急性髓系白血病潛在生物標志物的轉(zhuǎn)錄組學分析
發(fā)布時間:2022-10-19 16:46
研究目的急性髓系白血。ˋcute myeloid leukemia,AML)是一種血液系統(tǒng)惡性腫瘤,當前各種治療雖取得一定進展,仍存在諸多問題。本研究通過臨床生物信息學分析方法對AML患者轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù)進行分析,以期找到與AML發(fā)生、發(fā)展和預(yù)后相關(guān)的生物標志物,從而為AML的基礎(chǔ)研究和臨床治療提供指導(dǎo)。研究方法以“acute myeloid leukemia”為關(guān)鍵詞,在GEO、TCGA數(shù)據(jù)庫中檢索相關(guān)數(shù)據(jù)。從GEO數(shù)據(jù)庫下載符合要求的AML實驗數(shù)據(jù),通過差異分析、GO功能富集分析、通路富集分析、蛋白質(zhì)相互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建得到mRNA核心基因;從TCGA數(shù)據(jù)庫下載符合要求的RNA測序數(shù)據(jù),從中提取miRNA和lncRNA,并分別進行差異分析。使用miRcode數(shù)據(jù)庫對差異lncRNA與差異miRNA進行比對,得到差異miRNA與差異lncRNA對應(yīng)關(guān)系。再通過miRTarBase、TargetScan、miRDB數(shù)據(jù)庫檢索miRNA靶向的mRNA,以3個數(shù)據(jù)庫共有的mRNA作為靶定的mRNA,去重處理后,將GEO數(shù)據(jù)庫分析得到的差異mRNA與miRNA靶定的mRNA的交集作為miRNA最終的...
【文章頁數(shù)】:51 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
1 引言
1.1 問題的提出與研究意義
1.2 國內(nèi)外相關(guān)研究現(xiàn)狀
1.3 研究方法
1.4 數(shù)據(jù)來源與處理
1.5 論文框架
1.6 論文的創(chuàng)新點
2 mRNA核心基因篩選
2.1 材料與方法
2.2 結(jié)果
2.3 小結(jié)
3 ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
3.1 材料與方法
3.2 結(jié)果
3.3 小結(jié)
4 生存分析
4.1 材料與方法
4.2 結(jié)果
4.3 小結(jié)
5 討論與結(jié)論
5.1 討論
5.2 研究結(jié)論
5.3 建議
5.4 研究不足與展望
參考文獻
致謝
在學期間承擔/參與的科研課題與研究成果
個人簡歷
【參考文獻】:
期刊論文
[1]“微移植”治療急性髓系白血病的研究進展[J]. 王璇,郭樹霞. 中國民康醫(yī)學. 2018(18)
[2]自體造血干細胞移植對急性髓系白血病的治療進展[J]. 陳永升,黃琴,尹曉林. 中國臨床新醫(yī)學. 2018(07)
[3]淺談臨床生物信息學在臨床醫(yī)學教育中的作用及初步實踐[J]. 張皓旻,楊波,郭斌,于睿莉,遲小華,陳紅飛,席義博,陳錫勐,賀培鳳,盧學春. 轉(zhuǎn)化醫(yī)學雜志. 2018(03)
[4]miRNA調(diào)控血液發(fā)育機制的研究進展[J]. 廖曉棠. 生物化工. 2018(01)
[5]白血病融合基因及檢測方法研究進展[J]. 肖恒,李守霞. 醫(yī)學綜述. 2015(22)
[6]白血病中融合基因的研究進展[J]. 張陽,鄭智博,賈學淵,孫文靖,金焰. 國際遺傳學雜志. 2015 (04)
[7]白血病形成中JAK/STAT信號通路的持續(xù)激活[J]. 李英華,羅建民. 國際病理科學與臨床雜志. 2006(05)
[8]造血干細胞移植治療白血病的某些進展[J]. 黃文榮,達萬明. 內(nèi)科急危重癥雜志. 2005(03)
[9]自體造血干細胞移植治療急性白血病患者143例療效分析[J]. 馮四洲,魏嘉璘,鄒德惠,王玫,楊棟林,閆章松,王津雨,劉慶國,張桂新,劉春,邱錄貴,嚴文偉,韓明哲. 內(nèi)科急危重癥雜志. 2005(03)
[10]Stat1蛋白在急性髓系細胞白血病患者外周血白細胞中的激活[J]. 劉峰,陳元玉,李冠武,溫博貴. 癌變.畸變.突變. 2004(04)
碩士論文
[1]miR-20b及miR-363介導(dǎo)AML預(yù)后相關(guān)性分析與臨床驗證[D]. 李敏曦.中國醫(yī)科大學 2018
本文編號:3693735
【文章頁數(shù)】:51 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
1 引言
1.1 問題的提出與研究意義
1.2 國內(nèi)外相關(guān)研究現(xiàn)狀
1.3 研究方法
1.4 數(shù)據(jù)來源與處理
1.5 論文框架
1.6 論文的創(chuàng)新點
2 mRNA核心基因篩選
2.1 材料與方法
2.2 結(jié)果
2.3 小結(jié)
3 ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
3.1 材料與方法
3.2 結(jié)果
3.3 小結(jié)
4 生存分析
4.1 材料與方法
4.2 結(jié)果
4.3 小結(jié)
5 討論與結(jié)論
5.1 討論
5.2 研究結(jié)論
5.3 建議
5.4 研究不足與展望
參考文獻
致謝
在學期間承擔/參與的科研課題與研究成果
個人簡歷
【參考文獻】:
期刊論文
[1]“微移植”治療急性髓系白血病的研究進展[J]. 王璇,郭樹霞. 中國民康醫(yī)學. 2018(18)
[2]自體造血干細胞移植對急性髓系白血病的治療進展[J]. 陳永升,黃琴,尹曉林. 中國臨床新醫(yī)學. 2018(07)
[3]淺談臨床生物信息學在臨床醫(yī)學教育中的作用及初步實踐[J]. 張皓旻,楊波,郭斌,于睿莉,遲小華,陳紅飛,席義博,陳錫勐,賀培鳳,盧學春. 轉(zhuǎn)化醫(yī)學雜志. 2018(03)
[4]miRNA調(diào)控血液發(fā)育機制的研究進展[J]. 廖曉棠. 生物化工. 2018(01)
[5]白血病融合基因及檢測方法研究進展[J]. 肖恒,李守霞. 醫(yī)學綜述. 2015(22)
[6]白血病中融合基因的研究進展[J]. 張陽,鄭智博,賈學淵,孫文靖,金焰. 國際遺傳學雜志. 2015 (04)
[7]白血病形成中JAK/STAT信號通路的持續(xù)激活[J]. 李英華,羅建民. 國際病理科學與臨床雜志. 2006(05)
[8]造血干細胞移植治療白血病的某些進展[J]. 黃文榮,達萬明. 內(nèi)科急危重癥雜志. 2005(03)
[9]自體造血干細胞移植治療急性白血病患者143例療效分析[J]. 馮四洲,魏嘉璘,鄒德惠,王玫,楊棟林,閆章松,王津雨,劉慶國,張桂新,劉春,邱錄貴,嚴文偉,韓明哲. 內(nèi)科急危重癥雜志. 2005(03)
[10]Stat1蛋白在急性髓系細胞白血病患者外周血白細胞中的激活[J]. 劉峰,陳元玉,李冠武,溫博貴. 癌變.畸變.突變. 2004(04)
碩士論文
[1]miR-20b及miR-363介導(dǎo)AML預(yù)后相關(guān)性分析與臨床驗證[D]. 李敏曦.中國醫(yī)科大學 2018
本文編號:3693735
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