旋毛蟲和偽旋毛蟲肌幼蟲期排泄分泌物蛋白質(zhì)組學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-18 17:15
旋毛形線蟲(Trichinella spp.),又稱旋毛蟲,截至目前已分離鑒定出13種不同的類群[1]。根據(jù)其生活史中肌幼蟲期是否在宿主肌細(xì)胞重組過程中形成包囊主要被分為兩個(gè)進(jìn)化枝,即有包囊蟲種和無包囊蟲種。旋毛蟲(Trichinella spiralis,T1)和偽旋毛蟲(Trichinella pseudospiralis,T4)作為兩大進(jìn)化枝的代表蟲種,其區(qū)別除是否形成包囊外,還在于易感宿主和感染后炎癥反應(yīng)的差異。就目前的流行病學(xué)調(diào)查發(fā)現(xiàn)T4是旋毛蟲種屬中唯一一個(gè)可以感染鳥類的蟲種,其余則僅寄生于脊椎哺乳動(dòng)物宿主。造成以上差異的原因很可能是由于蟲種間排泄分泌物(excretory-secretory products,ESP)不同所致。ESP成分復(fù)雜,又直接暴露于宿主免疫系統(tǒng),參與機(jī)體細(xì)胞調(diào)控,與寄生蟲的寄生生活和致病性密切相關(guān)。此外旋毛蟲ESP對自身免疫性疾病具有顯著的預(yù)防及治療效果[2]。由于蟲體直接寄生會(huì)對患者造成一定的心理、病理損害,加之旋毛蟲衍生蛋白成分、濃度難以控制,導(dǎo)致相關(guān)研究及應(yīng)用受限。那么鑒定篩選旋毛蟲ESP中的功能性...
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
(A)光學(xué)顯微鏡觀察到的T1肌幼蟲時(shí)期小鼠肌肉切片;
第二篇研究內(nèi)容第一章旋毛蟲和偽旋毛蟲肌幼蟲時(shí)期ESP蛋白質(zhì)組學(xué)分析293實(shí)驗(yàn)結(jié)果3.1T1、T4肌幼蟲期ESPSDS-PAGE結(jié)果可見蛋白無降解、條帶清晰,質(zhì)量可滿足后續(xù)實(shí)驗(yàn)要求(圖2.1)。圖2.1旋毛蟲T1和偽旋毛蟲T4肌幼蟲時(shí)期ESPSDS-PAGE分析(1)T1肌幼蟲排泄分泌產(chǎn)物;(2)T4肌幼蟲排泄分泌產(chǎn)物(3)MarkerFig.2.1ESPofT.spiralisandT.pseudospiralismusclelarvalSDS-PAGE(1)ESPofT.spiralislarval;(2)ESPofT.pseudospiralislarval;(3)Marker3.2差異表達(dá)蛋白統(tǒng)計(jì)本實(shí)驗(yàn)得到的肽段信息經(jīng)過NCBI和uniprot蛋白數(shù)據(jù)庫對比檢索后,共鑒定出旋毛蟲蛋白1027個(gè)(T1492個(gè),T4535個(gè))。T1表達(dá)上調(diào)蛋白162個(gè),T4上調(diào)蛋白31個(gè)。T1中表達(dá)豐度較高的有DNaseⅡ家族(包括具有DNaseⅡ活性的Plancitoxin-1)、絲氨酸蛋白酶及抑制劑、胱抑素樣蛋白、烯醇酶、熱休克蛋白、核苷酸酶等;T4上調(diào)表達(dá)的主要有鈣粘蛋白、DNaseⅡ、Moesin/ezrin/radixin蛋白、β-己糖胺酶、組蛋白H2B/H4等。部分表達(dá)情況見表2.5。
第二篇研究內(nèi)容第一章旋毛蟲和偽旋毛蟲肌幼蟲時(shí)期ESP蛋白質(zhì)組學(xué)分析31E5SKC4BodywallmuscleproteinHR-29體壁肌肉蛋白HR-29T01_2684UP4.13C9DTY314-3-3protein14-3-3蛋白ftt2UP2.70A1BQX7Multicystatin-likedomainprotein多胱抑素樣結(jié)構(gòu)域蛋白mcd-1UP2.54E5S3L5Cystatin-B胱抑素-BTsp_03420UP2.30E5SB85Putativecadherindomainprotein鈣粘蛋白結(jié)構(gòu)域蛋白Tsp_01011DOWN0.48E5S309Calmodulin-1鈣調(diào)素1Tsp_03217DOWN0.31E5SGG7DeoxyribonucleaseIIfamilyprotein脫氧核糖核酸酶II家族蛋白Tsp_06568DOWN0.28E5S0L5TroponinI2肌鈣蛋白I2Tsp_09119DOWN0.19E5SCP5Putativecadherindomainprotein(Fragment)鈣黏蛋白結(jié)構(gòu)域蛋白(片段)Tsp_01505DOWN0.15E5SEY4DeoxyribonucleaseIIfamilyprotein脫氧核糖核酸酶II家族蛋白Tsp_02302DOWN0.123.3生物信息學(xué)分析3.3.1GO分析對鑒定到的差異蛋白進(jìn)行GO功能分類注釋,其中分別以“離子結(jié)合”、“胞質(zhì)組成成分”以及“小分子代謝過程”最為顯著。圖2.2GO分類注釋(A)分子功能(B)所處細(xì)胞位置(C)參與的生物過程Fig2.2GeneOntology(A)MolecularFunction(B)CellularComponent(C)BiologicalProcess3.3.2KEGGpathway富集分析結(jié)果表明肌幼蟲時(shí)期T1、T4的差異蛋白主要富集在代謝通路、細(xì)胞進(jìn)程以及生物機(jī)體系統(tǒng)通路,其中硫胺素代謝、鞘糖脂生物合成、苯丙氨酸,酪氨酸和ABC
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]旋毛蟲絲氨酸蛋白酶抑制劑定位及免疫保護(hù)效果評(píng)估[J]. 任博雯,劉琰,劉曉雷,白雪,丁靜,張勝蘭,劉明遠(yuǎn). 中國動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2019(06)
[2]旋毛蟲成蟲排泄分泌物對中性粒細(xì)胞功能的影響[J]. 王靜,丁靜,王春,王學(xué)林,白雪,唐斌,楊勇,王光明,劉明遠(yuǎn). 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(03)
[3]旋毛蟲肌幼蟲ESP與自身免疫性疾病相關(guān)蛋白組分分析[J]. 于莉,李丹,羅婧梅,蘇萌,趙蕾,邴玉艷,方艷輝,程露陽,吳和亮,杜孌英. 中國病原生物學(xué)雜志. 2017(12)
[4]旋毛蟲種屬分布研究進(jìn)展[J]. 張珊珊,張莉,李海龍,李倩. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2016(04)
[5]質(zhì)譜法分析旋毛蟲肌幼蟲排泄分泌蛋白的組分[J]. 羅婧梅,程露陽,關(guān)曉東,李丹,于莉,杜孌英. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2016(01)
[6]寄生蟲半胱氨酸蛋白酶抑制劑的類型及生物學(xué)功能[J]. 張曉艷,林建銀. 國外醫(yī)學(xué)(寄生蟲病分冊). 2005(02)
[7]旋毛蟲編碼新生幼蟲p46 kDa抗原基因重組融合蛋白對小鼠的免疫保護(hù)性研究[J]. 原麗紅,付寶權(quán),劉明遠(yuǎn),張亞蘭,高飛,吳秀萍,李蓮瑞,林本夫,盧強(qiáng),陳啟軍,P.Boireau. 中國人獸共患病雜志. 2005(03)
[8]旋毛蟲新生幼蟲p46000抗原基因的表達(dá)與抗原性分析[J]. 原麗紅,付寶權(quán),劉明遠(yuǎn),高飛,張亞蘭,吳秀萍,林本夫,李蓮瑞,盧強(qiáng),陳啟軍,P.Boireau. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2005(01)
[9]旋毛蟲新生幼蟲p46000抗原基因的克隆及序列分析[J]. 付寶權(quán),吳秀萍,劉明遠(yuǎn),張亞蘭,原麗紅,李蓮瑞,盧強(qiáng),陳啟軍,P.Boireau. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2005(01)
博士論文
[1]旋毛蟲轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究[D]. 劉曉雷.吉林大學(xué) 2012
碩士論文
[1]鹽對慢性腎衰大鼠腎臟磷酸化蛋白質(zhì)組及孤束核RAS的影響[D]. 何漢昌.南方醫(yī)科大學(xué) 2013
本文編號(hào):3290013
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
(A)光學(xué)顯微鏡觀察到的T1肌幼蟲時(shí)期小鼠肌肉切片;
第二篇研究內(nèi)容第一章旋毛蟲和偽旋毛蟲肌幼蟲時(shí)期ESP蛋白質(zhì)組學(xué)分析293實(shí)驗(yàn)結(jié)果3.1T1、T4肌幼蟲期ESPSDS-PAGE結(jié)果可見蛋白無降解、條帶清晰,質(zhì)量可滿足后續(xù)實(shí)驗(yàn)要求(圖2.1)。圖2.1旋毛蟲T1和偽旋毛蟲T4肌幼蟲時(shí)期ESPSDS-PAGE分析(1)T1肌幼蟲排泄分泌產(chǎn)物;(2)T4肌幼蟲排泄分泌產(chǎn)物(3)MarkerFig.2.1ESPofT.spiralisandT.pseudospiralismusclelarvalSDS-PAGE(1)ESPofT.spiralislarval;(2)ESPofT.pseudospiralislarval;(3)Marker3.2差異表達(dá)蛋白統(tǒng)計(jì)本實(shí)驗(yàn)得到的肽段信息經(jīng)過NCBI和uniprot蛋白數(shù)據(jù)庫對比檢索后,共鑒定出旋毛蟲蛋白1027個(gè)(T1492個(gè),T4535個(gè))。T1表達(dá)上調(diào)蛋白162個(gè),T4上調(diào)蛋白31個(gè)。T1中表達(dá)豐度較高的有DNaseⅡ家族(包括具有DNaseⅡ活性的Plancitoxin-1)、絲氨酸蛋白酶及抑制劑、胱抑素樣蛋白、烯醇酶、熱休克蛋白、核苷酸酶等;T4上調(diào)表達(dá)的主要有鈣粘蛋白、DNaseⅡ、Moesin/ezrin/radixin蛋白、β-己糖胺酶、組蛋白H2B/H4等。部分表達(dá)情況見表2.5。
第二篇研究內(nèi)容第一章旋毛蟲和偽旋毛蟲肌幼蟲時(shí)期ESP蛋白質(zhì)組學(xué)分析31E5SKC4BodywallmuscleproteinHR-29體壁肌肉蛋白HR-29T01_2684UP4.13C9DTY314-3-3protein14-3-3蛋白ftt2UP2.70A1BQX7Multicystatin-likedomainprotein多胱抑素樣結(jié)構(gòu)域蛋白mcd-1UP2.54E5S3L5Cystatin-B胱抑素-BTsp_03420UP2.30E5SB85Putativecadherindomainprotein鈣粘蛋白結(jié)構(gòu)域蛋白Tsp_01011DOWN0.48E5S309Calmodulin-1鈣調(diào)素1Tsp_03217DOWN0.31E5SGG7DeoxyribonucleaseIIfamilyprotein脫氧核糖核酸酶II家族蛋白Tsp_06568DOWN0.28E5S0L5TroponinI2肌鈣蛋白I2Tsp_09119DOWN0.19E5SCP5Putativecadherindomainprotein(Fragment)鈣黏蛋白結(jié)構(gòu)域蛋白(片段)Tsp_01505DOWN0.15E5SEY4DeoxyribonucleaseIIfamilyprotein脫氧核糖核酸酶II家族蛋白Tsp_02302DOWN0.123.3生物信息學(xué)分析3.3.1GO分析對鑒定到的差異蛋白進(jìn)行GO功能分類注釋,其中分別以“離子結(jié)合”、“胞質(zhì)組成成分”以及“小分子代謝過程”最為顯著。圖2.2GO分類注釋(A)分子功能(B)所處細(xì)胞位置(C)參與的生物過程Fig2.2GeneOntology(A)MolecularFunction(B)CellularComponent(C)BiologicalProcess3.3.2KEGGpathway富集分析結(jié)果表明肌幼蟲時(shí)期T1、T4的差異蛋白主要富集在代謝通路、細(xì)胞進(jìn)程以及生物機(jī)體系統(tǒng)通路,其中硫胺素代謝、鞘糖脂生物合成、苯丙氨酸,酪氨酸和ABC
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]旋毛蟲絲氨酸蛋白酶抑制劑定位及免疫保護(hù)效果評(píng)估[J]. 任博雯,劉琰,劉曉雷,白雪,丁靜,張勝蘭,劉明遠(yuǎn). 中國動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2019(06)
[2]旋毛蟲成蟲排泄分泌物對中性粒細(xì)胞功能的影響[J]. 王靜,丁靜,王春,王學(xué)林,白雪,唐斌,楊勇,王光明,劉明遠(yuǎn). 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(03)
[3]旋毛蟲肌幼蟲ESP與自身免疫性疾病相關(guān)蛋白組分分析[J]. 于莉,李丹,羅婧梅,蘇萌,趙蕾,邴玉艷,方艷輝,程露陽,吳和亮,杜孌英. 中國病原生物學(xué)雜志. 2017(12)
[4]旋毛蟲種屬分布研究進(jìn)展[J]. 張珊珊,張莉,李海龍,李倩. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2016(04)
[5]質(zhì)譜法分析旋毛蟲肌幼蟲排泄分泌蛋白的組分[J]. 羅婧梅,程露陽,關(guān)曉東,李丹,于莉,杜孌英. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2016(01)
[6]寄生蟲半胱氨酸蛋白酶抑制劑的類型及生物學(xué)功能[J]. 張曉艷,林建銀. 國外醫(yī)學(xué)(寄生蟲病分冊). 2005(02)
[7]旋毛蟲編碼新生幼蟲p46 kDa抗原基因重組融合蛋白對小鼠的免疫保護(hù)性研究[J]. 原麗紅,付寶權(quán),劉明遠(yuǎn),張亞蘭,高飛,吳秀萍,李蓮瑞,林本夫,盧強(qiáng),陳啟軍,P.Boireau. 中國人獸共患病雜志. 2005(03)
[8]旋毛蟲新生幼蟲p46000抗原基因的表達(dá)與抗原性分析[J]. 原麗紅,付寶權(quán),劉明遠(yuǎn),高飛,張亞蘭,吳秀萍,林本夫,李蓮瑞,盧強(qiáng),陳啟軍,P.Boireau. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2005(01)
[9]旋毛蟲新生幼蟲p46000抗原基因的克隆及序列分析[J]. 付寶權(quán),吳秀萍,劉明遠(yuǎn),張亞蘭,原麗紅,李蓮瑞,盧強(qiáng),陳啟軍,P.Boireau. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2005(01)
博士論文
[1]旋毛蟲轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究[D]. 劉曉雷.吉林大學(xué) 2012
碩士論文
[1]鹽對慢性腎衰大鼠腎臟磷酸化蛋白質(zhì)組及孤束核RAS的影響[D]. 何漢昌.南方醫(yī)科大學(xué) 2013
本文編號(hào):3290013
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