本文關(guān)鍵詞：基于SSR標(biāo)記的短花針茅種群遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)分析

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【摘要】：短花針茅(Stipa breviflora)系禾本科(Gramineae)針茅屬(Stipa L.)多年生叢生型旱生草本植物,是暖溫型荒漠草原的主要建群種之一。短花針茅在我國(guó)總體呈連續(xù)帶狀分布,一方面適合開展種群遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)研究,豐富對(duì)草原植物遺傳多樣性的認(rèn)知；另一方面,在實(shí)踐中也有助于短花針茅草原的保護(hù)與合理利用。本研究采用SSR分子標(biāo)記的方法,對(duì)分布在我國(guó)的短花針茅11個(gè)不同群體的遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)及群體遺傳分化等進(jìn)行了分析,結(jié)果如下：(1)得到了短花針茅較穩(wěn)定的SSR-PCR反應(yīng)體系(25μL):100ng模板DNA1μL、2.0mmol/L的Mg2+ 2.5μL、100μmol/L dNTPs 2μL、2.0U Taq DNA聚合酶0.5μL、0.2μmol/L上下游引物各1μL,其余用ddH20補(bǔ)足。反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性3min；94℃變性30s,各引物的最佳退火溫度退火30s,72℃延伸30s,共30個(gè)循環(huán)；最后72℃ 10min；4℃保存。利用最佳反應(yīng)體系共篩選出7對(duì)短花針茅的SSR引物。(2)利用上述7對(duì)SSR引物,共檢測(cè)到19個(gè)位點(diǎn),平均每個(gè)位點(diǎn)有2.71個(gè)等位基因,變化范圍為2-4個(gè)；11個(gè)群體的平均等位基因數(shù)為2.08,平均觀測(cè)雜合度為0.35,平均期望雜合度為0.80,平均多態(tài)性信息含量為0.40,平均等位基因數(shù)為2.08,平均Shannon信息指數(shù)為0.56,平均基因流Nm為3.15；總體來看,短花針茅群體的遺傳多樣性較豐富,群體間的遺傳分化較低,大部分群體間存在頻繁的基因交流,很可能不存在由于遺傳漂變而引起的遺傳分化。(3)進(jìn)一步分析表明,71.19%遺傳變異發(fā)生在群體內(nèi)部。不同群體的地理距離與遺傳距離不具有顯著地相關(guān)關(guān)系。利用不同方法進(jìn)行聚類后發(fā)現(xiàn),短花針茅所有個(gè)體可以劃分為3個(gè)組,遺傳變異主要來自于組內(nèi)�？梢�,影響短花針茅種群遺傳結(jié)構(gòu)的主要因子為地理隔離。
【關(guān)鍵詞】：短花針茅 SSR標(biāo)記 遺傳多樣性 遺傳結(jié)構(gòu)
【學(xué)位授予單位】：內(nèi)蒙古大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：S812;Q943.2
【目錄】：

• 摘要4-6
• Abstract6-10
• 第一章 前言10-18
• 1.1 研究目的與意義10
• 1.2 短花針茅特征及其分布10-11
• 1.2.1 短花針茅的形態(tài)特征11
• 1.2.2 短花針茅的分布特征11
• 1.3 基于分子標(biāo)記的植物遺傳多樣性與群體遺傳結(jié)構(gòu)11-16
• 1.3.1 基本概念11-12
• 1.3.2 影響遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)的因素12-13
• 1.3.3 分子標(biāo)記技術(shù)在遺傳多樣性中的應(yīng)用13-15
• 1.3.4 針茅屬植物的遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)研究進(jìn)展15-16
• 1.4 研究目標(biāo)16-18
• 第二章 材料與方法18-24
• 2.1 取樣18-19
• 2.2 總DNA的提取19
• 2.3 SSR-PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化及引物篩選19-21
• 2.3.1 SSR-PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化19-21
• 2.3.2 短花針茅SSR引物的篩選21
• 2.3.3 初篩引物的多態(tài)性驗(yàn)證21
• 2.4 SSR的PCR擴(kuò)增21-22
• 2.5 數(shù)據(jù)處理與統(tǒng)計(jì)分析22-24
• 2.5.1 原始數(shù)據(jù)處理22
• 2.5.2 遺傳多樣性分析22
• 2.5.3 聚類及遺傳結(jié)構(gòu)分析22-24
• 第三章 結(jié)果與分析24-35
• 3.1 SSR引物24-27
• 3.1.1 提取DNA質(zhì)量檢測(cè)24
• 3.1.2 正交實(shí)驗(yàn)的直觀分析24-25
• 3.1.3 退火溫度的確定25-26
• 3.1.4 最佳優(yōu)化體系篩選短花針茅SSR引物26
• 3.1.5 引物的多態(tài)性分析26-27
• 3.2 短花針茅不同群體的遺傳多樣性分析27-29
• 3.3 短花針茅群體的聚類及遺傳結(jié)構(gòu)分析29-35
• 3.3.1 短花針茅不同群體間的遺傳距離和遺傳相似性統(tǒng)計(jì)29
• 3.3.2 短花針茅群體的聚類分析29-30
• 3.3.3 短花針茅群體的遺傳結(jié)構(gòu)30-33
• 3.3.4 分組后短花針茅遺傳多樣性與遺傳分化33-35
• 第四章 討論35-39
• 4.1 短花針茅基因組DNA的提取35
• 4.2 SSR-PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化及引物篩選35-36
• 4.2.1 影響SSR-PCR反應(yīng)體系的因素35-36
• 4.2.2 短花針茅SSR引物的篩選36
• 4.3 短花針茅不同群體的遺傳多樣性36-37
• 4.4 短花針茅群體遺傳分化與遺傳結(jié)構(gòu)的分析37-39
• 第五章 結(jié)論39-40
• 參考文獻(xiàn)40-45
• 致謝45-46
• 攻讀碩士期間發(fā)表論文46

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：945647