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兩種環(huán)腹癭蜂成蟲和幼蟲腸道微生物組成及功能初探

發(fā)布時間:2023-03-12 00:41
  在自然界中,昆蟲的種類是動物類群中最為豐富的。經(jīng)過長期的協(xié)同進(jìn)化,昆蟲與其腸道微生物形成了緊密的互利共生關(guān)系。昆蟲腸道微生物可參與宿主昆蟲的營養(yǎng)、代謝、免疫、發(fā)育、生殖和運(yùn)動等多種生命活動。寄生蜂是一類寄生性昆蟲,是許多農(nóng)業(yè)害蟲的天敵。目前,對寄生蜂腸道微生物的認(rèn)識還非常有限,這限制了我們對寄主-寄生蜂互作關(guān)系的深入研究以及基于共生菌的生物防治新策略的開發(fā)與應(yīng)用。本文以布拉迪小環(huán)腹癭蜂和異腹小環(huán)腹癭蜂為研究對象,初步探究兩種環(huán)腹癭蜂微生物的群落組成及其功能。研究結(jié)果如下:1.兩種環(huán)腹癭蜂成蟲和幼蟲腸道微生物的群落組成及相對豐度通過宏基因組注釋分析,發(fā)現(xiàn)兩種環(huán)腹癭蜂成蟲和幼蟲腸道的微生物均以細(xì)菌為主,其中以變形菌門Proteobacteria為絕對優(yōu)勢菌,而真菌和病毒等微生物種類極少。兩種環(huán)腹癭蜂幼蟲腸道的優(yōu)勢菌屬存在較大差異,布拉迪小環(huán)腹癭蜂的優(yōu)勢菌屬為醋桿菌屬Acetobacter和柄桿菌屬Caulobacter,而異腹小環(huán)腹癭蜂的優(yōu)勢菌屬有鞘脂菌屬Sphingobium和鞘脂單胞菌屬Sphingopyxis。但兩種環(huán)腹癭蜂雌成蟲的優(yōu)勢菌屬基本一致,分別是醋桿菌屬Acetobacte...

【文章頁數(shù)】:76 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
1 緒論
    1.1 昆蟲腸道微生物的研究進(jìn)展
        1.1.1 昆蟲腸道微生物概述
        1.1.2 昆蟲腸道微生物的多樣性及其傳播途徑
        1.1.3 宏基因組的應(yīng)用研究
    1.2 昆蟲腸道微生物的功能
        1.2.1 提供營養(yǎng),協(xié)助消化
        1.2.2 增強(qiáng)宿主昆蟲防御和解毒能力
        1.2.3 影響宿主昆蟲的生長發(fā)育
        1.2.4 調(diào)控宿主昆蟲的行為
    1.3 果蠅寄生蜂及其腸道微生物
        1.3.1 果蠅寄生蜂概述
        1.3.2 果蠅寄生蜂的多樣性
        1.3.3 果蠅寄生蜂的腸道微生物
    1.4 研究目的及意義
2 實(shí)驗(yàn)材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)儀器和試劑
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)儀器
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 黑腹果蠅的飼養(yǎng)
            2.2.1.1 黑腹果蠅食物的配制
            2.2.1.2 黑腹果蠅的飼養(yǎng)
        2.2.2 黑腹果蠅寄生蜂的飼養(yǎng)
            2.2.2.1 寄生蜂食物的配制
            2.2.2.2 寄生蜂的飼養(yǎng)
        2.2.3 宏基因組測序
            2.2.3.1 樣本制備
            2.2.3.2 樣本基因組DNA的提取
            2.2.3.3 文庫構(gòu)建及上機(jī)測序
            2.2.3.4 生物信息分析
        2.2.4 果蠅及寄生蜂細(xì)菌的分離培養(yǎng)、鑒定及菌種保存
        2.2.5 細(xì)菌基因組測序及分析
        2.2.6 果蠅及寄生蜂DNA的提取
        2.2.7 PCR擴(kuò)增
        2.2.8 瓊脂糖凝膠電泳
        2.2.9 無菌果蠅品系和接菌果蠅品系的培育
            2.2.9.1 無菌抗生素果蠅食物的配制
            2.2.9.2 無菌果蠅食物的配制
            2.2.9.3 無菌果蠅的培育
            2.2.9.4 接菌果蠅的培育
        2.2.10 寄生無菌果蠅、接菌果蠅實(shí)驗(yàn)
        2.2.11 無菌寄生蜂品系的培育
            2.2.11.1 無菌寄生蜂食物的配制
            2.2.11.2 無菌寄生蜂的培育
        2.2.12 寄生蜂寄生率、產(chǎn)雌率統(tǒng)計
        2.2.13 數(shù)據(jù)分析及差異分析
3 兩種環(huán)腹癭蜂成蟲和幼蟲腸道微生物的群落組成及其功能注釋
    3.1 宏基因組測序基本數(shù)據(jù)
    3.2 兩種環(huán)腹癭蜂成蟲和幼蟲腸道微生物群落組成及相對豐度
        3.2.1 幼蟲腸道微生物群落組成及相對豐度
        3.2.2 成蟲微生物群落組成及相對豐度
    3.3 兩種環(huán)腹癭蜂宏基因組的功能注釋
        3.3.1 KEGG功能注釋
        3.3.2 COG功能注釋
        3.3.3 碳水化合物活性酶注釋(CAZyme)
        3.3.4 抗生素抗性基因注釋(ARDB)
4 兩種環(huán)腹癭蜂成蟲體內(nèi)細(xì)菌的功能探究
    4.1 兩種環(huán)腹癭蜂成蟲體內(nèi)的可培養(yǎng)細(xì)菌
        4.1.1 兩種環(huán)腹癭蜂成蟲體內(nèi)的可培養(yǎng)細(xì)菌的種類
        4.1.2 兩種環(huán)腹癭蜂成蟲體內(nèi)蘋果醋桿菌的種類及其相對豐度
    4.2 細(xì)菌對兩種環(huán)腹癭蜂幼蟲生長發(fā)育的影響
        4.2.1 兩種環(huán)腹癭蜂寄生無菌果蠅后幼蟲無法正常發(fā)育
        4.2.2 細(xì)菌對兩種環(huán)腹癭蜂幼蟲生長發(fā)育的影響
            4.2.2.1 蘋果醋桿菌和果聚糖乳桿菌成功定殖于無菌果蠅體內(nèi)
            4.2.2.2 細(xì)菌對兩種環(huán)腹癭蜂幼蟲生長發(fā)育的影響
    4.3 寄生蜂體內(nèi)細(xì)菌對其寄生率、產(chǎn)雌率的影響
        4.3.1 混合抗生素成功清除異腹小環(huán)腹癭蜂體內(nèi)細(xì)菌
        4.3.2 無菌寄生蜂的寄生率、產(chǎn)雌率統(tǒng)計
5 討論與展望
    5.1 討論
    5.2 本研究的創(chuàng)新之處
    5.3 本研究的不足之處
    5.4 今后的研究方向
參考文獻(xiàn)
附錄



本文編號:3760582

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