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柳枝稷Alamo四倍體與八倍體表型、基因組及DNA甲基化變異分析

發(fā)布時(shí)間:2017-05-22 20:18

  本文關(guān)鍵詞:柳枝稷Alamo四倍體與八倍體表型、基因組及DNA甲基化變異分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:近年來(lái),生物質(zhì)能源產(chǎn)業(yè)得到迅速發(fā)展,利用乙醇、生物質(zhì)柴油替代一部分傳統(tǒng)汽油和柴油已成為趨勢(shì),為生物質(zhì)燃油的提取和原材料供應(yīng)提供了巨大的發(fā)展空間。柳枝稷作為生物能源植物,具有產(chǎn)量高、邊際土地適應(yīng)能力強(qiáng)、能量轉(zhuǎn)化率高等優(yōu)點(diǎn),因此成為能源植物的焦點(diǎn)。柳枝稷材料從四倍體加倍到八倍體,必然導(dǎo)致其出現(xiàn)新的表型和特性,如器官巨大化,影響抗旱性、抗病蟲(chóng)性以及木質(zhì)纖維素構(gòu)成等的變化,這些變化為篩選和培育出更優(yōu)異的柳枝稷品種提供種質(zhì)基礎(chǔ)。本研究通過(guò)從表型性狀、分子標(biāo)記、MSAP甲基化模式三個(gè)方面的研究來(lái)分析柳枝稷Alamo四倍體與八倍體的差異。1、首先通過(guò)對(duì)68個(gè)柳枝稷Alamo不同倍性植株的莖粗、旗葉長(zhǎng)、旗葉寬、株高、分蘗數(shù)、干重及鮮重7個(gè)指標(biāo)進(jìn)行比較。結(jié)果發(fā)現(xiàn):柳枝稷Alamo四倍體與八倍體在莖粗、株高、旗葉寬及分蘗數(shù)中均存在極顯著差異(p0.01),在旗葉長(zhǎng)中存在顯著差異(p0.05),Alamo四倍體除分蘗數(shù)比Alamo八倍體多外,莖粗、株高、旗葉寬、旗葉長(zhǎng)上的數(shù)值均小于Alamo八倍體。但在鮮重和干重中差異不顯著(p0.05)。對(duì)不同倍性植株表型性狀的變異分析表明,Alamo不同倍體單株間均存在表型變異,其中四倍體平均變異系數(shù)為39.56%,Alamo八倍體的平均變異系數(shù)為33.91%。2、為研究Alamo不同倍性的遺傳關(guān)系與遺傳多樣性,本研究利用EST-SSR、IT-ISJ兩種分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)68個(gè)柳枝稷Alamo不同倍性材料進(jìn)行分析,研究結(jié)果顯示:Alamo四倍體EST-SSR與IT-ISJ多樣性指數(shù)1分別為0.2145和0.4975,Alamo八倍體的多樣性指數(shù)1分別為0.2071和0.3955,而柳枝稷整體水平的多樣性指數(shù)I為0.2716和0.5226。通過(guò)EST-SSR和IT-ISJ分子標(biāo)記聚類顯示Alamo四倍體和Alamo八倍體沒(méi)有明顯差異;EST-SSR標(biāo)記遺傳分化指數(shù)為26.75%,IT-ISJ標(biāo)記為16.55%,柳枝稷倍性間與倍性內(nèi)都有豐富的遺傳多樣性,且倍性內(nèi)的遺傳變異性大于倍性間。3、本研究利用甲基化敏感擴(kuò)增多態(tài)性分子標(biāo)記MSAP技術(shù)對(duì)68個(gè)Alamo不同倍性材料進(jìn)行甲基化模式分析,研究結(jié)果顯示:18對(duì)引物共檢測(cè)出2萬(wàn)多個(gè)甲基化位點(diǎn),大多數(shù)都是非甲基化位點(diǎn),其中Alamo四倍體材料的甲基化率、全甲基化率、半甲基化率分別為19.37%、12.28%、7.09%,除全甲基化率外其他均高于八倍體Alamo的18.03%、12.55%、5.47%,但總體差異不大。數(shù)據(jù)顯示四倍體與八倍體甲基化模式均以全甲基化為主。Alamo四倍體的表觀遺傳分化系數(shù)GST為0.0197,八倍體AlamoGST為0.0226。供試柳枝稷材料甲基化基因多樣性Shannon指數(shù)平均為0.3096,其中四倍體AlamoShannon指數(shù)為0.3157,Alamo八倍體為0.3026;Alamo四倍體與八倍群體內(nèi)與群體間具有較豐富的甲基化多樣性。
【關(guān)鍵詞】:柳枝稷 EST-SSR IT-ISJ MSAP 遺傳多樣性 甲基化
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S578
【目錄】:
  • 摘要4-6
  • Abstract6-10
  • 第—章 文獻(xiàn)綜述10-21
  • 1. 柳枝稷生物學(xué)特性及地理分布10
  • 2. 植物多倍體10-12
  • 2.1 植物多倍體的分類11
  • 2.2 多倍體在植物育種中的應(yīng)用11-12
  • 3. 遺傳多樣性研究進(jìn)展12-14
  • 3.1 遺傳多樣性概念12
  • 3.2 形態(tài)學(xué)標(biāo)記研究12
  • 3.3 細(xì)胞學(xué)標(biāo)記研究12-13
  • 3.4 生化標(biāo)記研究13
  • 3.5 DNA分子標(biāo)記研究13-14
  • 4. 植物甲基化的研究進(jìn)展14-18
  • 4.1 表觀遺傳學(xué)14-15
  • 4.2 DNA甲基化的生物學(xué)功能15-17
  • 4.3 DNA甲基化的方式17
  • 4.4 DNA甲基化的檢測(cè)方法17-18
  • 5. 柳枝稷遺傳多樣性研究18-19
  • 6. 研究的目的及意義19
  • 7. 研究?jī)?nèi)容19-21
  • 第二章 柳枝稷Alamo四倍體與八倍體表型分析21-25
  • 1. 前言21
  • 2. 材料與方法21-22
  • 2.1 實(shí)驗(yàn)材料21
  • 2.2 田間形態(tài)數(shù)據(jù)測(cè)定方法21
  • 2.3 數(shù)據(jù)處理21-22
  • 3. 結(jié)果與分析22-23
  • 3.1 柳枝稷Alamo不同倍性表型方差分析及變異分析22-23
  • 3.2 柳枝稷Alamo不同倍性各性狀的主成分分析23
  • 4. 討論23-25
  • 第三章 柳枝稷Alamo不同倍性EST-SSR、IT-ISJ標(biāo)記研究25-39
  • 1. 引言25
  • 2. 材料與方法25-31
  • 2.1 實(shí)驗(yàn)材料25
  • 2.2 主要設(shè)備儀器25-26
  • 2.3 主要試劑26
  • 2.4 總DNA提取及檢測(cè)26-27
  • 2.5 EST-SSR與IT-ISJ PCR反應(yīng)體系27-28
  • 2.6 EST-SSR與IT-ISJ標(biāo)記數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)28-31
  • 3. 結(jié)果與分析31-36
  • 3.1 柳枝稷Alamo不同倍性EST-SSR和IT-ISJ遺傳多態(tài)性分析31-32
  • 3.2 柳枝稷Alamo不同倍性遺傳相似性分析32
  • 3.3 柳枝稷Alamo不同倍性遺傳分化分析32-33
  • 3.4 柳枝稷Alamo不同倍性遺傳聚類分析33-36
  • 4. 討論36-39
  • 第四章 柳枝稷Alamo四倍體和八倍體MSAP甲基化表觀遺傳變異分析39-50
  • 1. 引言39
  • 2. 材料與方法39-42
  • 2.1 實(shí)驗(yàn)材料39
  • 2.2 DNA提取方法39-40
  • 2.3 DNA樣本的雙酶切40
  • 2.4 酶切產(chǎn)物及連接接頭40-41
  • 2.5 MSAP預(yù)擴(kuò)增41
  • 2.6 MSAP選擇性擴(kuò)增41-42
  • 2.7 MSAP數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)42
  • 3. 結(jié)果與分析42-49
  • 3.1 甲基化敏感擴(kuò)增多態(tài)性條帶分析42-43
  • 3.2 柳枝稷Alamo四倍體與八倍體的甲基化水平分析43
  • 3.3 柳枝稷Alamo四倍體與八倍體甲基化多樣性分析43-44
  • 3.4 柳枝稷Alamo四倍體與八倍體甲基化遺傳結(jié)構(gòu)聚類分析44
  • 3.5 柳枝稷Alamo四倍體與八倍體甲基化遺傳結(jié)構(gòu)主成分分析44-49
  • 4. 討論49-50
  • 第五章 結(jié)論與展望50-51
  • 1. 結(jié)論50
  • 1.1 柳枝稷Alamo四倍體與八倍體表型差異50
  • 1.2 柳枝稷Alamo四倍體與八倍體遺傳多樣性差異50
  • 1.3 柳枝稷Alamo四倍體與八倍體甲基化模式差異50
  • 2. 展望50-51
  • 參考文獻(xiàn)51-57
  • 致謝57-58
  • 附圖58

【相似文獻(xiàn)】

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  本文關(guān)鍵詞:柳枝稷Alamo四倍體與八倍體表型、基因組及DNA甲基化變異分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號(hào):386782

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