小麥分蘗相關(guān)基因TaMOC1-Ls的分離與功能分析
發(fā)布時間:2021-08-14 14:04
小麥(Triticum aestivum L.)是我國重要的糧食作物,其產(chǎn)量決定的機理一直是該領(lǐng)域研究的熱點。分蘗決定了小麥的株型和產(chǎn)量,是重要的農(nóng)藝性狀之一。前期工作中,我們已證實TaD27s通過影響?yīng)毮_金內(nèi)酯合成進而影響小麥的分蘗數(shù)目。在TaD27-RNAi腋芽轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中,一個GRAS家族基因在轉(zhuǎn)基因腋芽中較野生型表達水平明顯降低,其序列與水稻中的OsMOC1及小麥TaMOC1s同源性較高,因此我們推測其可能參與小麥分蘗數(shù)目的調(diào)控。為理解小麥分蘗的分子機理,本研究對該基因進行了分離,并將其命名為TaMOC1-Ls基因,進而對其功能進行了初步分析,主要研究結(jié)果如下:TaMOC1-Ls位于6號染色體,具有三個等位基因,分別是TaMOC1-L-A、TaMOC1-L-B和TaMOC1-L-D。氨基酸序列比對顯示,TaMOC1-L-A、TaMOC1-L-B和TaMOC1-L-D與OsMOC1和TaMOC1s同源性均高于60%。進化樹分析結(jié)果顯示TaMOC1-Ls屬于LAS亞家族,與OsMOC1和TaMOC1s均有較高的親緣關(guān)系。實時定量PCR結(jié)果顯示,TaMOC1-Ls在小麥單棱期莖尖、二...
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
莖尖分生組織的組織學(xué)分析(Jhonetal.,2000)
小麥分蘗相關(guān)基因TaMOC1-Ls的分離與功能分析283結(jié)果與分析3.1TaMOC1-Ls的克隆前期研究過程中,我們發(fā)現(xiàn)TaD27s調(diào)控小麥分蘗的數(shù)目(Zhaoetal.,2020)。通過進一步轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)分析,發(fā)現(xiàn)一個GRAS家族轉(zhuǎn)錄因子的編碼基因,該基因在TaD27-RNAi轉(zhuǎn)基因腋芽中的表達水平顯著下調(diào)(圖3-1),暗示該基因可能參與了小麥分蘗數(shù)目的調(diào)控。我們將其序列在小麥數(shù)據(jù)庫http://plants.ensembl.org/Triticum_aestivum/Info/Index中進行搜索,結(jié)果顯示在小麥6號染色體A、B、D上分別存在一個拷貝,且均與TaMOC1s的同源性較高,因此我們將它們分別命名為TaMOC1-L-A、TaMOC1-L-B和TaMOC1-L-D。圖3-1TaMOC1-Ls在TaD27-RNAi轉(zhuǎn)基因和野生型小麥中的表達水平分析Fig.3-1ExpressionlevelofTaMOC1-LsinTaD27-RNAiandwild-typewheatplants根據(jù)比對出的序列,設(shè)計特異片段的引物,以科農(nóng)199單棱期的莖尖cDNA為模板,進行PCR擴增,將擴增產(chǎn)物進行測序。結(jié)果顯示,TaMOC1-L-A的CDS全長為1,179bp,編碼393個氨基酸殘基;TaMOC1-L-B的CDS全長為1,188bp,編碼396個氨基酸殘基;TaMOC1-L-D的CDS全長為1,188bp,編碼396個氨基酸殘基。它們的基因組序列都只含有外顯子,沒有內(nèi)含子(圖3-2)。
小麥分蘗相關(guān)基因TaMOC1-Ls的分離與功能分析30圖3-3GRAS基因家族的聚類分析小麥(Triticumaestivum),粳稻(OryzasativaJaponica),擬南芥(Arabidopsisthaliana),高粱(Sorghumbicolor)中GRAS家族的聚類分析。Fig.3-3ClusteranalysisofGRASfamilyGRASfamilyproteinsinTriticumaestivum,OryzasativaJaponica,ArabidopsisthalianaandSorghumbicolor.我們將TaMOC1-L-A、TaMOC1-L-B、TaMOC1-L-D與TaMOC1-A、TaMOC1-B、TaMOC1-D以及OsMOC1蛋白以及玉米等物種中的LAS亞家族進行序列比對分析。結(jié)果顯示,TaMOC1-Ls與TaMOC1s、OsMOC1蛋白同源性均高于60%(圖3-4A)。特別值得注意的是TaMOC1-Ls比TaMOC1s的N端缺少了25個氨基酸序列,暗示其功能可
【參考文獻】:
期刊論文
[1]干旱和鹽脅迫下水稻品種的雙重耐性差異[J]. 李姝晉,朱建清,葉小英,王麗華,宋永燕,王賀正. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2005(02)
碩士論文
[1]小麥分蘗相關(guān)基因TaMOC1的分離及功能分析[D]. 涂田莉.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
本文編號:3342600
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
莖尖分生組織的組織學(xué)分析(Jhonetal.,2000)
小麥分蘗相關(guān)基因TaMOC1-Ls的分離與功能分析283結(jié)果與分析3.1TaMOC1-Ls的克隆前期研究過程中,我們發(fā)現(xiàn)TaD27s調(diào)控小麥分蘗的數(shù)目(Zhaoetal.,2020)。通過進一步轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)分析,發(fā)現(xiàn)一個GRAS家族轉(zhuǎn)錄因子的編碼基因,該基因在TaD27-RNAi轉(zhuǎn)基因腋芽中的表達水平顯著下調(diào)(圖3-1),暗示該基因可能參與了小麥分蘗數(shù)目的調(diào)控。我們將其序列在小麥數(shù)據(jù)庫http://plants.ensembl.org/Triticum_aestivum/Info/Index中進行搜索,結(jié)果顯示在小麥6號染色體A、B、D上分別存在一個拷貝,且均與TaMOC1s的同源性較高,因此我們將它們分別命名為TaMOC1-L-A、TaMOC1-L-B和TaMOC1-L-D。圖3-1TaMOC1-Ls在TaD27-RNAi轉(zhuǎn)基因和野生型小麥中的表達水平分析Fig.3-1ExpressionlevelofTaMOC1-LsinTaD27-RNAiandwild-typewheatplants根據(jù)比對出的序列,設(shè)計特異片段的引物,以科農(nóng)199單棱期的莖尖cDNA為模板,進行PCR擴增,將擴增產(chǎn)物進行測序。結(jié)果顯示,TaMOC1-L-A的CDS全長為1,179bp,編碼393個氨基酸殘基;TaMOC1-L-B的CDS全長為1,188bp,編碼396個氨基酸殘基;TaMOC1-L-D的CDS全長為1,188bp,編碼396個氨基酸殘基。它們的基因組序列都只含有外顯子,沒有內(nèi)含子(圖3-2)。
小麥分蘗相關(guān)基因TaMOC1-Ls的分離與功能分析30圖3-3GRAS基因家族的聚類分析小麥(Triticumaestivum),粳稻(OryzasativaJaponica),擬南芥(Arabidopsisthaliana),高粱(Sorghumbicolor)中GRAS家族的聚類分析。Fig.3-3ClusteranalysisofGRASfamilyGRASfamilyproteinsinTriticumaestivum,OryzasativaJaponica,ArabidopsisthalianaandSorghumbicolor.我們將TaMOC1-L-A、TaMOC1-L-B、TaMOC1-L-D與TaMOC1-A、TaMOC1-B、TaMOC1-D以及OsMOC1蛋白以及玉米等物種中的LAS亞家族進行序列比對分析。結(jié)果顯示,TaMOC1-Ls與TaMOC1s、OsMOC1蛋白同源性均高于60%(圖3-4A)。特別值得注意的是TaMOC1-Ls比TaMOC1s的N端缺少了25個氨基酸序列,暗示其功能可
【參考文獻】:
期刊論文
[1]干旱和鹽脅迫下水稻品種的雙重耐性差異[J]. 李姝晉,朱建清,葉小英,王麗華,宋永燕,王賀正. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2005(02)
碩士論文
[1]小麥分蘗相關(guān)基因TaMOC1的分離及功能分析[D]. 涂田莉.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
本文編號:3342600
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