合地基》,首次提出廣義復(fù)合地基理論框架。2002年出版《復(fù)合地基理論及工程應(yīng)用》，完善了廣義復(fù)合地基理論體系。自1991年起將研究成果應(yīng)用于多項工程。在廣義復(fù)合地基方面取得的創(chuàng)新成果已被業(yè)界廣泛引用。《廣義復(fù)合地基理論及工程應(yīng)用》項目2003年通過鑒定，，總體研究成果處于國際領(lǐng)先水平。參加一系列軟土地基處理工程的咨詢與設(shè)計工作。1984年參加組織編寫《地基處理手冊》，1990年創(chuàng)辦《地基處理》刊物， 2000年主編《地基處理手冊》第二版，2004年主編《地基處理技術(shù)發(fā)展與展望》，長期主持中國土木工程學(xué)會土力學(xué)及巖土工程分會地基處理學(xué)術(shù)委員會工作。主編《深基坑工程設(shè)計施工手冊》（1998），主持多項深、大基坑工程設(shè)計。在《深埋重力—門架式圍護結(jié)構(gòu)性狀研究與應(yīng)用》和《軟土地基基坑工程環(huán)境效應(yīng)和控制方法》等領(lǐng)域的研究成果提高了我國基坑工程設(shè)計水平。主持中國建筑學(xué)會建筑施工學(xué)術(shù)委員會基坑工程專業(yè)委員會工作。作為浙江大學(xué)分項目負責(zé)人主持國家自然科學(xué)基金重點項目《受施工擾動影的土體環(huán)境穩(wěn)定理論和控制方法》研究工作。該項目獲2003年教育部科技進步一等獎。主持解決各地多項工程因基礎(chǔ)工程施工造成的環(huán)境影響問題。長期從事軟粘土地基性狀研究，將本構(gòu)理論、滑移線場理論和極限分析法在土工中的應(yīng)用融為一體，編著《土塑性力學(xué)》, 促進了塑性理論在土工中的應(yīng)用。著《高等土力學(xué)》、主編《土工計算機分析》。主持多項工程的加固和糾傾工作。自1984年相繼開設(shè)了高等土力學(xué)、土塑性力學(xué)、工程材料本構(gòu)方程、計算土力學(xué)、地基處理技術(shù)和廣義復(fù)合地基理論等研究生課程，相繼出版的教材得到廣泛好評。已指導(dǎo)碩士58名，博士58名。發(fā)表刊物論文和專題報告等300余篇，出版著作26部。