本文關(guān)鍵詞：四川地區(qū)腹瀉仔豬群豬圓環(huán)病毒Ⅱ型感染情況的調(diào)查，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：豬圓環(huán)病毒Ⅱ型(PCV2)是可以引起仔豬多系統(tǒng)衰竭綜合征(PMWS)、呼吸道疾病綜合征(PRDC)、皮炎與腎病綜合征(PNDS)、肉芽腫性腸炎、壞死性淋巴結(jié)炎等多種臨床癥狀的一種免疫抑制病毒。PCV2誘發(fā)仔豬相關(guān)腸炎疾病是PCVAD的臨床癥狀之一,其表現(xiàn)為仔豬腹瀉、消瘦、脫水,抗生素治療無(wú)效后死亡；在腸道和相關(guān)淋巴結(jié)中均能夠檢出PCV2病原,剖檢可發(fā)現(xiàn)腸道有組織學(xué)的特征性病變。本文針對(duì)2013-2014年四川省13市腹瀉仔豬群的PCV2感染情況進(jìn)行了較全面的流行病學(xué)調(diào)查,主要研究結(jié)果如下：1、四川地區(qū)腹瀉仔豬群PCV2感染率的統(tǒng)計(jì)本研究對(duì)來(lái)自四川省13個(gè)地市的腹瀉仔豬樣品436份運(yùn)用PCR方法進(jìn)行檢測(cè)并分析,結(jié)果顯示,436份腹瀉樣品中PCV2陽(yáng)性樣本312份,總陽(yáng)性率為71.55%。本次所采樣本的13市中腹瀉仔豬群PCV2陽(yáng)性率最高的是攀枝花市為88.89%,最低的是德陽(yáng)市陽(yáng)性率為64.51%,同時(shí)PCV2與TGEV、PEDV兩種仔豬腹瀉的相關(guān)病毒的混合感染率依次為4.35%、42.88%。1-6周齡腹瀉仔豬PCV2核酸陽(yáng)性率分別為82.88%、86.66%、57.38%、44.11%、45.83%和36.84%。全年四季度采集樣本的PCV2核酸陽(yáng)性率依次為65.78%、66.90%、64.06%、81.52%。各周齡段PCV2陽(yáng)性腹瀉仔豬全血、血清、糞便的總檢出率分別為36.67%、30%、83.33%,各組織器官PCV2總檢出率由高到低依次為76.92%(腹股溝淋巴結(jié))、71.15%(腸系膜淋巴結(jié))、61.53%(腸)、54.81%(脾臟)、47.11%(肺臟)、29.80%(肝臟)、25%(頜下淋巴結(jié))、14.42%(腎臟)、0(腦)。以上結(jié)果表明,腹瀉仔豬群內(nèi)PCV2存在較高的感染率,且除淋巴器官和淋巴組織外,腸道可能為PCV2感染的另一重要靶器官。2、四川地區(qū)腹瀉仔豬群PCV2分子流行病學(xué)調(diào)查通過(guò)PCR及分子克隆等分子生物學(xué)相關(guān)技術(shù),對(duì)收集的312份PCV2陽(yáng)性組織病料進(jìn)行不同基因型PCV2分析。結(jié)果顯示,PCV2a單獨(dú)感染占15.12%,PCV2b單獨(dú)感染率占63.44%,二者混合感染率占21.84%。表明2014年度四川省內(nèi)腹瀉仔豬群不論從單獨(dú)還是混合感染PCV2b的感染率遠(yuǎn)大于PCV2a;本試驗(yàn)獲得的四川省19株P(guān)CV2毒株之間的同源性為94.3%-100%；四川省19株P(guān)CV2毒株中16株屬于GroupI,3株屬于GroupⅡ。19株四川省PCV2毒株間Rep蛋白氨基酸同源性為96.8%-100%,表明Rep基因確屬PCV2高度保守序列,變異程度遠(yuǎn)低于全基因序列。Cap蛋白的核苷酸序列分析結(jié)果顯示19株四川省PCV2毒株ORF2基因核苷酸同源性為91.3%-99.9%,推導(dǎo)的氨基酸同源性為94.5%-100%。與世界和國(guó)內(nèi)參考株的最大Kimura距離分別為6.09%和4.84%；轉(zhuǎn)換／顛換平均值(R)為0.94和0.68；氨基酸替代傾向指數(shù)為3.8%和2.5%。與美國(guó)株(FJ218000)相比共有25個(gè)氨基酸的突變。Cap蛋白這些位點(diǎn)氨基酸突變的積累效應(yīng)可能會(huì)引起抗原漂移,可能會(huì)使PCV2免疫原性的發(fā)生改變。
【關(guān)鍵詞】：四川省 仔豬腹瀉 豬圓環(huán)病毒Ⅱ型 感染情況 分子流行病學(xué)
【學(xué)位授予單位】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類(lèi)號(hào)】：S858.28
【目錄】：

• 中文摘要4-6
• ABSTRACT6-8
• 縮略詞表8-11
• 第一章 文獻(xiàn)綜述及選題的目的和意義11-21
• 1. 豬圓環(huán)病毒概述11-14
• 1.1 豬圓環(huán)病毒Ⅱ型分類(lèi)簡(jiǎn)介11-12
• 1.2 豬圓環(huán)病毒Ⅱ型的相關(guān)特性12
• 1.3 豬圓環(huán)病毒Ⅱ型的基因組結(jié)構(gòu)12-13
• 1.4 豬圓環(huán)病毒Ⅱ型的基因型的劃分13
• 1.5 豬圓環(huán)病毒Ⅱ型的編碼蛋白13-14
• 2. 豬圓環(huán)病毒(PCV2)病的流行病學(xué)14-19
• 2.1 PCV2引發(fā)的相關(guān)性疾病(PCVD)14-15
• 2.2 PCV2感染引起相關(guān)腸炎性疾病及作用機(jī)制15-17
• 2.2.1 PCV2單獨(dú)感染引起的仔豬腸炎性疾病15-16
• 2.2.2 PCV2與多病原混合感染引起的仔豬腸炎性疾病16-17
• 2.3 PCVD的診斷17-19
• 2.3.1 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)17-18
• 2.3.2 酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)18
• 2.3.3 間接免疫突光技術(shù)18-19
• 2.3.4 免疫過(guò)氧化物酶細(xì)胞單層試驗(yàn)19
• 2.3.5 病毒的分離與鑒定19
• 3. 研究的目的與意義19-21
• 第二章 四川地區(qū)腹瀉仔豬圓環(huán)病毒Ⅱ型感染率的統(tǒng)計(jì)21-34
• 1 材料與方法21-22
• 1.1 實(shí)驗(yàn)毒株21
• 1.2 主要試劑及溶液配制21-22
• 1.3 主要設(shè)備儀器22
• 2. 實(shí)驗(yàn)方法22-26
• 2.1 樣本采集22-23
• 2.2 引物的設(shè)計(jì)與合成23-24
• 2.3 病毒DNA的抽提及PCR擴(kuò)增24-25
• 2.4 腹瀉仔豬PCV2核酸的檢測(cè)25-26
• 2.4.1 不同地區(qū)腹瀉仔豬PCV2流行情況調(diào)查25
• 2.4.2 不同周齡腹瀉仔豬PCV2流行情況調(diào)查25-26
• 2.4.3 不同季度腹瀉仔豬PCV2感染情況調(diào)查26
• 2.4.4 PCV2與其他引起腹瀉的病毒混合感染情況調(diào)查26
• 2.4.5 PCV2在豬各臟器及排泄物檢出率的統(tǒng)計(jì)26
• 2.4.6 數(shù)據(jù)處理26
• 3. 結(jié)果26-31
• 3.1 四川地區(qū)豬群PCV2病原學(xué)監(jiān)測(cè)26-31
• 3.1.1 腹瀉仔豬組織樣品PCV2與其他腹瀉病毒的檢測(cè)結(jié)果26-28
• 3.1.2 不同周齡腹瀉仔豬PCV2流行情況調(diào)查結(jié)果28-29
• 3.1.3 不同季度腹瀉仔豬PCV2感染情況調(diào)查結(jié)果29
• 3.1.4 腹瀉仔豬血液和排泄物PCV2的檢出率29-30
• 3.1.5 腹瀉仔豬主要組織器官PCV2的檢出率30-31
• 4 討論31-34
• 第三章 四川地區(qū)腹瀉仔豬中PCV2分子流行病學(xué)調(diào)查34-53
• 1 材料34-35
• 1.1 試劑34
• 1.2 樣品34
• 1.3 引物34-35
• 2. 方法35-37
• 2.1 PCV2a與PCV2b的鑒別35
• 2.2 PCV2全基因的克隆與序列測(cè)定35-36
• 2.3 PCV2全基因序列特點(diǎn)及進(jìn)化分析36
• 2.4 ORF1核苷酸和氨基酸序列的分析36
• 2.5 ORF2核苷酸和氨基酸序列的分析36-37
• 3. 結(jié)果37-50
• 3.1 PCV2不同基因型在四川腹瀉仔豬群的流行情況37-39
• 3.2 PCV2全基因組的擴(kuò)增與序列測(cè)定39-41
• 3.3 PCV2全基因組序列分析41-50
• 3.3.1 全基因組序列結(jié)構(gòu)分析41
• 3.3.2 同源性與進(jìn)化分析41-43
• 3.3.3 ORF1及其推導(dǎo)氨基酸序列分析43-46
• 3.3.4 ORF2其推導(dǎo)氨基酸序列分析46-50
• 4. 討論50-53
• 全文結(jié)論53-54
• 參考文獻(xiàn)54-58
• 致謝58

【相似文獻(xiàn)】

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