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基于LC/MS的卵巢靜止奶牛血清和卵泡液代謝組學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2022-01-02 10:04
  在過(guò)去幾十年中,由于奶牛業(yè)的快速發(fā)展和遺傳基因的選擇,全球奶牛產(chǎn)奶量得到大幅提高,但是奶牛繁殖力呈現(xiàn)逐漸下降趨勢(shì),在大多數(shù)國(guó)家,繁殖性能低是奶牛過(guò)早淘汰的首要原因,直接導(dǎo)致牧場(chǎng)經(jīng)濟(jì)效益受到嚴(yán)重?fù)p害。在奶牛產(chǎn)后乏情中,卵巢靜止是較嚴(yán)重的。卵巢靜止是卵巢功能暫時(shí)性紊亂的一種病理性乏情,表現(xiàn)為卵巢上卵泡直徑小于8mm,無(wú)囊腫和黃體。影響卵巢靜止發(fā)生的因素是多樣的,一般認(rèn)為能量負(fù)平衡是主要致病因素之一。因此,本研究應(yīng)用UHPLC-QTOF-MS代謝組學(xué)技術(shù)獲得卵巢靜止奶牛血清及卵泡液的差異代謝物,明確它們?cè)诼殉察o止發(fā)生中的作用,為今后揭示奶牛產(chǎn)后卵巢靜止的發(fā)生機(jī)制提供依據(jù)。本研究在黑龍江某一大型集約化牛場(chǎng)選擇試驗(yàn)?zāi)膛?采取散欄式自由采食全混日糧(TMR)飼養(yǎng)模式。試驗(yàn)?zāi)膛T诋a(chǎn)后1421 d進(jìn)行尾靜脈采血,分為能量負(fù)平衡組和能量正平衡組后,跟蹤至產(chǎn)后5055 d,經(jīng)B超檢測(cè)、直腸檢查及臨床發(fā)情表現(xiàn),選定發(fā)情組(A組)和卵巢靜止組(B組)各6頭。通過(guò)兩組奶牛的血液臨床病理學(xué)檢查,基于UHPLC-QTOF-MS和生物信息學(xué)的血清及卵泡液代謝組學(xué)分析,獲得卵... 

【文章來(lái)源】:黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)黑龍江省

【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于LC/MS的卵巢靜止奶牛血清和卵泡液代謝組學(xué)分析


發(fā)情組(A)對(duì)卵巢靜止組(B)的PCA得分散點(diǎn)圖

散點(diǎn)圖,散點(diǎn)圖,模式,模型


圖 2-3.發(fā)情組(A)對(duì)卵巢靜止組(B)的 PCA 得分散點(diǎn)圖Fig2-3. Score scatter plot of PCA for group A vs B注:圖中排名第一的主成分得分為橫坐標(biāo),第二的主成分的得分為縱坐標(biāo),不同點(diǎn)代表樣品。紅色為發(fā)情組,藍(lán)色為卵巢靜止組。圖 A 為 ESI(+)模式,圖 B 為 ESI(-)模式。Note: The score of the first principal component is the abscissa, and the score of the second principalcomponent is the ordinate, and different points represent samples. Red is the estrous group and blue isinactiveovaries group. Figure A is the ESI (+) mode, and Figure B is the ESI (-) mode.(3)正交偏最 乘法-判別分析(OPLS-DA)和置換檢驗(yàn)

散點(diǎn)圖,散點(diǎn)圖,模式,血清


基于LC/MS的卵巢靜止奶牛血清和卵泡液代謝組學(xué)分析161;這表明兩個(gè)構(gòu)建的模型,與樣本數(shù)據(jù)的真實(shí)相符合。且正負(fù)離子模式Q2回歸線與縱軸的截距均小于零,當(dāng)置換保留度降低時(shí),Y變量比例逐漸增大,Q2逐漸下降。這表明構(gòu)建模型的穩(wěn)健性良好,無(wú)過(guò)擬合現(xiàn)象。圖2-5.ESI(-)模式發(fā)情組(A)對(duì)卵巢靜止組(B)的OPLS-DA得分散點(diǎn)圖與置換檢驗(yàn)Fig2-5.ScatterplotandreplacementtestofOPLS-DAofAgroupandBgroupinESI(-).注:同F(xiàn)ig2-4.Note:SameasFig2-4.(4)篩選的差異代謝物表2-3是兩組試驗(yàn)?zāi)膛5难宀町惔x物。正離子ESI(+)模式篩選出8種差異代謝物,與發(fā)情組相比,卵巢靜止組奶牛血清中L-谷氨酰胺、胍基乙酸、DL-瓜氨酸、乳糖神經(jīng)酰胺(d18:1/16:0)、L-精氨酸、磷脂酰膽堿、谷氨酸和鞘磷脂共8種都升高。負(fù)離子ESI(-)模式篩選出6種差異代謝物,與發(fā)情組相比,卵巢靜止組奶牛血清中L-核酮糖、D-木糖、4-丙酮酸,吲哚乙酸共4種降低;血清中(R)-3-羥基丁酸、3-甲基-2-氧丁酸,共2種升高。兩種模式總共篩選出14種血清差異代謝物,其中4種降低,10種升高。表2-3兩組試驗(yàn)?zāi)膛Q宀町惔x物的變化Table2-3ChangeofdifferentialmetabolitesintheplasmaofinactiveovariesandestrusgroupsID代謝物中文名RT(min)VIP①P-value②FD③離子模式④1(2S)-2,5-diamino-5-oxopentanoicacidL-谷氨酰胺393.811.480.0222↑ESI+2Guanidoaceticacid胍基乙酸367.361.310.0153↑ESI+3CitrullineDL-瓜氨酸429.121.630.0060↑ESI+4L-ArginineL-精氨酸548.221.400.0411↑ESI+52-aminopentanedioicacid谷氨酸315.661.420.0216↑ESI+64-Pyridoxicacid4-丙酮酸34.891.730.0492↓ESI-7Indoleaceticacid吲哚乙酸149.562.470.0404↓ESI-83-methyl-2-oxobutanoic

【參考文獻(xiàn)】:
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碩士論文
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本文編號(hào):3563979

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