糜子(Panicum miliaceum L.)是世界上最古老的作物之一,被廣泛種植于亞洲、歐洲和美洲的半干旱地區(qū),野糜子(Panicum ruderale(Kitag.)Chang comb.Nov.或Panicum miliaceum subsp.ruderale(Kitag)Tzvel)是栽培糜子的一種伴生雜草,同樣分布于糜子各栽培區(qū)。本研究利用簡(jiǎn)化基因組測(cè)序(Reduced representation genome sequencing,RRGS)中的特異性位點(diǎn)擴(kuò)增片段測(cè)序(Specific locus amplified fragment sequencing,SLAF-seq)技術(shù)開(kāi)發(fā)了大量的單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn),對(duì)遍布?xì)W亞大陸的栽培糜子和中國(guó)的野糜子進(jìn)行群體遺傳分析,從而揭示野糜子和栽培糜子之間的遺傳關(guān)系,探討栽培糜子的馴化與傳播問(wèn)題。本研究的主要內(nèi)容和結(jié)果如下:(1)Admixture分析結(jié)果表明:當(dāng)k=5時(shí),所有的野糜子和栽培糜子被歸于Group I、Group II-A、Group II-B、Group III-A、Group III-B,其中Group ...

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

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中文摘要
abstract
第1章 前言
    1.1 作物的起源馴化研究進(jìn)展
        1.1.1 作物的起源馴化
        1.1.2 主要作物起源馴化研究進(jìn)展
    1.2 糜子的概述和遺傳多樣性的研究進(jìn)展
        1.2.1 糜子的概述
        1.2.2 糜子的遺傳多樣性的研究進(jìn)展
        1.2.3 糜子起源馴化研究進(jìn)展
    1.3 簡(jiǎn)化基因組測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用
        1.3.1 簡(jiǎn)化基因組測(cè)序技術(shù)原理
        1.3.2 SLAF-seq技術(shù)簡(jiǎn)介
        1.3.3 SLAF-seq技術(shù)的應(yīng)用
    1.4 研究的目的意義和技術(shù)路線
第2章 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)樣本
        2.1.2 樣本培養(yǎng)
        2.1.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)備
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 基因組DNA的提取和質(zhì)量檢測(cè)
        2.2.2 酶切建庫(kù)及測(cè)序
        2.2.3 測(cè)序質(zhì)量值分布與建庫(kù)評(píng)估
        2.2.4 數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)和分析
第3章 結(jié)果與討論
    3.1 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        3.1.1 建庫(kù)評(píng)估
        3.1.2 測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與評(píng)估
        3.1.3 SLAF標(biāo)簽和SNP標(biāo)記的開(kāi)發(fā)
        3.1.4 群體結(jié)構(gòu)分析
        3.1.5 系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.1.6 主成分分析
        3.1.7 遺傳多樣性和遺傳分化分析
        3.1.8 選擇性清除分析
    3.2 討論
        3.2.1 野糜子與栽培糜子的遺傳關(guān)系
        3.2.2 野糜子中的野生型與野化型
        3.2.3 栽培糜子的馴化
        3.2.4 栽培糜子的傳播路線
第4章 結(jié)論與展望
    4.1 結(jié)論
    4.2 展望
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)介
致謝



本文編號(hào)：3808990