海南島油茶種質(zhì)資源的分子鑒定及遺傳多樣性評(píng)價(jià)
發(fā)布時(shí)間:2021-10-12 05:53
油茶是中國(guó)重點(diǎn)發(fā)展的木本油料作物,海南島是中國(guó)油茶資源分布最南緣地區(qū),資源和產(chǎn)業(yè)發(fā)展特色明顯。由于海南島油茶資源研究與開發(fā)利用起步晚,國(guó)內(nèi)外對(duì)該資源的系統(tǒng)評(píng)價(jià)尚未開展,關(guān)于海南島油茶資源的分類問題仍無(wú)定論,這對(duì)海南島特異油茶資源的保護(hù)與創(chuàng)新利用、海南特色油茶產(chǎn)業(yè)發(fā)展極為不利。同時(shí),油茶組物種的分類和歸并問題存在較大的分歧。此外,對(duì)包括海南島油茶資源在內(nèi)的國(guó)內(nèi)越南油茶資源進(jìn)行評(píng)價(jià),以進(jìn)一步明確海南島油茶的資源特色,了解海南島油茶資源的遺傳多樣性水平和遺傳結(jié)構(gòu),為相關(guān)資源的創(chuàng)新利用和保護(hù)提供科學(xué)依據(jù)。因此,本研究對(duì)42個(gè)居群共867份油茶種質(zhì)資源材料進(jìn)行分子分析,基于ISSR和SRAP標(biāo)記技術(shù),分析山茶屬油茶組普通油茶、越南油茶、小果油茶、高州油茶、陸川油茶,以及香花油茶的分類地位與親緣關(guān)系,并對(duì)海南島油茶種質(zhì)資源資源進(jìn)行分類鑒定;同時(shí),基于SRAP標(biāo)記評(píng)價(jià)海南島油茶資源和中國(guó)越南油茶資源的遺傳多樣性,分析居群間的遺傳結(jié)構(gòu)和分化。主要研究結(jié)果如下:(1)以海南島油茶基因組DNA為模板,采用單因素試驗(yàn)和正交試驗(yàn)相結(jié)合方法,建立海南島油茶SRAP-PCR最優(yōu)體系,即在20μL體系中包含:10×...
【文章來(lái)源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:107 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)Fig.2-1AgarosegelelectrophoresisofgemomicDNA
海南大學(xué)碩士學(xué)位論文21圖2-1DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)Fig.2-1AgarosegelelectrophoresisofgemomicDNA2.2.2海南島油茶SRAP-PCR單因素試驗(yàn)(1)模板DNA用量對(duì)SRAP-PCR擴(kuò)增PCR反應(yīng)中模板DNA用量是關(guān)鍵因素之一。不同用量DNA模板對(duì)海南島油茶SRAP-PCR反應(yīng)體系影響不大,本研究設(shè)置DNA用量梯度范圍內(nèi)均能擴(kuò)增獲得條帶,且清晰度和背景深度差異較小(圖2-2)。當(dāng)模板DNA濃度大于60ng時(shí),條帶數(shù)量少且清晰度略低;當(dāng)模板DNA濃度5~60ng時(shí),條帶清晰,帶型保持一致。正交試驗(yàn)選用5~60ng模板DNA用量梯度水平。圖2-2DNA模板用量和dNTPs濃度對(duì)SRAP-PCR反應(yīng)體系的影響Fig.2-2EffectofconcentrationoftemplateDNAanddNTPsonSRAP-PCRreactionsystem注:M:100bpDNAMarker;1~10:1ng,5ng,20ng,40ng,60ng,80ng,100ng,120ng,160ng,200ng;11~20:0.025mmol/L,0.05mmol/L,0.1mmol/L,0.15mmol/L,0.2mmol/L,0.25mmol/L,0.375mmol/L,0.5mmol/L,0.75mmol/L,1.0mmol/LNote:M:100bpDNAMarker;1~10:1ng,5ng,20ng,40ng,60ng,80ng,100ng,120ng,160ng,200ng;11~20:0.025mmol/L,0.05mmol/L,0.1mmol/L,0.15mmol/L,0.2mmol/L,0.25mmol/L,0.375mmol/L,0.5mmol/L,0.75mmol/L,1.0mmol/L(2)dNTPs濃度對(duì)SRAP-PCR擴(kuò)增PCR反應(yīng)中dNTPs濃度影響擴(kuò)增反應(yīng)效率,濃度過(guò)低效率降低,條帶數(shù)量減少、
跎伲?邐?紉菜嬤?檔停?踔廖薹ü鄄斕。因此??皇匝檠≡?.05~0.20mmol/LdNTPs濃度梯度水平。(3)TaqDNA聚合酶用量對(duì)SRAP-PCR擴(kuò)增TaqDNA聚合酶用量對(duì)PCR反應(yīng)的最終結(jié)果影響重大,過(guò)低濃度的TaqDNA聚合酶會(huì)導(dǎo)致產(chǎn)物數(shù)量減少,甚至無(wú)法擴(kuò)增,而高濃度的聚合酶又會(huì)導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增。當(dāng)TaqDNA聚合酶濃度為1U以下時(shí),條帶數(shù)量少且不清晰;TaqDNA聚合酶濃度為1U以上時(shí),TaqDNA聚合酶濃度和產(chǎn)物擴(kuò)增數(shù)量呈正相關(guān);當(dāng)TaqDNA聚合酶濃度為5U時(shí),泳道10條帶模糊(圖2-3)。故正交試驗(yàn)選擇1.5~4.0U的TaqDNA聚合酶濃度梯度水平。圖2-3Taq酶濃度和和引物濃度對(duì)SRAP-PCR反應(yīng)體系的影響Fig.2-3EffectofTaqDNApolymeraseandprimerconcentrationonSRAP-PCRreactionsystem注:M:100bpDNAMarker;1~10:0.05U,0.25U,0.5U,0.75U,1U,1.5U,2.0U,3.0U,4.0U,5.0U;11~20:0.025μmol/L,0.05μmol/L,0.1μmol/L,0.2μmol/L,0.4μmol/L,0.5μmol/L,0.6μmol/L,0.7μmol/L,0.9μmol/L,1.2μmol/LNote:M:100bpDNAMarker;1~10:0.05U,0.25U,0.5U,0.75U,1U,1.5U,2.0U,3.0U,4.0U,5.0U;11~20:0.025μmol/L,0.05μmol/L,0.1μmol/L,0.2μmol/L,0.4μmol/L,0.5μmol/L,0.6μmol/L,0.7μmol/L,0.9μmol/L,1.2μmol/L(4)引物濃度對(duì)SRAP-PCR擴(kuò)增引物濃度處于0.20~0.60μmol/L時(shí),泳道14至泳道17的條帶清晰、穩(wěn)定,帶型一致;引物濃度低于0.20μmol/L時(shí),泳道11至泳道13條帶數(shù)量較少且不清晰;當(dāng)引物濃度高于0.60μmol/L時(shí),泳道18至泳道20擴(kuò)增出的條帶數(shù)量開始減少,清晰度也隨之減弱(圖2-3)。因此,本研究正交試驗(yàn)選擇0.20~0.60μmol/L的引物濃度梯
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于EST-SSR標(biāo)記的西雙版納苦茶資源遺傳多樣性分析[J]. 尚衛(wèi)瓊,李友勇,劉悅,段志芬,楊盛美,李慧,許燕,劉本英. 山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020(02)
[2]紅掌遺傳多樣性及親緣關(guān)系的ISSR分析[J]. 戶帥雅,李斌奇,陳孝丑,巫偉峰,張毅智,陳春,陳發(fā)興. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020(01)
[3]28份余甘子品種遺傳多樣性的ISSR分析及指紋圖譜構(gòu)建[J]. 邵雪花,劉牛,賴多,肖維強(qiáng),匡石滋. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020(08)
[4]朱頂紅轉(zhuǎn)錄組SSR標(biāo)記的開發(fā)與遺傳多樣性研究[J]. 黃寶華,蔡家珍,劉生財(cái),林玉玲,徐小萍,賴鐘雄. 閩南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2019(04)
[5]應(yīng)用FISH-AFLP技術(shù)分析105份櫻桃種質(zhì)資源的親緣關(guān)系[J]. 陳新,徐麗,宗曉娟,王甲威,譚鉞,朱東姿,魏海蓉,洪坡,劉慶忠. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(11)
[6]應(yīng)用RAPD分析方法評(píng)估春黑麥品種的遺傳多樣性[J]. 李?yuàn)檴? 安徽農(nóng)學(xué)通報(bào). 2019(22)
[7]海南島油茶種質(zhì)資源遺傳多樣性的SRAP分析[J]. 陳宣,云勇,吳宇佳,戚華沙,楊立榮,陳加利,鄭道君. 熱帶亞熱帶植物學(xué)報(bào). 2019(06)
[8]世界四大木本油料發(fā)展現(xiàn)狀[J]. 木沐. 中國(guó)林業(yè)產(chǎn)業(yè). 2019(11)
[9]油茶種植現(xiàn)狀及其高產(chǎn)栽培技術(shù)[J]. 陳光紅,朱黨元. 江西農(nóng)業(yè). 2019(20)
[10]海南6個(gè)主要產(chǎn)區(qū)山柚籽性狀研究[J]. 趙闊,張琳,陳艷,鄒易,王青松,高紅日,張紅建,鄭聯(lián)合. 農(nóng)產(chǎn)品加工. 2019(19)
博士論文
[1]小果油茶種內(nèi)類型劃分、評(píng)價(jià)及親緣關(guān)系研究[D]. 謝一青.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2013
[2]廣寧紅花油茶種質(zhì)特性與變異研究[D]. 孫佩光.北京林業(yè)大學(xué) 2012
[3]浙江紅山茶遺傳多樣性分析及觀賞價(jià)值評(píng)價(jià)[D]. 謝云.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2011
[4]小果油茶遺傳多樣性分析及雜交漸滲研究[D]. 黃勇.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2011
碩士論文
[1]利用形態(tài)學(xué)和SSR標(biāo)記分析中國(guó)紫心甘薯育成品種遺傳多樣性[D]. 高閏飛.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2019
[2]普通油茶優(yōu)良無(wú)性系的遺傳差異分析及授粉樹配置[D]. 李祥勝.福建農(nóng)林大學(xué) 2019
[3]普通油茶優(yōu)良基因型的遺傳多樣性及雜交可配性研究[D]. 任衛(wèi).福建農(nóng)林大學(xué) 2018
[4]黎蒴與廣寧紅花油茶種質(zhì)資源遺傳多樣性研究[D]. 謝薈.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]5種山茶屬野生油茶ISSR親緣關(guān)系研究及指紋圖譜的構(gòu)建[D]. 李國(guó)帥.中南林業(yè)科技大學(xué) 2014
[6]油茶種質(zhì)資源多樣性的ISSR分析[D]. 周蘭英.湖南師范大學(xué) 2014
[7]茶油多酚分析及其抗氧化穩(wěn)定性研究[D]. 廖義秀.中南林業(yè)科技大學(xué) 2013
[8]福建省不同地理區(qū)域浙江紅花油茶變異規(guī)律研究[D]. 付茂旺.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[9]SRAP標(biāo)記技術(shù)優(yōu)化與湖北油茶遺傳多樣性研究[D]. 左雪枝.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[10]油茶種質(zhì)資源遺傳多樣性分析及品種鑒定[D]. 吳鶯鶯.南京林業(yè)大學(xué) 2011
本文編號(hào):3432011
【文章來(lái)源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:107 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)Fig.2-1AgarosegelelectrophoresisofgemomicDNA
海南大學(xué)碩士學(xué)位論文21圖2-1DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)Fig.2-1AgarosegelelectrophoresisofgemomicDNA2.2.2海南島油茶SRAP-PCR單因素試驗(yàn)(1)模板DNA用量對(duì)SRAP-PCR擴(kuò)增PCR反應(yīng)中模板DNA用量是關(guān)鍵因素之一。不同用量DNA模板對(duì)海南島油茶SRAP-PCR反應(yīng)體系影響不大,本研究設(shè)置DNA用量梯度范圍內(nèi)均能擴(kuò)增獲得條帶,且清晰度和背景深度差異較小(圖2-2)。當(dāng)模板DNA濃度大于60ng時(shí),條帶數(shù)量少且清晰度略低;當(dāng)模板DNA濃度5~60ng時(shí),條帶清晰,帶型保持一致。正交試驗(yàn)選用5~60ng模板DNA用量梯度水平。圖2-2DNA模板用量和dNTPs濃度對(duì)SRAP-PCR反應(yīng)體系的影響Fig.2-2EffectofconcentrationoftemplateDNAanddNTPsonSRAP-PCRreactionsystem注:M:100bpDNAMarker;1~10:1ng,5ng,20ng,40ng,60ng,80ng,100ng,120ng,160ng,200ng;11~20:0.025mmol/L,0.05mmol/L,0.1mmol/L,0.15mmol/L,0.2mmol/L,0.25mmol/L,0.375mmol/L,0.5mmol/L,0.75mmol/L,1.0mmol/LNote:M:100bpDNAMarker;1~10:1ng,5ng,20ng,40ng,60ng,80ng,100ng,120ng,160ng,200ng;11~20:0.025mmol/L,0.05mmol/L,0.1mmol/L,0.15mmol/L,0.2mmol/L,0.25mmol/L,0.375mmol/L,0.5mmol/L,0.75mmol/L,1.0mmol/L(2)dNTPs濃度對(duì)SRAP-PCR擴(kuò)增PCR反應(yīng)中dNTPs濃度影響擴(kuò)增反應(yīng)效率,濃度過(guò)低效率降低,條帶數(shù)量減少、
跎伲?邐?紉菜嬤?檔停?踔廖薹ü鄄斕。因此??皇匝檠≡?.05~0.20mmol/LdNTPs濃度梯度水平。(3)TaqDNA聚合酶用量對(duì)SRAP-PCR擴(kuò)增TaqDNA聚合酶用量對(duì)PCR反應(yīng)的最終結(jié)果影響重大,過(guò)低濃度的TaqDNA聚合酶會(huì)導(dǎo)致產(chǎn)物數(shù)量減少,甚至無(wú)法擴(kuò)增,而高濃度的聚合酶又會(huì)導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增。當(dāng)TaqDNA聚合酶濃度為1U以下時(shí),條帶數(shù)量少且不清晰;TaqDNA聚合酶濃度為1U以上時(shí),TaqDNA聚合酶濃度和產(chǎn)物擴(kuò)增數(shù)量呈正相關(guān);當(dāng)TaqDNA聚合酶濃度為5U時(shí),泳道10條帶模糊(圖2-3)。故正交試驗(yàn)選擇1.5~4.0U的TaqDNA聚合酶濃度梯度水平。圖2-3Taq酶濃度和和引物濃度對(duì)SRAP-PCR反應(yīng)體系的影響Fig.2-3EffectofTaqDNApolymeraseandprimerconcentrationonSRAP-PCRreactionsystem注:M:100bpDNAMarker;1~10:0.05U,0.25U,0.5U,0.75U,1U,1.5U,2.0U,3.0U,4.0U,5.0U;11~20:0.025μmol/L,0.05μmol/L,0.1μmol/L,0.2μmol/L,0.4μmol/L,0.5μmol/L,0.6μmol/L,0.7μmol/L,0.9μmol/L,1.2μmol/LNote:M:100bpDNAMarker;1~10:0.05U,0.25U,0.5U,0.75U,1U,1.5U,2.0U,3.0U,4.0U,5.0U;11~20:0.025μmol/L,0.05μmol/L,0.1μmol/L,0.2μmol/L,0.4μmol/L,0.5μmol/L,0.6μmol/L,0.7μmol/L,0.9μmol/L,1.2μmol/L(4)引物濃度對(duì)SRAP-PCR擴(kuò)增引物濃度處于0.20~0.60μmol/L時(shí),泳道14至泳道17的條帶清晰、穩(wěn)定,帶型一致;引物濃度低于0.20μmol/L時(shí),泳道11至泳道13條帶數(shù)量較少且不清晰;當(dāng)引物濃度高于0.60μmol/L時(shí),泳道18至泳道20擴(kuò)增出的條帶數(shù)量開始減少,清晰度也隨之減弱(圖2-3)。因此,本研究正交試驗(yàn)選擇0.20~0.60μmol/L的引物濃度梯
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于EST-SSR標(biāo)記的西雙版納苦茶資源遺傳多樣性分析[J]. 尚衛(wèi)瓊,李友勇,劉悅,段志芬,楊盛美,李慧,許燕,劉本英. 山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020(02)
[2]紅掌遺傳多樣性及親緣關(guān)系的ISSR分析[J]. 戶帥雅,李斌奇,陳孝丑,巫偉峰,張毅智,陳春,陳發(fā)興. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020(01)
[3]28份余甘子品種遺傳多樣性的ISSR分析及指紋圖譜構(gòu)建[J]. 邵雪花,劉牛,賴多,肖維強(qiáng),匡石滋. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020(08)
[4]朱頂紅轉(zhuǎn)錄組SSR標(biāo)記的開發(fā)與遺傳多樣性研究[J]. 黃寶華,蔡家珍,劉生財(cái),林玉玲,徐小萍,賴鐘雄. 閩南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2019(04)
[5]應(yīng)用FISH-AFLP技術(shù)分析105份櫻桃種質(zhì)資源的親緣關(guān)系[J]. 陳新,徐麗,宗曉娟,王甲威,譚鉞,朱東姿,魏海蓉,洪坡,劉慶忠. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(11)
[6]應(yīng)用RAPD分析方法評(píng)估春黑麥品種的遺傳多樣性[J]. 李?yuàn)檴? 安徽農(nóng)學(xué)通報(bào). 2019(22)
[7]海南島油茶種質(zhì)資源遺傳多樣性的SRAP分析[J]. 陳宣,云勇,吳宇佳,戚華沙,楊立榮,陳加利,鄭道君. 熱帶亞熱帶植物學(xué)報(bào). 2019(06)
[8]世界四大木本油料發(fā)展現(xiàn)狀[J]. 木沐. 中國(guó)林業(yè)產(chǎn)業(yè). 2019(11)
[9]油茶種植現(xiàn)狀及其高產(chǎn)栽培技術(shù)[J]. 陳光紅,朱黨元. 江西農(nóng)業(yè). 2019(20)
[10]海南6個(gè)主要產(chǎn)區(qū)山柚籽性狀研究[J]. 趙闊,張琳,陳艷,鄒易,王青松,高紅日,張紅建,鄭聯(lián)合. 農(nóng)產(chǎn)品加工. 2019(19)
博士論文
[1]小果油茶種內(nèi)類型劃分、評(píng)價(jià)及親緣關(guān)系研究[D]. 謝一青.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2013
[2]廣寧紅花油茶種質(zhì)特性與變異研究[D]. 孫佩光.北京林業(yè)大學(xué) 2012
[3]浙江紅山茶遺傳多樣性分析及觀賞價(jià)值評(píng)價(jià)[D]. 謝云.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2011
[4]小果油茶遺傳多樣性分析及雜交漸滲研究[D]. 黃勇.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2011
碩士論文
[1]利用形態(tài)學(xué)和SSR標(biāo)記分析中國(guó)紫心甘薯育成品種遺傳多樣性[D]. 高閏飛.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2019
[2]普通油茶優(yōu)良無(wú)性系的遺傳差異分析及授粉樹配置[D]. 李祥勝.福建農(nóng)林大學(xué) 2019
[3]普通油茶優(yōu)良基因型的遺傳多樣性及雜交可配性研究[D]. 任衛(wèi).福建農(nóng)林大學(xué) 2018
[4]黎蒴與廣寧紅花油茶種質(zhì)資源遺傳多樣性研究[D]. 謝薈.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]5種山茶屬野生油茶ISSR親緣關(guān)系研究及指紋圖譜的構(gòu)建[D]. 李國(guó)帥.中南林業(yè)科技大學(xué) 2014
[6]油茶種質(zhì)資源多樣性的ISSR分析[D]. 周蘭英.湖南師范大學(xué) 2014
[7]茶油多酚分析及其抗氧化穩(wěn)定性研究[D]. 廖義秀.中南林業(yè)科技大學(xué) 2013
[8]福建省不同地理區(qū)域浙江紅花油茶變異規(guī)律研究[D]. 付茂旺.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[9]SRAP標(biāo)記技術(shù)優(yōu)化與湖北油茶遺傳多樣性研究[D]. 左雪枝.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[10]油茶種質(zhì)資源遺傳多樣性分析及品種鑒定[D]. 吳鶯鶯.南京林業(yè)大學(xué) 2011
本文編號(hào):3432011
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