形態(tài)與群體基因組測定研究華東地區(qū)中華蜜蜂種質(zhì)資源特性
發(fā)布時間:2023-05-22 03:55
生物對變化環(huán)境的適應(yīng),對種群的重要性不言而喻。蜜蜂可以在各種環(huán)境、氣候為植物傳粉,是各種農(nóng)作物、蔬菜和果樹等顯花植物最佳授粉昆蟲,同時對地球生態(tài)平衡的維持也具有重要作用。中華蜜蜂是東方蜜蜂的亞種,對中國原始自然環(huán)境和本土的生態(tài)系統(tǒng)以及物種多樣性具有重要的意義。近年來由于中國人口持續(xù)增多,支離破碎和惡化的棲息地環(huán)境對蜜蜂健康及其承受冬季生存的能力造成了巨大壓力。通過對蜜蜂的全面了解,對提高全球糧食產(chǎn)量,偵測環(huán)境變化程度,保護生態(tài)平衡有重大意義。另一方面,中華蜜蜂的進化生物學(xué)方面的研究,對探索其應(yīng)對氣候變化的適應(yīng)性機制,從而對整個中華蜜蜂的進化和適應(yīng)提供基礎(chǔ)知識。本研究創(chuàng)新型的通過形態(tài)和基因組學(xué)相結(jié)合的方法對華東地區(qū)的蒙陰、沂源、棗莊、五蓮、嶗山、六安(華北中蜂)及中國中部地區(qū)的青川、武隆、漢中(華南中蜂)以及海南島的文昌市(海南中蜂)共11個地區(qū)31個群體462只中華蜜蜂進行了39個代表形態(tài)性狀的測定,每個群體中我們又抽取了8只中華蜜蜂,總共243只蜜蜂進行了2b-RAD簡化基因組測序。通過對采樣地區(qū)的蜜蜂表型數(shù)據(jù)的比對,發(fā)現(xiàn)中華蜜蜂大部分形態(tài)指標間存在顯著差異(P<0.05),提...
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
符號說明
中文摘要
Abstract
1 前言
1.1 中華蜜蜂種質(zhì)資源特性
1.1.1 中華蜜蜂生物學(xué)特性
1.1.2 中華蜜蜂的形態(tài)學(xué)特性
1.1.3 中華蜜蜂的經(jīng)濟和生態(tài)價值
1.2 中華蜜蜂研究現(xiàn)狀
1.2.1 中華蜜蜂的形態(tài)分類研究
1.2.2 中華蜜蜂的生化指標標記分類研究
1.2.3 中華蜜蜂分子標記研究
1.2.4 中華蜜蜂的基因組水平研究
1.3 基于SNP的遺傳多樣性分析
1.3.1 東方蜜蜂基因組信息參考基因組
1.3.2 基于2b-red的簡化基因組測序
1.3.3 單核苷酸多態(tài)性(SNP)在群體遺傳學(xué)中的應(yīng)用
1.4 試驗意義
2 材料和方法
2.1 中華蜜蜂的樣本采集
2.2 中華蜜蜂的形態(tài)測定
2.3 測序及質(zhì)量控制
2.4 數(shù)據(jù)分析
2.4.1 形態(tài)測量的分析
2.4.2 群體遺傳多樣性和遷移事件分析
2.4.3 基因流
2.4.4 利用貝葉斯聚類的遺傳結(jié)構(gòu)分析
2.4.5 環(huán)境變量與遺傳多樣性的關(guān)聯(lián)
2.4.6 根據(jù)Fst的異常檢驗來篩選自然選擇下的SNP位點
2.4.7 Gene ontology(GO)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 中華蜜蜂形態(tài)測定與分析
3.1.1 中華蜜蜂形態(tài)測定結(jié)果
3.1.2 基于形態(tài)特征的群體結(jié)構(gòu)
3.1.3 基于形態(tài)特征的群體親緣距離
3.2 中華蜜蜂遺傳多樣性分析
3.2.1 群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.2.2 中華蜜蜂群體遺傳多樣性分析
3.2.3 歷史遷移事件
3.2.4 環(huán)境因素對遺傳因素的影響
3.2.5 中華蜜蜂遺傳結(jié)構(gòu)的空間特性
3.3 自然選擇下的候選基因
4 討論
4.1 通過形態(tài)結(jié)構(gòu)對中華蜜蜂多樣性的研究
4.2 通過遺傳結(jié)構(gòu)對中華蜜蜂遺傳多樣性的研究
4.3 發(fā)現(xiàn)的歷史遷移事件和空間結(jié)構(gòu)特征
4.4 中華蜜蜂的選擇性進化趨勢
5 結(jié)論
5.1 實驗結(jié)論
5.2 創(chuàng)新點
參考文獻
附錄
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表論文情況
本文編號:3821953
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【學(xué)位級別】:碩士
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中文摘要
Abstract
1 前言
1.1 中華蜜蜂種質(zhì)資源特性
1.1.1 中華蜜蜂生物學(xué)特性
1.1.2 中華蜜蜂的形態(tài)學(xué)特性
1.1.3 中華蜜蜂的經(jīng)濟和生態(tài)價值
1.2 中華蜜蜂研究現(xiàn)狀
1.2.1 中華蜜蜂的形態(tài)分類研究
1.2.2 中華蜜蜂的生化指標標記分類研究
1.2.3 中華蜜蜂分子標記研究
1.2.4 中華蜜蜂的基因組水平研究
1.3 基于SNP的遺傳多樣性分析
1.3.1 東方蜜蜂基因組信息參考基因組
1.3.2 基于2b-red的簡化基因組測序
1.3.3 單核苷酸多態(tài)性(SNP)在群體遺傳學(xué)中的應(yīng)用
1.4 試驗意義
2 材料和方法
2.1 中華蜜蜂的樣本采集
2.2 中華蜜蜂的形態(tài)測定
2.3 測序及質(zhì)量控制
2.4 數(shù)據(jù)分析
2.4.1 形態(tài)測量的分析
2.4.2 群體遺傳多樣性和遷移事件分析
2.4.3 基因流
2.4.4 利用貝葉斯聚類的遺傳結(jié)構(gòu)分析
2.4.5 環(huán)境變量與遺傳多樣性的關(guān)聯(lián)
2.4.6 根據(jù)Fst的異常檢驗來篩選自然選擇下的SNP位點
2.4.7 Gene ontology(GO)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 中華蜜蜂形態(tài)測定與分析
3.1.1 中華蜜蜂形態(tài)測定結(jié)果
3.1.2 基于形態(tài)特征的群體結(jié)構(gòu)
3.1.3 基于形態(tài)特征的群體親緣距離
3.2 中華蜜蜂遺傳多樣性分析
3.2.1 群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.2.2 中華蜜蜂群體遺傳多樣性分析
3.2.3 歷史遷移事件
3.2.4 環(huán)境因素對遺傳因素的影響
3.2.5 中華蜜蜂遺傳結(jié)構(gòu)的空間特性
3.3 自然選擇下的候選基因
4 討論
4.1 通過形態(tài)結(jié)構(gòu)對中華蜜蜂多樣性的研究
4.2 通過遺傳結(jié)構(gòu)對中華蜜蜂遺傳多樣性的研究
4.3 發(fā)現(xiàn)的歷史遷移事件和空間結(jié)構(gòu)特征
4.4 中華蜜蜂的選擇性進化趨勢
5 結(jié)論
5.1 實驗結(jié)論
5.2 創(chuàng)新點
參考文獻
附錄
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表論文情況
本文編號:3821953
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