利用高代自交系構(gòu)建小麥的SSR標(biāo)記遺傳圖譜與分蘗數(shù)的QTL定位
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【摘要】:小麥產(chǎn)量及其相關(guān)性狀是由多基因控制的數(shù)量性狀,其研究十分復(fù)雜。分蘗是影響小麥產(chǎn)量的一個(gè)重要的性狀,同時(shí)也是小麥生長發(fā)育的基本特征以及壯苗和田間管理的重要指標(biāo),在小麥物質(zhì)生產(chǎn)和產(chǎn)量形成過程中發(fā)揮著重要的作用。因此利用相關(guān)技術(shù)手段對小麥分蘗特性的遺傳基礎(chǔ)進(jìn)行研究顯得十分必要和有價(jià)值。本研究以川農(nóng)18與一個(gè)1RS/1BL易位系T1208為親本,通過單粒傳法獲得430個(gè)F11重組自交系。2014年12月6日到2015年1月22日分四個(gè)時(shí)間段進(jìn)行田間實(shí)驗(yàn),調(diào)查重組自交系單株分蘗數(shù),利用SSR分子標(biāo)記進(jìn)行該性狀的QTL定位,主要結(jié)果如下:1.對小麥親本及RIL群體分蘗性狀的表觀數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn),兩親本間存在一定程度的差異,親本CN18的分蘗數(shù)要高于T1208。RIL群體分蘗數(shù)的平均值都低于兩親本。在RIL群體中家系間分蘗數(shù)的變異達(dá)到了極顯著的水平,并且擁有較高的變異系數(shù)。RIL群體的分蘗數(shù)呈連續(xù)性變異分布、超親分離現(xiàn)象明顯并且變異的幅度很大,群體中峰度值和偏斜度值的絕對值都小于1.0,基本上是呈正太分布的,表現(xiàn)出典型的數(shù)量性狀遺傳的特點(diǎn),說明小麥的分蘗是受多個(gè)基因控制的數(shù)量性狀,其群體分布也符合QTL作圖對群體的要求。2.利用1075對SSR引物對親本進(jìn)行擴(kuò)增,103個(gè)位點(diǎn)在雙親間有多態(tài)性,占到總引物數(shù)的9.6%。采用QTL IciMapping 3.0分析軟件,將其中52個(gè)SSR標(biāo)記定位在小麥的17條染色體上,連鎖圖覆蓋小麥基因組的總長度為1215.45cM,平均每兩個(gè)標(biāo)記間的遺傳距離為27.6cM。3.利用完備區(qū)間作圖軟件QTL IciMapping 3.0對由CN18和T1208為親本構(gòu)建的高代重組自交系群體進(jìn)行QTL分析,以LOD值≥2.0為閾值,共檢測出控制小麥分蘗性狀的QTL位點(diǎn)16個(gè),分布于1B、2A、2B、2D、3B、4A、4B、 5D、6A、6B、6D、7A和7D染色體上,單個(gè)QTL位點(diǎn)可以解釋2.61%-55.63%的表型變異。其中,在三個(gè)不同時(shí)期都被檢測到的QTLs位點(diǎn)分別位于1B、2A、2B、2D、3B、4A、4B、6D、7A和7D染色體上,說明這些QTLs受環(huán)境影響較小,其遺傳是穩(wěn)定的。4.研究發(fā)現(xiàn)一些QTL位點(diǎn)并不是在所有的時(shí)間段都能被檢測到,有的只是在一個(gè)或者是兩個(gè)時(shí)間段被檢測到。對于在每個(gè)時(shí)期都被檢測到的QTLs位點(diǎn),它們的貢獻(xiàn)率也是存在明顯差異的,一些位點(diǎn)它們對于表型變異的貢獻(xiàn)率不斷增加,這種增加達(dá)到極顯著水平,說明這種增加并不是由于環(huán)境影響引起的,如1B、2B、2B、3B、4A、6D和7D染色體上的QTLs位點(diǎn);相反一些位點(diǎn)對于表型變異的貢獻(xiàn)率先有所增加然后再大幅下降,而且這種變化同樣達(dá)到了極顯著的水平,如3B、4B和7A染色體上的QTLs位點(diǎn)。根據(jù)數(shù)據(jù)顯示的結(jié)果,作者懷疑小麥分蘗性狀相關(guān)QTL的表達(dá)是動態(tài)的,具有時(shí)間特異性,但是由于數(shù)據(jù)不夠充分,所以還不能下肯定的結(jié)論,需要進(jìn)行更一步的研究。
【關(guān)鍵詞】:小麥 分蘗 RIL群體 SSR標(biāo)記 QTL分析
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:S512.1
【目錄】:
- 摘要3-5
- Abstract5-9
- 1 文獻(xiàn)綜述9-21
- 1.1 小麥產(chǎn)量性狀研究進(jìn)展10-12
- 1.1.1 產(chǎn)量構(gòu)成因素10-11
- 1.1.2 小麥分蘗相關(guān)研究11-12
- 1.2 QTL定位研究12-15
- 1.2.1 作圖群體12-13
- 1.2.2 分子標(biāo)記類型13-14
- 1.2.3 作圖原理及方法14-15
- 1.3 小麥Q(jìng)TL定位研究15-20
- 1.4 本研究的目的和意義20-21
- 2 材料與方法21-26
- 2.1 試驗(yàn)材料21
- 2.2 田間試驗(yàn)21
- 2.3 試驗(yàn)方法21-26
- 2.3.1 基因組DNA的提取21-22
- 2.3.1.1 主要試劑、藥品和實(shí)驗(yàn)儀器21-22
- 2.3.1.2 基因組DNA的提取22
- 2.3.2 親本及其后代基因型的鑒定22-25
- 2.3.2.1 SSR引物22
- 2.3.2.2 PCR擴(kuò)增22-23
- 2.3.2.3 擴(kuò)增產(chǎn)物的電泳分析23-25
- 2.3.2.4 帶型記錄25
- 2.3.3 遺傳圖譜的構(gòu)建25
- 2.3.4 田間數(shù)據(jù)調(diào)查與分析25
- 2.3.5 小麥分蘗的QTL分析25-26
- 3 結(jié)果與分析26-34
- 3.1 小麥親本及RIL群體分蘗性狀的統(tǒng)計(jì)分析26-28
- 3.2 遺傳圖譜的構(gòu)建28-29
- 3.3 小麥分蘗性狀的QTL分析29-34
- 4 討論34-37
- 參考文獻(xiàn)37-44
- 致謝44
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