旱黃瓜子房培養(yǎng)及復(fù)雌花和果瘤位置QTL定位
發(fā)布時(shí)間:2021-11-16 05:03
黃瓜(Cucumis sativus L.)是我國(guó)重要的蔬菜作物。旱黃瓜是河北省優(yōu)勢(shì)特色產(chǎn)業(yè),但旱黃瓜育種起步較晚,育種技術(shù)滯后,制約著旱黃瓜育種效率。研究建立旱黃瓜未授粉子房培養(yǎng)技術(shù)體系,定位重要農(nóng)藝性狀QTLs,挖掘候選基因,對(duì)旱黃瓜高效育種具有重要意義。本文以旱黃瓜為試材,對(duì)旱黃瓜未授粉子房培養(yǎng)技術(shù)體系進(jìn)行了研究,并基于BSA-seq技術(shù)對(duì)黃瓜復(fù)雌花、果瘤位置性狀進(jìn)行了遺傳分析和QTL定位,主要結(jié)果如下:1.以4種不同基因型旱黃瓜的未授粉子房為試材,研究了基因型、子房不同發(fā)育時(shí)期及采樣時(shí)間、不同濃度TDZ、不同溫度對(duì)雌核誘導(dǎo)的影響。結(jié)果表明:不同基因型對(duì)雌核發(fā)育的影響差異顯著,‘1503’的雌核發(fā)育啟動(dòng)率最高,為77.22%;開(kāi)花前1 d的樣品最優(yōu),此時(shí)‘1503’雌核發(fā)育啟動(dòng)率為95.56%;隨TDZ(噻苯。┵|(zhì)量濃度上升,雌核發(fā)育啟動(dòng)率呈先上升后下降趨勢(shì),其中0.08mg·L-1TDZ處理的‘1503’雌核發(fā)育啟動(dòng)率最高,達(dá)91.6%;35℃暗培養(yǎng)4 d的處理,雌核發(fā)育啟動(dòng)率最優(yōu),達(dá)78.33%。本研究得出的旱黃瓜未授粉子房培養(yǎng)最優(yōu)雌核誘導(dǎo)技術(shù)體系為:以...
【文章來(lái)源】:河北科技師范學(xué)院河北省
【文章頁(yè)數(shù)】:77 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
黃瓜未授粉子房雌核的發(fā)生
第三章黃瓜復(fù)雌花性狀QTL定位203.2.1DNA提取及建庫(kù)測(cè)序?qū)Y選的20個(gè)極端株系及親本分別利用打孔器剪取4片大小一致的葉片,用錫紙包好后迅速放入液氮中保存,用于DNA提取,每株系重復(fù)三次取樣。從DNA樣品到最終數(shù)據(jù)獲得主要經(jīng)歷樣品檢測(cè)、建庫(kù)、測(cè)序這3個(gè)程序。親本池平均測(cè)序深度為25.00-28.21X,子代池平均測(cè)序深度為42.82-44.81X。具體測(cè)序流程如下(圖3-1):(1)DNA樣品測(cè)定主要利用瓊脂糖凝膠電泳分析、Nanodrop檢測(cè)、Qubit檢測(cè)。(2)文庫(kù)構(gòu)建及庫(kù)檢檢驗(yàn)合格的DNA樣品通過(guò)Covaris破碎機(jī)隨機(jī)打斷成長(zhǎng)度為350bp的片段。采用TruSeqLibraryConstructionKit進(jìn)行建庫(kù),DNA片段經(jīng)末端修復(fù)、加ployA尾、加測(cè)序接頭、純化、PCR擴(kuò)增等步驟完成整個(gè)文庫(kù)制備。文庫(kù)構(gòu)建完成后,先使用Qubit2.0進(jìn)行初步定量,用Agilent2100對(duì)文庫(kù)的insertsize進(jìn)行檢測(cè),insertsize符合預(yù)期后,使用Q-PCR方法對(duì)文庫(kù)的有效濃度(>2nM)進(jìn)行準(zhǔn)確定量,以保證文庫(kù)質(zhì)量。(3)庫(kù)檢合格后進(jìn)行IlluminaHiSeqTMPE150測(cè)序。圖3-1測(cè)序流程圖Figure3-1Sequencingflowchart3.2.2BSA-Seq分析
第三章黃瓜復(fù)雌花性狀QTL定位25注:A):Mf混池SNP-index在染色體上的分布;B):Sf混池SNP-index在染色體上的分布;C):△SNP-index在染色體上的分布。Note:A:distributionofsnp-indexofDfpoolonchromosome;B):distributionofsnp-indexofSfpoolonchromosome;C):△snp-indexdistributiononchromosomes.圖3-2黃瓜復(fù)雌花數(shù)SNP-index在染色體上的分布Figure3-2distributionofsnp-indexofmultiplepistillateflowerincucumberonchromosome
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃瓜單性結(jié)實(shí)性狀遺傳與QTL定位[J]. 牛志紅,宋曉飛,李曉麗,郭曉雨,何書(shū)強(qiáng),賀欒勁芝,馮志紅,孫成振,閆立英. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020(01)
[2]南瓜未授粉子房和胚珠離體培養(yǎng)影響因素[J]. 張蕾琛,孫楠,王迎兒,應(yīng)泉盛,嚴(yán)蕾艷,黃蕓萍,王毓洪,王潔. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(09)
[3]輻射花粉授粉誘導(dǎo)黃瓜單倍體及染色體加倍[J]. 付文苑,唐兵,鄧英,李芳,文林宏. 分子植物育種. 2019(21)
[4]黃瓜未授粉子房離體培養(yǎng)的研究進(jìn)展[J]. 馬燕,馬藝蕎,滕巍,姜奇峰,譚克,張倩. 北方園藝. 2019(09)
[5]黃瓜響應(yīng)低溫脅迫的生理及分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 李彩霞,董邵云,薄凱亮,苗晗,張圣平,顧興芳. 中國(guó)蔬菜. 2019(05)
[6]黃瓜嫩果皮色基因QTL定位分析[J]. 竇文文,沈鏑,麥爾旦·努爾阿伍提,董洪霞,邱楊,李錫香. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2018(06)
[7]榛屬ycf1基因生物信息學(xué)分析[J]. 衛(wèi)永樂(lè),溫志芳,劉芳,張杰偉,黃武剛,蘭彥平,程麗莉,曹慶昌,胡廣隆. 山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(08)
[8]玉米MYB轉(zhuǎn)錄因子靶基因的全基因組預(yù)測(cè)及驗(yàn)證[J]. 張曉芳,于好強(qiáng),羅羲,張于福,李晚忱,付鳳玲. 干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究. 2018(03)
[9]植物AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子家族的研究進(jìn)展[J]. 張麒,陳靜,李俐,趙明珠,張美萍,王義. 生物技術(shù)通報(bào). 2018(08)
[10]輻射花粉授粉誘導(dǎo)西瓜單倍體[J]. 楊紅,顧妍,張朝陽(yáng),孫玉東,羅德旭. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(22)
博士論文
[1]黃瓜果瘤和果實(shí)無(wú)光澤性狀基因的定位與功能分析[D]. 楊緒勤.上海交通大學(xué) 2014
[2]黃瓜果刺形成相關(guān)基因的定位與克隆[D]. 關(guān)媛.上海交通大學(xué) 2008
碩士論文
[1]利用QTL定位和BSA-seq分析鑒定堿脅迫下水稻產(chǎn)量相關(guān)性狀的候選基因[D]. 郭微.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]油桐MYB轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定與功能特征研究[D]. 冉舵.中南林業(yè)科技大學(xué) 2019
[3]擬南芥MYB6調(diào)控莖頂端生長(zhǎng)點(diǎn)大小的機(jī)制研究[D]. 劉祥政.山東大學(xué) 2019
[4]調(diào)控細(xì)胞壁阿魏酸合成代謝的二穗短柄草(Brachypodium distachyon)乙醛脫氫酶基因克隆及功能初步鑒定[D]. 齊旭莉.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[5]南瓜未受精胚珠離體培養(yǎng)影響因子研究[D]. 李禹琪.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[6]黃瓜果肉厚度QTL的精細(xì)定位及候選基因功能驗(yàn)證[D]. 陸璐.揚(yáng)州大學(xué) 2016
[7]黃瓜商品瓜果實(shí)生長(zhǎng)速率QTL定位[D]. 崔金瑩.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[8]利用BSA-seq定位主基因的方法研究[D]. 陳學(xué)群.福建農(nóng)林大學(xué) 2016
[9]擬南芥跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白相關(guān)基因T-DNA插入突變體的篩選及表型鑒定[D]. 常秋霜.南京大學(xué) 2015
[10]南瓜未受精子房離體誘導(dǎo)植株方法研究[D]. 何婭.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
本文編號(hào):3498198
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
黃瓜未授粉子房雌核的發(fā)生
第三章黃瓜復(fù)雌花性狀QTL定位203.2.1DNA提取及建庫(kù)測(cè)序?qū)Y選的20個(gè)極端株系及親本分別利用打孔器剪取4片大小一致的葉片,用錫紙包好后迅速放入液氮中保存,用于DNA提取,每株系重復(fù)三次取樣。從DNA樣品到最終數(shù)據(jù)獲得主要經(jīng)歷樣品檢測(cè)、建庫(kù)、測(cè)序這3個(gè)程序。親本池平均測(cè)序深度為25.00-28.21X,子代池平均測(cè)序深度為42.82-44.81X。具體測(cè)序流程如下(圖3-1):(1)DNA樣品測(cè)定主要利用瓊脂糖凝膠電泳分析、Nanodrop檢測(cè)、Qubit檢測(cè)。(2)文庫(kù)構(gòu)建及庫(kù)檢檢驗(yàn)合格的DNA樣品通過(guò)Covaris破碎機(jī)隨機(jī)打斷成長(zhǎng)度為350bp的片段。采用TruSeqLibraryConstructionKit進(jìn)行建庫(kù),DNA片段經(jīng)末端修復(fù)、加ployA尾、加測(cè)序接頭、純化、PCR擴(kuò)增等步驟完成整個(gè)文庫(kù)制備。文庫(kù)構(gòu)建完成后,先使用Qubit2.0進(jìn)行初步定量,用Agilent2100對(duì)文庫(kù)的insertsize進(jìn)行檢測(cè),insertsize符合預(yù)期后,使用Q-PCR方法對(duì)文庫(kù)的有效濃度(>2nM)進(jìn)行準(zhǔn)確定量,以保證文庫(kù)質(zhì)量。(3)庫(kù)檢合格后進(jìn)行IlluminaHiSeqTMPE150測(cè)序。圖3-1測(cè)序流程圖Figure3-1Sequencingflowchart3.2.2BSA-Seq分析
第三章黃瓜復(fù)雌花性狀QTL定位25注:A):Mf混池SNP-index在染色體上的分布;B):Sf混池SNP-index在染色體上的分布;C):△SNP-index在染色體上的分布。Note:A:distributionofsnp-indexofDfpoolonchromosome;B):distributionofsnp-indexofSfpoolonchromosome;C):△snp-indexdistributiononchromosomes.圖3-2黃瓜復(fù)雌花數(shù)SNP-index在染色體上的分布Figure3-2distributionofsnp-indexofmultiplepistillateflowerincucumberonchromosome
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃瓜單性結(jié)實(shí)性狀遺傳與QTL定位[J]. 牛志紅,宋曉飛,李曉麗,郭曉雨,何書(shū)強(qiáng),賀欒勁芝,馮志紅,孫成振,閆立英. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020(01)
[2]南瓜未授粉子房和胚珠離體培養(yǎng)影響因素[J]. 張蕾琛,孫楠,王迎兒,應(yīng)泉盛,嚴(yán)蕾艷,黃蕓萍,王毓洪,王潔. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(09)
[3]輻射花粉授粉誘導(dǎo)黃瓜單倍體及染色體加倍[J]. 付文苑,唐兵,鄧英,李芳,文林宏. 分子植物育種. 2019(21)
[4]黃瓜未授粉子房離體培養(yǎng)的研究進(jìn)展[J]. 馬燕,馬藝蕎,滕巍,姜奇峰,譚克,張倩. 北方園藝. 2019(09)
[5]黃瓜響應(yīng)低溫脅迫的生理及分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 李彩霞,董邵云,薄凱亮,苗晗,張圣平,顧興芳. 中國(guó)蔬菜. 2019(05)
[6]黃瓜嫩果皮色基因QTL定位分析[J]. 竇文文,沈鏑,麥爾旦·努爾阿伍提,董洪霞,邱楊,李錫香. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2018(06)
[7]榛屬ycf1基因生物信息學(xué)分析[J]. 衛(wèi)永樂(lè),溫志芳,劉芳,張杰偉,黃武剛,蘭彥平,程麗莉,曹慶昌,胡廣隆. 山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(08)
[8]玉米MYB轉(zhuǎn)錄因子靶基因的全基因組預(yù)測(cè)及驗(yàn)證[J]. 張曉芳,于好強(qiáng),羅羲,張于福,李晚忱,付鳳玲. 干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究. 2018(03)
[9]植物AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子家族的研究進(jìn)展[J]. 張麒,陳靜,李俐,趙明珠,張美萍,王義. 生物技術(shù)通報(bào). 2018(08)
[10]輻射花粉授粉誘導(dǎo)西瓜單倍體[J]. 楊紅,顧妍,張朝陽(yáng),孫玉東,羅德旭. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(22)
博士論文
[1]黃瓜果瘤和果實(shí)無(wú)光澤性狀基因的定位與功能分析[D]. 楊緒勤.上海交通大學(xué) 2014
[2]黃瓜果刺形成相關(guān)基因的定位與克隆[D]. 關(guān)媛.上海交通大學(xué) 2008
碩士論文
[1]利用QTL定位和BSA-seq分析鑒定堿脅迫下水稻產(chǎn)量相關(guān)性狀的候選基因[D]. 郭微.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]油桐MYB轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定與功能特征研究[D]. 冉舵.中南林業(yè)科技大學(xué) 2019
[3]擬南芥MYB6調(diào)控莖頂端生長(zhǎng)點(diǎn)大小的機(jī)制研究[D]. 劉祥政.山東大學(xué) 2019
[4]調(diào)控細(xì)胞壁阿魏酸合成代謝的二穗短柄草(Brachypodium distachyon)乙醛脫氫酶基因克隆及功能初步鑒定[D]. 齊旭莉.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[5]南瓜未受精胚珠離體培養(yǎng)影響因子研究[D]. 李禹琪.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[6]黃瓜果肉厚度QTL的精細(xì)定位及候選基因功能驗(yàn)證[D]. 陸璐.揚(yáng)州大學(xué) 2016
[7]黃瓜商品瓜果實(shí)生長(zhǎng)速率QTL定位[D]. 崔金瑩.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[8]利用BSA-seq定位主基因的方法研究[D]. 陳學(xué)群.福建農(nóng)林大學(xué) 2016
[9]擬南芥跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白相關(guān)基因T-DNA插入突變體的篩選及表型鑒定[D]. 常秋霜.南京大學(xué) 2015
[10]南瓜未受精子房離體誘導(dǎo)植株方法研究[D]. 何婭.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
本文編號(hào):3498198
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