發(fā)布時(shí)間：2017-05-16 15:07

  本文關(guān)鍵詞：屠宰性狀的選育對(duì)大恒優(yōu)質(zhì)雞CAPN1、CAPN3及基因SNP位點(diǎn)的影響，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：鈣蛋白酶系統(tǒng)主要是由鈣蛋白酶和鈣蛋白酶抑制蛋白構(gòu)成,是細(xì)胞內(nèi)廣泛存在的一種酶系統(tǒng)。鈣蛋白酶主要行使其水解功能,水解肌肉中的蛋白質(zhì),從而影響肌肉的肉質(zhì)性狀。當(dāng)鈣蛋白酶抑制蛋白與鈣蛋白酶發(fā)生結(jié)合后,鈣蛋白酶抑制蛋白行使其抑制作用,抑制鈣蛋白酶的活性,從而使蛋白質(zhì)的降解速率下降。本文選用四川畜牧科學(xué)研究院家禽所和四川大恒家禽育種有限公司培育的第9個(gè)世代的6個(gè)優(yōu)質(zhì)肉雞新品系,對(duì)其CAPN1、CAPN3及CAST基因進(jìn)行SNPs掃描并分析這些SNPs位點(diǎn)與雞屠宰性狀的關(guān)聯(lián)性,并對(duì)比已有研究報(bào)道的第3世代上的相關(guān)數(shù)據(jù),分析這些突變位點(diǎn)在世代選育中的遺傳變化。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示：在第9世代的cAPN1上檢測(cè)到4個(gè)單核苷酸突變位點(diǎn)；這4個(gè)突變分別為外顯子6的G3535A(SNP1)突變,外顯子16的C7198A(SNP2)和G7324A(SNP3)突變以及內(nèi)含子3的G9950A(SNP4)突變。在CAST基因中檢測(cè)到1個(gè)單核苷酸突變位點(diǎn),具體位置為：內(nèi)含子11上的G37868A(SNP7)突變。通過與屠體性狀相關(guān)性分析,在CAPN1基因上,SNP1可顯著影響胸肌重和皮下脂肪厚度(P0.05)；SNP2可顯著影響半凈膛率(P0.05),對(duì)腹脂重和腹脂率的影響極顯著(P0.01)；SNP3對(duì)活重和半凈膛率有著顯著影響(P0.05),對(duì)屠體重有極顯著影響(P0.01)；SNP4對(duì)活重、屠體重以及胸腿肌重具有顯著影響。在CAPN3基因上,SNP5可極顯著影響胸肌率(P0.01),并且在各品系中,TT基因型的個(gè)體極顯著高于群體中其它基因型個(gè)體(P0.01)。SNP6可顯著影響活體重和屠體重,CC基因型和等位基因C為優(yōu)勢(shì)基因型和優(yōu)勢(shì)等位基因；而SNP6對(duì)胸肌重和腿肌重達(dá)到極顯著影響,CC基因型極顯著高于CT和TT基因型(P0.01)。在CAST基因上SNP7可顯著影響活體重和屠體重(P0.05),且群體中AA和AG基因型的個(gè)體要顯著高于GG基因型的個(gè)體。通過分析CAPNl、CAPN3和CAST基因變異位點(diǎn)的基因頻率和基因型頻率,我們發(fā)現(xiàn)其頻率在第3世代和第9世代中均有一定的變化,其中對(duì)屠宰性狀有利的基因頻率上升,不利的下降。在對(duì)屠宰性狀的選育過程中,CAPN1、CAPN3及CAST基因頻率發(fā)生了變化。這幾個(gè)基因的SNP位點(diǎn)能真實(shí)遺傳到后代,可以將其作為雞遺傳育種的分子標(biāo)記,用于家禽的分子育種。
【關(guān)鍵詞】：雞 鈣蛋白酶系統(tǒng)基因 多態(tài) 屠宰性狀
【學(xué)位授予單位】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：S831
【目錄】：

• 中文摘要5-6
• Abstract6-11
• 1 文獻(xiàn)綜述11-22
• 1.1 優(yōu)質(zhì)雞的研究現(xiàn)狀11-15
• 1.1.1 優(yōu)質(zhì)雞的定義11
• 1.1.2 優(yōu)質(zhì)雞的研究11-13
• 1.1.3 優(yōu)質(zhì)雞的培育13-15
• 1.2 影響肉質(zhì)的因素15-16
• 1.2.1 遺傳因素15
• 1.2.2 飼養(yǎng)管理因素15
• 1.2.3 動(dòng)物體屠宰后肌肉的變化15-16
• 1.3 影響肉質(zhì)的候選基因16
• 1.4 鈣蛋白酶系統(tǒng)的研究進(jìn)展16-21
• 1.4.1 CAPN1基因的研究進(jìn)展16-18
• 1.4.2 CAPN3基因的研究進(jìn)展18-19
• 1.4.3 CAST基因的研究進(jìn)展19-21
• 1.5 SNP的檢測(cè)方法21
• 1.6 實(shí)驗(yàn)?zāi)康呐c意義21-22
• 2 材料與方法22-29
• 2.1 實(shí)驗(yàn)材料22
• 2.2 實(shí)驗(yàn)所需試劑、藥品及其來源22-24
• 2.3 主要儀器設(shè)備24
• 2.4 主要生物學(xué)軟件24-25
• 2.5 實(shí)驗(yàn)方法25-29
• 2.5.1 采血25
• 2.5.2 大恒優(yōu)質(zhì)雞屠體性狀的測(cè)定與數(shù)據(jù)收集25
• 2.5.3 全基因組DNA提取與檢測(cè)25-26
• 2.5.4 引物的設(shè)計(jì)與合成26-28
• 2.5.5 SNP引物的篩選28
• 2.5.6 統(tǒng)計(jì)分析28-29
• 3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果29-45
• 3.1 基因組DNA提取結(jié)果29-30
• 3.2 哈迪-溫伯格平衡30
• 3.3 不同世代屠體性狀的對(duì)比分析30-31
• 3.4 雞CAPN1基因的多態(tài)性及遺傳效應(yīng)31-37
• 3.4.1 CAPN1基因擴(kuò)增片段的檢測(cè)31-32
• 3.4.2 CAPN1基因多態(tài)位點(diǎn)的檢測(cè)32-33
• 3.4.3 CAPN1基因各位點(diǎn)在不同世代間的基因頻率和基因型頻率33-35
• 3.4.4 CAPN1基因突變位點(diǎn)對(duì)雞屠宰性狀的相關(guān)性分析35-36
• 3.4.5 CAPN1基因型對(duì)屠宰性狀的遺傳效應(yīng)36-37
• 3.5 雞CAPN3基因的多態(tài)性及遺傳效應(yīng)37-42
• 3.5.1 CAPN3基因擴(kuò)增片段的檢測(cè)37-38
• 3.5.2 CAPN3基因多態(tài)位點(diǎn)的檢測(cè)38-39
• 3.5.3 CAPN3基因各位點(diǎn)在不同世代間的基因頻率和基因型頻率39-40
• 3.5.4 CAPN3基因突變位點(diǎn)對(duì)雞屠宰性狀的相關(guān)性分析40-41
• 3.5.5 CAPN3基因型對(duì)屠宰性狀的遺傳效應(yīng)41-42
• 3.6 雞CAST基因的多態(tài)性及遺傳效應(yīng)42-45
• 3.6.1 CAST基因擴(kuò)增片段的檢測(cè)42
• 3.6.2 CAST基因多態(tài)位點(diǎn)的檢測(cè)42-43
• 3.6.3 CAST基因各位點(diǎn)在不同世代間的基因頻率和基因型頻率43
• 3.6.4 CAST基因突變位點(diǎn)對(duì)雞屠宰性狀的相關(guān)性分析43-44
• 3.6.5 CAST基因單突變位點(diǎn)對(duì)屠宰性狀的遺傳效應(yīng)44-45
• 4 討論45-48
• 4.1 關(guān)于屠宰性狀對(duì)CAPN1基因SNP位點(diǎn)的影響45-46
• 4.1.1 CAPN1基因SNP位點(diǎn)在兩個(gè)世代中基因頻率的變化45
• 4.1.2 CAPN1基因變異與性狀的關(guān)聯(lián)分析45-46
• 4.2 關(guān)于屠宰性狀對(duì)CAPN3基因SNP位點(diǎn)的影響46-47
• 4.2.1 CAPN3基因SNP位點(diǎn)在兩個(gè)世代中基因頻率的變化46
• 4.2.2 CAPN3基因變異與性狀的關(guān)聯(lián)分析46-47
• 4.3 關(guān)于屠宰性狀對(duì)CAST基因SNP位點(diǎn)的影響47-48
• 4.3.1 CAST基因SNP位點(diǎn)在兩個(gè)世代中基因頻率的變化47
• 4.3.2 CAST基因變異與性狀的關(guān)聯(lián)分析47-48
• 5 結(jié)論48-49
• 參考文獻(xiàn)49-54
• 致謝54

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5 楊秀芹;劉慧;郭麗娟;關(guān)慶芝;許堯;劉娣;;豬CAPN1基因部分外顯子及3′UTR區(qū)的SNPs檢測(cè)[J];遺傳;2008年06期

6 郭彥;周國利;呂鑫;吳玉厚;;雞CAPN1基因3′-UTR多態(tài)性及其與肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析[J];中國畜牧獸醫(yī);2010年12期

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本文編號(hào)：371159