豬繁殖與呼吸綜合征病毒ORF5a功能的研究
本文關(guān)鍵詞:豬繁殖與呼吸綜合征病毒ORF5a功能的研究
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【摘要】:豬繁殖與呼吸綜合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)屬于RNA病毒中的單股正鏈RNA病毒,該病毒與馬動脈炎病毒(equine arteritis virus,EAV)、猴出血熱病毒(simian hemorrhagic fever virus,SHFV)和小鼠乳酸脫氫酶升高癥病毒(lactate dehydrogenase-elevating virus,LDV)同屬于動脈炎病毒屬。PRRS V根據(jù)其基因型分為I型(歐洲)和II型(美洲),而國內(nèi)的流行毒株主要為II型PRRSV。最新研究通過序列分析發(fā)現(xiàn)一個普遍存在于動脈炎病毒屬的開放性閱讀框—ORF5a,利用反向遺傳操作系統(tǒng)對ORF5a的重要性進行驗證,發(fā)現(xiàn)其對EAV起重要作用,并對PRRSV的存活是必需的。但是ORF5a是以何種方式起作用,具體的功能是什么尚不明確,有待進一步的研究。本研究利用反向遺傳操作技術(shù),對ORF5a的功能做進一步的探討,為PRRSV的基礎(chǔ)性研究奠定基礎(chǔ)。本研究在實驗室已有的PRRSV的感染性克隆質(zhì)粒p Hu N4-F112上進行改造,將ORF5a的起始密碼子ATG突變?yōu)镚TG,構(gòu)建了ORF5a失活的感染性克隆質(zhì)粒p Hu N4-F112-Δ5a,體外轉(zhuǎn)染BHK-21細胞后在MARC-145細胞上拯救病毒。結(jié)果表明,拯救毒株在MARC-145細胞上傳代的第一代可以檢測到PRRSV的基因組,但是檢測不到病毒蛋白,證明ORF5a的存在是PRRSV存活所必需,并推測ORF5a可能參與病毒蛋白的合成。為了進一步驗證ORF5a的功能,將ORF5a插入慢病毒表達載體(p WPXL)中與輔助質(zhì)粒(p SPAX2、p MD2.G)共轉(zhuǎn)染293T細胞,收獲重組病毒,將病毒液上清純化后感染MARC-145細胞,篩選得到穩(wěn)定表達ORF5a細胞系,命名為5a M細胞系。將p Hu N4-F112-Δ5a在構(gòu)建的5a M細胞系上拯救,得到復制缺陷型病毒,說明ORF5a蛋白的穩(wěn)定表達可以補償突變株p Hu N4-F112-Δ5a合成病毒粒子蛋白的功能,因而推測ORF5a可能參與病毒的蛋白翻譯過程。將拯救出的病毒繼續(xù)在5a M細胞系上傳3代,得到具有感染性的病毒,對其各代基因組進行測序,發(fā)現(xiàn)p Hu N4-F112-Δ5a的突變位點發(fā)生回復突變—GTG重新變回ATG。另外,當p Hu N4-F112-Δ5a在MARC-145非凍融連續(xù)傳代,其基因組會持續(xù)存在,但ORF5a的突變位點不能回復突變,說明5a M細胞系中ORF5a的補償可以使突變株p Hu N4-F112-Δ5a的缺陷基因組回復突變形成了具有感染性的病毒粒子。綜上所述,ORF5a蛋白失活導致病毒粒子蛋白不能合成,因而對PRRSV的存活是必需的,另外ORF5a的穩(wěn)定表達使突變株p Hu N4-F112-Δ5a的突變位點GTG回復為ATG。
【關(guān)鍵詞】:豬繁殖與呼吸綜合征病毒 ORF5a 感染性克隆 5aM細胞系 功能性研究
【學位授予單位】:中國農(nóng)業(yè)科學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:S852.651
【目錄】:
- 摘要6-7
- Abstract7-12
- 英文縮略表12-13
- 第一章 引言13-21
- 1.1 PRRSV的生物學特征13-17
- 1.1.1 PRRSV基因組結(jié)構(gòu)以及亞基因的組成13-15
- 1.1.2 PRRSV主要的結(jié)構(gòu)蛋白15-16
- 1.1.3 PRRSV的病毒侵入16-17
- 1.2 ORF5A的研究進展17-19
- 1.2.1 ORF5A的發(fā)現(xiàn)18
- 1.2.2 EAV中ORF5A的重要性18
- 1.2.3 PRRSV 中 PRF5a 的必需性18-19
- 1.3 反向遺傳操作技術(shù)在動脈炎病毒屬中的應(yīng)用現(xiàn)狀19-20
- 1.4 研究的目的和意義20-21
- 第二章 PRRSV ORF5A突變株的構(gòu)建及生物學分析21-31
- 2.1 材料21
- 2.1.1 毒株、菌株、細胞21
- 2.1.2 主要試劑與儀器21
- 2.2 方法21-27
- 2.2.1 ORF5A相對位置分析21-22
- 2.2.2 引物設(shè)計及合成22
- 2.2.3 定點突變質(zhì)粒的構(gòu)建22-24
- 2.2.4 病毒的拯救24-25
- 2.2.5 拯救病毒感染性克隆缺失株RHUN4-F112-Δ5A鑒定及生物學分析25-27
- 2.3 結(jié)果27-29
- 2.3.1 拯救病毒PT-PCR檢測結(jié)果27-28
- 2.3.2 拯救病毒突變位點鑒定結(jié)果28
- 2.3.3 拯救病毒蛋白檢測結(jié)果28
- 2.3.4 拯救病毒病變觀察的結(jié)果28-29
- 2.4 討論29-30
- 2.5 小結(jié)30-31
- 第三章 PRRSV ORF5A細胞系的建立31-39
- 3.1 實驗材料31
- 3.1.1 細胞、質(zhì)粒、菌株31
- 3.1.2 主要的試劑及儀器31
- 3.2 實驗方法31-36
- 3.2.1 目的片段表達載體的構(gòu)建31-34
- 3.2.2 含有目的片段的MARC-145細胞系的建立34-35
- 3.2.3 含有目的片段的MARC-145細胞系的鑒定35-36
- 3.3 實驗結(jié)果36-38
- 3.3.1 表達載體與輔助質(zhì)粒的酶切鑒定結(jié)果36
- 3.3.2 構(gòu)建質(zhì)粒過程中的鑒定結(jié)果36-37
- 3.3.3 重組質(zhì)粒 5A-PWPXL的鑒定結(jié)果37
- 3.3.4 細胞系的熒光結(jié)果37
- 3.3.5 細胞系的GFP蛋白的檢測結(jié)果37-38
- 3.4 討論38-39
- 第四章 缺陷株在 5AM細胞系上拯救及生物學分析39-48
- 4.1 實驗材料39
- 4.1.1 細胞39
- 4.1.2 主要試劑及儀器39
- 4.2 實驗方法39-42
- 4.2.1 補償實驗39-40
- 4.2.2 缺陷株在MARC-145細胞上的拯救及非凍融傳代40-41
- 4.2.3 缺失株在 ORF5a 的 MARC-145 細胞系上拯救的鑒定及生物學特性分析41
- 4.2.4 ORF5a 蛋白免疫原性檢測41-42
- 4.3 結(jié)果42-45
- 4.3.1 基因組的檢測結(jié)果42-43
- 4.3.2 突變位點的鑒定43
- 4.3.3 細胞病變的觀察43-44
- 4.3.4 細胞病變的觀察44
- 4.3.5 ORF5a 蛋白的免疫原性鑒定結(jié)果44-45
- 4.4 討論45-46
- 4.5 小結(jié)46-48
- 第五章 結(jié)論48-49
- 參考文獻49-55
- 致謝55-56
- 作者簡歷56
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