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新疆部分規(guī);i場畢氏腸微孢子蟲的檢測與鑒定

發(fā)布時間:2021-11-24 22:20
  畢氏腸微孢子蟲是一種常見的人獸共患腸道病原體,可導(dǎo)致免疫缺陷者和免疫功能低下者急性致死性腹瀉。目前,基于畢氏腸微孢子蟲核糖體DNA內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)基因位點(diǎn),在230多種宿主中鑒定出至少500個基因型,其中,豬源畢氏腸微孢子蟲有120多個基因型,多數(shù)存在人獸共患性,豬被認(rèn)為是人感染畢氏腸微孢子蟲的主要傳染源之一。新疆地理生態(tài)環(huán)境豐富多樣,有關(guān)該地區(qū)豬畢氏腸微孢子蟲的調(diào)查研究尚較少。本研究采用PCR法對新疆部分規(guī);i場畢氏腸微孢子蟲進(jìn)行檢測與鑒定,掌握其流行情況和基因型分布特征。1.收集阿克蘇某場香豬糞便樣本44份,基于ITS基因位點(diǎn),采用PCR法檢測其DNA樣本,發(fā)現(xiàn)18份呈畢氏腸微孢子蟲陽性,感染率為40.9%(18/44),斷奶前和斷奶后仔豬感染率分別為100%(9/9)和32.1%(9/28),成年母豬未發(fā)現(xiàn)感染,不同年齡段豬的畢氏腸微孢子蟲感染率統(tǒng)計(jì)學(xué)差異極顯著(P<0.01)。鑒定出5個基因型,分別為EbpA(n=1)、EbpC(n=13)、Peru8(n=2)、MJ12(n=1)和1個新基因型(命名為XJP-I,n=1)。種系發(fā)育分析顯示,5個基因型均屬于組群... 

【文章來源】:塔里木大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)

【文章頁數(shù)】:58 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

新疆部分規(guī)模化豬場畢氏腸微孢子蟲的檢測與鑒定


微孢子蟲孢子和其典型的生活史(不同種屬之間有差異),引自FranzenC[13]

電泳圖,孢子,電泳,基因


塔里木大學(xué)碩士學(xué)位論文第2章阿克蘇某場香豬畢氏腸微孢子蟲的分子檢測與鑒定20圖2-1基于ITS基因檢測畢氏腸微孢子蟲電泳結(jié)果M:DNA標(biāo)準(zhǔn)DL2000泳道1-21:樣本編號N:陰性對照P:陽性對照Figure2-1ThePCRamplificationofE.bieneusibasedonITSgeneM:DNAmarkerDL2000Lanes1-21:NumberofsamplesP:PositivecontrolN:Negativecontrol表2-3阿克蘇某場香豬畢氏腸微孢子蟲感染情況和基因型Table2-3InfectionandgenotypeofE.bieneusifromXiangpiginAksu2.3.2畢氏腸微孢子蟲基因型鑒定18個陽性樣本均成功雙向測序,經(jīng)序列比對分析,鑒定出4個已知基因型(EbpC、Peru8、EbpA和MJ12)和1個新基因型(命名為XJP-I),GenBank序列登錄號為MK312665,見表2-3。種系發(fā)育分析顯示,5個基因型均屬于組群1,見圖2-2。年齡Age樣本數(shù)No.ofsample陽性數(shù)No.ofpositive感染率(%)Infectionrate(%)基因型(個數(shù))Genotype(n)<60d99100EbpC(4)、MJ12(2)、EbpA(1)、Peru8(1)、XJP-I(1)61d-180d28932.1EbpC(9)>360d700-總計(jì)441840.9EbpC(13)、MJ12(2)、Peru8(1)、EbpA(1)、XJP-I(1)

序列,孢子,進(jìn)化樹,基因


塔里木大學(xué)碩士學(xué)位論文第2章阿克蘇某場香豬畢氏腸微孢子蟲的分子檢測與鑒定21圖2-2基于畢氏腸微孢子蟲ITS基因序列構(gòu)建的種系發(fā)育進(jìn)化樹Figure2-2PhylogenetictreebasedonE.bieneusiITSgenesequence空心三角形表示已報(bào)道的基因型,實(shí)心三角形表示新基因型。Knownandnewgenotypesareindicatedbyopentriangleandfilledtriangle,respectively.

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:3516862

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