新疆部分規(guī)模化豬場(chǎng)畢氏腸微孢子蟲的檢測(cè)與鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-11-24 22:20
畢氏腸微孢子蟲是一種常見的人獸共患腸道病原體,可導(dǎo)致免疫缺陷者和免疫功能低下者急性致死性腹瀉。目前,基于畢氏腸微孢子蟲核糖體DNA內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)基因位點(diǎn),在230多種宿主中鑒定出至少500個(gè)基因型,其中,豬源畢氏腸微孢子蟲有120多個(gè)基因型,多數(shù)存在人獸共患性,豬被認(rèn)為是人感染畢氏腸微孢子蟲的主要傳染源之一。新疆地理生態(tài)環(huán)境豐富多樣,有關(guān)該地區(qū)豬畢氏腸微孢子蟲的調(diào)查研究尚較少。本研究采用PCR法對(duì)新疆部分規(guī)模化豬場(chǎng)畢氏腸微孢子蟲進(jìn)行檢測(cè)與鑒定,掌握其流行情況和基因型分布特征。1.收集阿克蘇某場(chǎng)香豬糞便樣本44份,基于ITS基因位點(diǎn),采用PCR法檢測(cè)其DNA樣本,發(fā)現(xiàn)18份呈畢氏腸微孢子蟲陽(yáng)性,感染率為40.9%(18/44),斷奶前和斷奶后仔豬感染率分別為100%(9/9)和32.1%(9/28),成年母豬未發(fā)現(xiàn)感染,不同年齡段豬的畢氏腸微孢子蟲感染率統(tǒng)計(jì)學(xué)差異極顯著(P<0.01)。鑒定出5個(gè)基因型,分別為EbpA(n=1)、EbpC(n=13)、Peru8(n=2)、MJ12(n=1)和1個(gè)新基因型(命名為XJP-I,n=1)。種系發(fā)育分析顯示,5個(gè)基因型均屬于組群...
【文章來(lái)源】:塔里木大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:58 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
微孢子蟲孢子和其典型的生活史(不同種屬之間有差異),引自FranzenC[13]
塔里木大學(xué)碩士學(xué)位論文第2章阿克蘇某場(chǎng)香豬畢氏腸微孢子蟲的分子檢測(cè)與鑒定20圖2-1基于ITS基因檢測(cè)畢氏腸微孢子蟲電泳結(jié)果M:DNA標(biāo)準(zhǔn)DL2000泳道1-21:樣本編號(hào)N:陰性對(duì)照P:陽(yáng)性對(duì)照Figure2-1ThePCRamplificationofE.bieneusibasedonITSgeneM:DNAmarkerDL2000Lanes1-21:NumberofsamplesP:PositivecontrolN:Negativecontrol表2-3阿克蘇某場(chǎng)香豬畢氏腸微孢子蟲感染情況和基因型Table2-3InfectionandgenotypeofE.bieneusifromXiangpiginAksu2.3.2畢氏腸微孢子蟲基因型鑒定18個(gè)陽(yáng)性樣本均成功雙向測(cè)序,經(jīng)序列比對(duì)分析,鑒定出4個(gè)已知基因型(EbpC、Peru8、EbpA和MJ12)和1個(gè)新基因型(命名為XJP-I),GenBank序列登錄號(hào)為MK312665,見表2-3。種系發(fā)育分析顯示,5個(gè)基因型均屬于組群1,見圖2-2。年齡Age樣本數(shù)No.ofsample陽(yáng)性數(shù)No.ofpositive感染率(%)Infectionrate(%)基因型(個(gè)數(shù))Genotype(n)<60d99100EbpC(4)、MJ12(2)、EbpA(1)、Peru8(1)、XJP-I(1)61d-180d28932.1EbpC(9)>360d700-總計(jì)441840.9EbpC(13)、MJ12(2)、Peru8(1)、EbpA(1)、XJP-I(1)
塔里木大學(xué)碩士學(xué)位論文第2章阿克蘇某場(chǎng)香豬畢氏腸微孢子蟲的分子檢測(cè)與鑒定21圖2-2基于畢氏腸微孢子蟲ITS基因序列構(gòu)建的種系發(fā)育進(jìn)化樹Figure2-2PhylogenetictreebasedonE.bieneusiITSgenesequence空心三角形表示已報(bào)道的基因型,實(shí)心三角形表示新基因型。Knownandnewgenotypesareindicatedbyopentriangleandfilledtriangle,respectively.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]嚙齒動(dòng)物畢氏腸微孢子蟲分子流行病學(xué)進(jìn)展[J]. 趙威,周換換,徐柳蓮,馬天明,呂剛. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2019(12)
[2]藏香豬畢氏腸微孢子蟲感染情況和基因分型[J]. 李蘊(yùn)慧,張會(huì)軍,宋軍科,伍雪梅,高藝,林青,趙光輝. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(09)
[3]云南地區(qū)豬畢氏微孢子蟲的分子檢測(cè)及其基因型鑒定[J]. 石蓮琴,翟國(guó)蓮,吳杰,李朝,趙國(guó)洪,鄒豐才. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(08)
[4]我國(guó)生豬養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀、模式與區(qū)域布局分析[J]. 于洪康,吳建寨,王亞輝,沈辰. 中國(guó)豬業(yè). 2018(01)
[5]微孢子蟲研究進(jìn)展[J]. 吳杰,項(xiàng)勛,趙屹欽,鄧紫艷,王世玉,常華. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2017(06)
[6]我國(guó)養(yǎng)豬業(yè)污染問題產(chǎn)生的根本原因及三步法整體解決方案[J]. 許道軍,唐艷華,黃鋒,蔡鵬. 中國(guó)豬業(yè). 2016(10)
[7]三十年來(lái)我國(guó)生豬養(yǎng)殖區(qū)域分布變化趨勢(shì)[J]. 吳霞,陳磊,潘紅梅,王金勇. 中國(guó)畜牧雜志. 2013(16)
[8]腹瀉病人隱孢子蟲及其他原蟲感染糞樣檢測(cè)分析[J]. 陳韶紅,艾琳,田利光,張永年,童小妹,李浩,陳家旭. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2012(08)
[9]微孢子蟲檢測(cè)技術(shù)的研究進(jìn)展[J]. 王永賓,劉吉平. 中國(guó)寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2009(02)
本文編號(hào):3516862
【文章來(lái)源】:塔里木大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:58 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
微孢子蟲孢子和其典型的生活史(不同種屬之間有差異),引自FranzenC[13]
塔里木大學(xué)碩士學(xué)位論文第2章阿克蘇某場(chǎng)香豬畢氏腸微孢子蟲的分子檢測(cè)與鑒定20圖2-1基于ITS基因檢測(cè)畢氏腸微孢子蟲電泳結(jié)果M:DNA標(biāo)準(zhǔn)DL2000泳道1-21:樣本編號(hào)N:陰性對(duì)照P:陽(yáng)性對(duì)照Figure2-1ThePCRamplificationofE.bieneusibasedonITSgeneM:DNAmarkerDL2000Lanes1-21:NumberofsamplesP:PositivecontrolN:Negativecontrol表2-3阿克蘇某場(chǎng)香豬畢氏腸微孢子蟲感染情況和基因型Table2-3InfectionandgenotypeofE.bieneusifromXiangpiginAksu2.3.2畢氏腸微孢子蟲基因型鑒定18個(gè)陽(yáng)性樣本均成功雙向測(cè)序,經(jīng)序列比對(duì)分析,鑒定出4個(gè)已知基因型(EbpC、Peru8、EbpA和MJ12)和1個(gè)新基因型(命名為XJP-I),GenBank序列登錄號(hào)為MK312665,見表2-3。種系發(fā)育分析顯示,5個(gè)基因型均屬于組群1,見圖2-2。年齡Age樣本數(shù)No.ofsample陽(yáng)性數(shù)No.ofpositive感染率(%)Infectionrate(%)基因型(個(gè)數(shù))Genotype(n)<60d99100EbpC(4)、MJ12(2)、EbpA(1)、Peru8(1)、XJP-I(1)61d-180d28932.1EbpC(9)>360d700-總計(jì)441840.9EbpC(13)、MJ12(2)、Peru8(1)、EbpA(1)、XJP-I(1)
塔里木大學(xué)碩士學(xué)位論文第2章阿克蘇某場(chǎng)香豬畢氏腸微孢子蟲的分子檢測(cè)與鑒定21圖2-2基于畢氏腸微孢子蟲ITS基因序列構(gòu)建的種系發(fā)育進(jìn)化樹Figure2-2PhylogenetictreebasedonE.bieneusiITSgenesequence空心三角形表示已報(bào)道的基因型,實(shí)心三角形表示新基因型。Knownandnewgenotypesareindicatedbyopentriangleandfilledtriangle,respectively.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]嚙齒動(dòng)物畢氏腸微孢子蟲分子流行病學(xué)進(jìn)展[J]. 趙威,周換換,徐柳蓮,馬天明,呂剛. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2019(12)
[2]藏香豬畢氏腸微孢子蟲感染情況和基因分型[J]. 李蘊(yùn)慧,張會(huì)軍,宋軍科,伍雪梅,高藝,林青,趙光輝. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(09)
[3]云南地區(qū)豬畢氏微孢子蟲的分子檢測(cè)及其基因型鑒定[J]. 石蓮琴,翟國(guó)蓮,吳杰,李朝,趙國(guó)洪,鄒豐才. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(08)
[4]我國(guó)生豬養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀、模式與區(qū)域布局分析[J]. 于洪康,吳建寨,王亞輝,沈辰. 中國(guó)豬業(yè). 2018(01)
[5]微孢子蟲研究進(jìn)展[J]. 吳杰,項(xiàng)勛,趙屹欽,鄧紫艷,王世玉,常華. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2017(06)
[6]我國(guó)養(yǎng)豬業(yè)污染問題產(chǎn)生的根本原因及三步法整體解決方案[J]. 許道軍,唐艷華,黃鋒,蔡鵬. 中國(guó)豬業(yè). 2016(10)
[7]三十年來(lái)我國(guó)生豬養(yǎng)殖區(qū)域分布變化趨勢(shì)[J]. 吳霞,陳磊,潘紅梅,王金勇. 中國(guó)畜牧雜志. 2013(16)
[8]腹瀉病人隱孢子蟲及其他原蟲感染糞樣檢測(cè)分析[J]. 陳韶紅,艾琳,田利光,張永年,童小妹,李浩,陳家旭. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2012(08)
[9]微孢子蟲檢測(cè)技術(shù)的研究進(jìn)展[J]. 王永賓,劉吉平. 中國(guó)寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2009(02)
本文編號(hào):3516862
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